seq1 = pF1KE1046.tfa, 435 bp
seq2 = pF1KE1046/gi568815581r_7830609.tfa (gi568815581r:7830609_8031829), 201221 bp

>pF1KE1046 435
>gi568815581r:7830609_8031829 (Chr17)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-170  (100254-100324)   100% ->
171-309  (100681-100819)   100% ->
310-435  (101096-101221)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGTCCACAACCTGTACCTGTTTGACCGGAATGGAGTGTGTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGTCCACAACCTGTACCTGTTTGACCGGAATGGAGTGTGTCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACAGCGAATGGCACCGCAAGAAGCAAGCAGGGATTCCCAAGGAGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 CTACAGCGAATGGCACCGCAAGAAGCAAGCAGGGATTCCCAAGGAGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         GAGTATAAGCTGATGTACGGGATGCTCTTCTCTATCCGCTCG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TG...CAGGAGTATAAGCTGATGTACGGGATGCTCTTCTCTATCCGCTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGTCAGCAAGATGTCCCCGCTAGACAT         GAAGGATGGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100296 TTTGTCAGCAAGATGTCCCCGCTAGACATGTA...CAGGAAGGATGGCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTGGCCTTCCAAACTAGCCGTTACAAACTCCATTACTACGAGACGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100693 CCTGGCCTTCCAAACTAGCCGTTACAAACTCCATTACTACGAGACGCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGGATCAAAGTTGTCATGAATACTGACTTGGGCGTGGGACCCATCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100743 CTGGGATCAAAGTTGTCATGAATACTGACTTGGGCGTGGGACCCATCCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATGTGCTGCACCACATCTACAGTGCG         CTGTATGTGGAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100793 GATGTGCTGCACCACATCTACAGTGCGGTC...TAGCTGTATGTGGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGTGGTGAAGAATCCCCTGTGCCCGCTGGGCCAAACTGTGCAAAGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101110 GGTGGTGAAGAATCCCCTGTGCCCGCTGGGCCAAACTGTGCAAAGTGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTTTCGCTCCCGACTGGACTCCTATGTTCGCTCTCTGCCCTTCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101160 TCTTTCGCTCCCGACTGGACTCCTATGTTCGCTCTCTGCCCTTCTTCTCC

    450     .    :
    424 GCCCGGGCTGGC
        ||||||||||||
 101210 GCCCGGGCTGGC