seq1 = pF1KE1025.tfa, 2514 bp
seq2 = pF1KE1025/gi568815590r_100158559.tfa (gi568815590r:100158559_100388174), 229616 bp

>pF1KE1025 2514
>gi568815590r:100158559_100388174 (Chr8)

(complement)

1-674  (100001-100674)   100% ->
675-883  (113014-113222)   100% ->
884-1028  (118162-118306)   100% ->
1029-1191  (119228-119390)   100% ->
1192-1306  (123390-123504)   100% ->
1307-1468  (123980-124141)   100% ->
1469-1682  (126420-126633)   100% ->
1683-1826  (128178-128321)   100% ->
1827-2514  (128929-129616)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAGAACAAGAAATAGGTTTTATCTCTAAATATAATGAAGGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAAGAACAAGAAATAGGTTTTATCTCTAAATATAATGAAGGGCTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTAAACACTGACCCTGTCTCAATTCTAACAAGCATTTTAGACATGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTAAACACTGACCCTGTCTCAATTCTAACAAGCATTTTAGACATGAGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TACATCGGCAAATGGGTTCAGATCGAGATCTTCAGTCCTCTGCTTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TACATCGGCAAATGGGTTCAGATCGAGATCTTCAGTCCTCTGCTTCATCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGAGCTTGCCTTCAGTCAAAAAGGCACCCAAAAAAAGAAGAATTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGAGCTTGCCTTCAGTCAAAAAGGCACCCAAAAAAAGAAGAATTTCAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGCTCCCTGTTTCGGAGGAAAAAAGATAACAAACGTAAATCAAGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGCTCCCTGTTTCGGAGGAAAAAAGATAACAAACGTAAATCAAGGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAAATGGCGGGGTGGATGGAATTGCAAGTATTGAAAGTATACATTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAAATGGCGGGGTGGATGGAATTGCAAGTATTGAAAGTATACATTCTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTGTACTGATAAGAACTCCATTTTCTCTACAAATACCTCTTCTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTGTACTGATAAGAACTCCATTTTCTCTACAAATACCTCTTCTGACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGATTAACTTCCATCAGCAAACAAATTGGAGACTTCATAGAGTGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGATTAACTTCCATCAGCAAACAAATTGGAGACTTCATAGAGTGCCCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTGCCTTTTGCGGCATTCTAAAGACAGATTTCCTGATATAATGACTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTGCCTTTTGCGGCATTCTAAAGACAGATTTCCTGATATAATGACTTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CATCACAGATCTTGTGTGGATTGCTTACGACAATATTTAAGGATAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CATCACAGATCTTGTGTGGATTGCTTACGACAATATTTAAGGATAGAAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCTGAAAGCAGAGTTAATATTAGTTGCCCAGAATGTACTGAACGGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCTGAAAGCAGAGTTAATATTAGTTGCCCAGAATGTACTGAACGGTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATCCCCATGATATTCGCTTGATATTAAGTGATGATGTCTTGATGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATCCCCATGATATTCGCTTGATATTAAGTGATGATGTCTTGATGGAAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TACGAAGAATTTATGCTTAGACGGTGGCTTGTTGCAGATCCTGATTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TACGAAGAATTTATGCTTAGACGGTGGCTTGTTGCAGATCCTGATTGTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTGGTGTCCAGCTCCAGACTGTGG         ATATGCTGTGATAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100651 GTGGTGTCCAGCTCCAGACTGTGGGTA...AAGATATGCTGTGATAGCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTGGATGTGCCAGCTGTCCAAAATTAACTTGTGGGCGAGAGGGCTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113031 TTGGATGTGCCAGCTGTCCAAAATTAACTTGTGGGCGAGAGGGCTGTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ACAGAGTTTTGCTACCACTGTAAACAGATTTGGCACCCCAACCAGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113081 ACAGAGTTTTGCTACCACTGTAAACAGATTTGGCACCCCAACCAGACCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGATGCTGCTCGACAAGAGAGAGCCCAGAGCTTACGTTTGAGAACTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113131 TGATGCTGCTCGACAAGAGAGAGCCCAGAGCTTACGTTTGAGAACTATAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GTTCTTCATCCATTAGTTATAGTCAAGAGTCTGGAGCAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 113181 GTTCTTCATCCATTAGTTATAGTCAAGAGTCTGGAGCAGCAGGTA...TA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    884  CTGATGATATAAAGCCATGTCCACGATGTGCTGCTTATATAATAAAGAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118161 GCTGATGATATAAAGCCATGTCCACGATGTGCTGCTTATATAATAAAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GAATGATGGGAGCTGCAATCACATGACATGTGCTGTTTGTGGTTGTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118211 GAATGATGGGAGCTGCAATCACATGACATGTGCTGTTTGTGGTTGTGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TTTGTTGGTTGTGTATGAAAGAAATCTCAGATTTGCATTATCTAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 118261 TTTGTTGGTTGTGTATGAAAGAAATCTCAGATTTGCATTATCTAAGGTA.

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029      TCCATCAGGATGTACTTTTTGGGGGAAGAAACCCTGGAGCCGAAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118311 ..TAGTCCATCAGGATGTACTTTTTGGGGGAAGAAACCCTGGAGCCGAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GAAGAAAATATTGTGGCAACTGGGAACACTGGTTGGTGCTCCTGTCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119273 GAAGAAAATATTGTGGCAACTGGGAACACTGGTTGGTGCTCCTGTCGGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TCGCTTTAATAGCTGGCATTGCTATTCCTGCAATGATTATTGGCATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119323 TCGCTTTAATAGCTGGCATTGCTATTCCTGCAATGATTATTGGCATTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GTGTATGTGGGCCGCAAG         ATTCACAATCGCTATGAAGGCAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 119373 GTGTATGTGGGCCGCAAGGTA...AAGATTCACAATCGCTATGAAGGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGATGTTTCAAAGCACAAACGGAATTTGGCCATAGCAGGTGGTGTAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123413 GGATGTTTCAAAGCACAAACGGAATTTGGCCATAGCAGGTGGTGTAACGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TGTCTGTAATCGTGTCTCCAGTAGTAGCTGCAGTGACTGTAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 123463 TGTCTGTAATCGTGTCTCCAGTAGTAGCTGCAGTGACTGTAGGTA...TA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1307  GTATCGGTGTTCCTATTATGTTAGCTTATGTCTATGGCGTAGTTCCAAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123979 GGTATCGGTGTTCCTATTATGTTAGCTTATGTCTATGGCGTAGTTCCAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 TTCTCTTTGTCGAAGCGGAGGTTGTGGAGTCTCAGCAGGCAATGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124029 TTCTCTTTGTCGAAGCGGAGGTTGTGGAGTCTCAGCAGGCAATGGAAAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GAGTTAGGATTGAATTTGATGATGAAAATGATATAAATGTTGGTGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124079 GAGTTAGGATTGAATTTGATGATGAAAATGATATAAATGTTGGTGGAACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 AACACAGCTGTAG         ACACAACATCAGTAGCAGAAGCAAGACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 124129 AACACAGCTGTAGGTA...TAGACACAACATCAGTAGCAGAAGCAAGACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CAACCCAAGCATAGGGGAGGGAAGTGTTGGTGGGCTGACTGGCAGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126448 CAACCCAAGCATAGGGGAGGGAAGTGTTGGTGGGCTGACTGGCAGTTTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 GTGCAAGTGGAAGCCACATGGATCGAATAGGAGCCATCCGAGACAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126498 GTGCAAGTGGAAGCCACATGGATCGAATAGGAGCCATCCGAGACAACCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 AGTGAAACGGCCAGCACCATGGCACTAGCTGGAGCCAGTATAACGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126548 AGTGAAACGGCCAGCACCATGGCACTAGCTGGAGCCAGTATAACGGGGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 TCTGTCAGGAAGTGCCATGGTAAACTGTTTTAACAG         GTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 126598 TCTGTCAGGAAGTGCCATGGTAAACTGTTTTAACAGGTG...AAGGTTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AAGTACAAGCAGATGTACAGAAAGAACGGTACAGTCTAAGTGGAGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128183 AAGTACAAGCAGATGTACAGAAAGAACGGTACAGTCTAAGTGGAGAATCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GGCACAGTCAGCTTGGGAACAGTTAGTGATAATGCCAGCACCAAAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128233 GGCACAGTCAGCTTGGGAACAGTTAGTGATAATGCCAGCACCAAAGCAAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 GGCAGGATCCATTCTGAATTCCTACATCCCATTGGACAA         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 128283 GGCAGGATCCATTCTGAATTCCTACATCCCATTGGACAAGTA...CAGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 AAGGCAACAGTATGGAGGTGCAAGTAGATATTGAGTCAAAGCCATCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128931 AAGGCAACAGTATGGAGGTGCAAGTAGATATTGAGTCAAAGCCATCCAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 TTCAGGCACAACAGTGGAAGCAGTAGTGTGGATGATGGCAGTGCCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128981 TTCAGGCACAACAGTGGAAGCAGTAGTGTGGATGATGGCAGTGCCACCCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 AAGTCATGCTGGCGGTTCATCCAGTGGCTTGCCTGAAGGTAAATCTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129031 AAGTCATGCTGGCGGTTCATCCAGTGGCTTGCCTGAAGGTAAATCTAGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 CCACCAAGTGGTCCAAAGAAGCAACAGCAGGGAAAAAATCAAAAAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129081 CCACCAAGTGGTCCAAAGAAGCAACAGCAGGGAAAAAATCAAAAAGTGGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 AAACTGAGGAAAAAGGGTAACATGAAGATAAATGAGACGAGAGAGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129131 AAACTGAGGAAAAAGGGTAACATGAAGATAAATGAGACGAGAGAGGACAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 GGATGCACAGTTGTTAGAACAACAAAGCACGAACTCAAGTGAATTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129181 GGATGCACAGTTGTTAGAACAACAAAGCACGAACTCAAGTGAATTTGAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 CTCCATCCCTCAGTGACAGTATGCCTTCTGTAGCAGATTCTCACTCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129231 CTCCATCCCTCAGTGACAGTATGCCTTCTGTAGCAGATTCTCACTCTAGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 CATTTTTCTGAATTTAGTTGTTCTGACCTAGAAAGCATGAAAACTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129281 CATTTTTCTGAATTTAGTTGTTCTGACCTAGAAAGCATGAAAACTTCTTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 TAGTCATGGTTCCAGTGATTATCACACCCGCTTTGCTACTGTTAACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129331 TAGTCATGGTTCCAGTGATTATCACACCCGCTTTGCTACTGTTAACATTC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 TTCCTGAGGTAGAAAATGACCGTCTGGAAAATTCCCCACATCAGTGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129381 TTCCTGAGGTAGAAAATGACCGTCTGGAAAATTCCCCACATCAGTGTAGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 ATTTCTGTGGTTACCCAAACTGCTTCCTGTTCAGAAGTTTCACAGTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129431 ATTTCTGTGGTTACCCAAACTGCTTCCTGTTCAGAAGTTTCACAGTTGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 TCATATTGCTGAAGAACATGGTAACAATGGAATAAAACCTAATGTTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129481 TCATATTGCTGAAGAACATGGTAACAATGGAATAAAACCTAATGTTGATT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 TATATTTTGGCGATGCACTAAAAGAAACAAATAACAACCACTCACATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129531 TATATTTTGGCGATGCACTAAAAGAAACAAATAACAACCACTCACATCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .
   2479 ACAATGGAATTAAAAGTTGCAATTCAGACTGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129581 ACAATGGAATTAAAAGTTGCAATTCAGACTGAAATT