seq1 = pF1KE1024.tfa, 2424 bp
seq2 = pF1KE1024/gi568815582r_30257947.tfa (gi568815582r:30257947_30470086), 212140 bp

>pF1KE1024 2424
>gi568815582r:30257947_30470086 (Chr16)

(complement)

1-956  (99904-100859)   99% ->
957-1056  (104493-104592)   100% ->
1057-1164  (104875-104982)   100% ->
1165-1271  (105081-105187)   100% ->
1272-1386  (110246-110360)   100% ->
1387-1452  (110484-110549)   100% ->
1453-1642  (110726-110915)   100% ->
1643-1797  (111270-111424)   100% ->
1798-2424  (111514-112140)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACGGGCACGGCGCCCCTGGTGGCCCCGCCGCGCCGTCATGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99904 ATGGAGACGGGCACGGCGCCCCTGGTGGCCCCGCCGCGCCGTCATGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGCGGCCCCCTCGCCGCCGCCCCGGGGTTCCCGGGCCGGGCCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99954 CCCCGCGGCCCCCTCGCCGCCGCCCCGGGGTTCCCGGGCCGGGCCCGTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGGTGGCTCCGGGACCTCCAGTGACTACGGCCACTTCGGCCCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100004 TGGTGGTGGCTCCGGGACCTCCAGTGACTACGGCCACTTCGGCCCCCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCCTGGTGGCCCCCGGGGAGGCGCGGCCCGCCTGGGTCCCGGGGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100054 ACCCTGGTGGCCCCCGGGGAGGCGCGGCCCGCCTGGGTCCCGGGGTCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGAGACCTCTGCTCCGGCCCCGGCCCCAGCCCCGGCCCCAGCCCCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100104 CGAGACCTCTGCTCCGGCCCCGGCCCCAGCCCCGGCCCCAGCCCCGGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCACGGGCAGCACGGTGGTGGTGCTGACCCTGGAGGCCTCGCCCGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100154 TCACGGGCAGCACGGTGGTGGTGCTGACCCTGGAGGCCTCGCCCGAAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCAAAGCCGCAGCTCCCCTCCGGCCCGGAATCCCCAGAGCCCGCGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100204 CCAAAGCCGCAGCTCCCCTCCGGCCCGGAATCCCCAGAGCCCGCGGCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCTGGAGTTGAGACATCGAGGGCTCTGGCCGCAGGGGCAGACTCGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100254 GGCTGGAGTTGAGACATCGAGGGCTCTGGCCGCAGGGGCAGACTCGCCGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGACAGAGGAGGCTCGACCCTCACCCGCCCCAGGACCAGGGACCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100304 AGACAGAGGAGGCTCGACCCTCACCCGCCCCAGGACCAGGGACCCCCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGACCCCTACCAGGACCCCTTCCAGAACGGCTCCTGGTGCCCTGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100354 GGGACCCCTACCAGGACCCCTTCCAGAACGGCTCCTGGTGCCCTGACCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAAACCCCCGCTTGCCCCCAAGCCGGGAACCACAGTGGCCTCAGGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100404 CAAACCCCCGCTTGCCCCCAAGCCGGGAACCACAGTGGCCTCAGGAGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGCACGGAGTGCATCAGGACAAGTGACAGGTGGGCATGGAGCTGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100454 CTGCACGGAGTGCATCAGGACAAGTGACAGGTGGGCATGGAGCTGCCGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCAACATCAGCATCAGCAGGACAGGCTCCTGACGACCCCTCAGGCCCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100504 GCAACATCAGCATCAGCAGGACAGGCTCCTGAGGACCCCTCAGGCCCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACAGGCCCCTCTGGGACTTGTGAGGCTCCGGTAGCTGTCGTGACCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100554 CACAGGCCCCTCTGGGACTTGTGAGGCTCCGGTAGCTGTCGTGACCGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCCAGCTCCGGAGCCTGCTGAAAACTCTCAAGACCTGGGCTCCACGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100604 CCCCAGCTCCGGAGCCTGCTGAAAACTCTCAAGACCTGGGCTCCACGTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGCCTGGGACCTGGCATCTCTGGGCCTCGAGGGCAGGCCCCGGACACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100654 AGCCTGGGACCTGGCATCTCTGGGCCTCGAGGGCAGGCCCCGGACACGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAGTTACTTGGACTCCGTGAGCCTCATGTCTGGGACCTTGGAGTCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100704 GAGTTACTTGGACTCCGTGAGCCTCATGTCTGGGACCTTGGAGTCCTTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGGATGATGTGAGCTCCATGGGCTCAGATTCAGAGATAAACGGGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100754 CGGATGATGTGAGCTCCATGGGCTCAGATTCAGAGATAAACGGGCTGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGCGCAAGACGGACAAGTATGGCTTCCTTGGGGGCAGCCAGTACTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100804 CTGCGCAAGACGGACAAGTATGGCTTCCTTGGGGGCAGCCAGTACTCGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAGCCT         AGAGAGCTCCATTCCCGTGGACGTGGCTCGGCAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100854 CAGCCTGTG...CAGAGAGAGCTCCATTCCCGTGGACGTGGCTCGGCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GGGAGCTCAAATGGCTGGACATGTTCAGTAACTGGGATAAGTGGCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104528 GGGAGCTCAAATGGCTGGACATGTTCAGTAACTGGGATAAGTGGCTGTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CGGCGATTCCAGAAG         GTGAAGCTGCGCTGCCGGAAGGGGAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104578 CGGCGATTCCAGAAGGTT...TAGGTGAAGCTGCGCTGCCGGAAGGGGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CCCCTCCTCTCTCAGAGCCAAAGCCTGGCAGTACCTGTCTAATAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104901 CCCCTCCTCTCTCAGAGCCAAAGCCTGGCAGTACCTGTCTAATAGCAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AACTTCTGGAGCAGAACCCAGGAAAGTTTGAG         GAGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104951 AACTTCTGGAGCAGAACCCAGGAAAGTTTGAGGTG...CAGGAGCTGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CGGGCTCCTGGGGACCCCAAGTGGCTGGATGTGATTGAGAAGGACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105090 CGGGCTCCTGGGGACCCCAAGTGGCTGGATGTGATTGAGAAGGACCTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CCGCCAGTTCCCTTTCCACGAGATGTTTGCTGCTCGAGGGGGGCATGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105140 CCGCCAGTTCCCTTTCCACGAGATGTTTGCTGCTCGAGGGGGGCATGGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1272        GCAACAGGACCTGTACCGAATCCTGAAGGCCTACACCATCTAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105190 A...CAGGCAACAGGACCTGTACCGAATCCTGAAGGCCTACACCATCTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CGGCCTGACGAGGGTTACTGCCAGGCCCAGGCCCCCGTGGCTGCGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110289 CGGCCTGACGAGGGTTACTGCCAGGCCCAGGCCCCCGTGGCTGCGGTCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GCTCATGCACATGCCTGCGGAG         CAAGCCTTTTGGTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110339 GCTCATGCACATGCCTGCGGAGGTC...CAGCAAGCCTTTTGGTGCCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TGCAGATCTGCGACAAGTACCTCCCAGGTTACTACAGTGCAGGGCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 110503 TGCAGATCTGCGACAAGTACCTCCCAGGTTACTACAGTGCAGGGCTGGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1453       GAGGCCATTCAGCTGGACGGGGAGATCTTTTTTGCACTCCTGCG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110553 ...CAGGAGGCCATTCAGCTGGACGGGGAGATCTTTTTTGCACTCCTGCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CCGGGCCTCCCCGCTGGCGCATCGCCACCTGCGGCGGCAGCGCATTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110770 CCGGGCCTCCCCGCTGGCGCATCGCCACCTGCGGCGGCAGCGCATTGACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CTGTGCTCTACATGACGGAGTGGTTCATGTGCATCTTCGCCCGCACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110820 CTGTGCTCTACATGACGGAGTGGTTCATGTGCATCTTCGCCCGCACCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CCCTGGGCGTCGGTGCTGCGTGTCTGGGACATGTTTTTCTGTGAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 110870 CCCTGGGCGTCGGTGCTGCGTGTCTGGGACATGTTTTTCTGTGAAGGTA.

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643      GCGTTAAGATCATCTTCCGGGTGGCCCTGGTCCTGCTGCGCCACA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110920 ..CAGGCGTTAAGATCATCTTCCGGGTGGCCCTGGTCCTGCTGCGCCACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CGCTGGGCTCAGTGGAGAAGCTGCGCTCCTGCCAAGGCATGTATGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111315 CGCTGGGCTCAGTGGAGAAGCTGCGCTCCTGCCAAGGCATGTATGAGACC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 ATGGAGCAGCTGCGTAACCTGCCCCAGCAGTGCATGCAGGAAGACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111365 ATGGAGCAGCTGCGTAACCTGCCCCAGCAGTGCATGCAGGAAGACTTCCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 GGTGCATGAG         GTGACCAATCTGCCGGTGACAGAAGCACTGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111415 GGTGCATGAGGTA...CAGGTGACCAATCTGCCGGTGACAGAAGCACTGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 TTGAGCGGGAGAATGCAGCCCAGCTCAAGAAGTGGCGGGAAACGCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111545 TTGAGCGGGAGAATGCAGCCCAGCTCAAGAAGTGGCGGGAAACGCGGGGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GAGCTGCAGTATCGGCCCTCACGGCGACTGCATGGGTCCCGGGCCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111595 GAGCTGCAGTATCGGCCCTCACGGCGACTGCATGGGTCCCGGGCCATCCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 CGAGGAGCGCCGGCGGCAACAGCCACCCCTGGGCCCCTCCTCCAGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111645 CGAGGAGCGCCGGCGGCAACAGCCACCCCTGGGCCCCTCCTCCAGCCTCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 TCAGCCTCCCTGGCCTCAAGAGCCGAGGCTCCCGGGCAGCTGGAGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111695 TCAGCCTCCCTGGCCTCAAGAGCCGAGGCTCCCGGGCAGCTGGAGGGGCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 CCGTCCCCGCCGCCCCCCGTCCGCAGAGCCAGTGCTGGGCCTGCCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111745 CCGTCCCCGCCGCCCCCCGTCCGCAGAGCCAGTGCTGGGCCTGCCCCAGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 GCCTGTGGTCACTGCTGAGGGACTGCATCCATCCCTTCCCTCACCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111795 GCCTGTGGTCACTGCTGAGGGACTGCATCCATCCCTTCCCTCACCCACTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 GCAATAGCACCCCCTTGGGTTCCAGCAAGGAGACCCGGAAGCAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111845 GCAATAGCACCCCCTTGGGTTCCAGCAAGGAGACCCGGAAGCAGGAGAAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 GAGCGGCAGAAACAGGAGAAGGAGCGGCAGAAACAGGAGAAGGAGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111895 GAGCGGCAGAAACAGGAGAAGGAGCGGCAGAAACAGGAGAAGGAGCGGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 GAAGGAGCGGCAGAAGCAGGAGAAAGAGCGAGAGAAGCAGGAAAAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111945 GAAGGAGCGGCAGAAGCAGGAGAAAGAGCGAGAGAAGCAGGAAAAGGAGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 GAGAGAAGCAGGAGAAGGAGCGGCAGAAGCAGGAGAAGAAGGCTCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111995 GAGAGAAGCAGGAGAAGGAGCGGCAGAAGCAGGAGAAGAAGGCTCAAGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 CGGAAGCTTTCGCTGCGTCGAAAGGCAGATGGGCCCCCAGGCCCCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112045 CGGAAGCTTTCGCTGCGTCGAAAGGCAGATGGGCCCCCAGGCCCCCATGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2379 TGGTGGGGACAGGCCCTCAGCCGAGGCCCGGCAGGACGCTTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112095 TGGTGGGGACAGGCCCTCAGCCGAGGCCCGGCAGGACGCTTACTTC