seq1 = pF1KE1018.tfa, 1917 bp
seq2 = pF1KE1018/gi568815575r_47876170.tfa (gi568815575r:47876170_48083408), 207239 bp

>pF1KE1018 1917
>gi568815575r:47876170_48083408 (ChrX)

(complement)

1-72  (94814-94885)   100% ->
73-199  (99998-100124)   100% ->
200-289  (100371-100460)   100% ->
290-1917  (105612-107239)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACACCAGCATCTGCATCTGGTGAGGACTCAGGAAGCTTCTACTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  94814 ATGACACCAGCATCTGCATCTGGTGAGGACTCAGGAAGCTTCTACTCATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGAAGGCAAAGAGGGAACAG         GGGCTAGTGACATTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
  94864 GCAGAAGGCAAAGAGGGAACAGGTA...CAGGGGCTAGTGACATTTGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGTAGCTGTGGATTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGTACCTGAACCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100017 ATGTAGCTGTGGATTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGTACCTGAACCCACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGAGGACCCTGTACAGAGACGTGATGCTGGAGACCTACAGCAACTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100067 CAGAGGACCCTGTACAGAGACGTGATGCTGGAGACCTACAGCAACTTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTTGTGG         GGCAGCAGGTTACCAAACCAAACCTCATCCTCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100117 CTTTGTGGGTA...CAGGGCAGCAGGTTACCAAACCAAACCTCATCCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTTGGAGGTAGAAGAATGCCCGGCAGAAGGAAAAATCCCATTTTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100404 AGTTGGAGGTAGAAGAATGCCCGGCAGAAGGAAAAATCCCATTTTGGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTCCAG         AAGTCTGTCAAGTTGATGAACAGATTGAGAGGCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100454 TTTCCAGGTA...TAGAAGTCTGTCAAGTTGATGAACAGATTGAGAGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACATCAGGATGACCAAGATAAATGTCTGCTGATGCAAGTTGGATTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105646 ACATCAGGATGACCAAGATAAATGTCTGCTGATGCAAGTTGGATTTTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAAGAAAACAATTATCACCAAGAGTGCTCGTGACTGTCATGAGTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105696 ACAAGAAAACAATTATCACCAAGAGTGCTCGTGACTGTCATGAGTTTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACATACTTCATCTGAGTACAAACCTTGTTGCTTCAATACAAAGACCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105746 AACATACTTCATCTGAGTACAAACCTTGTTGCTTCAATACAAAGACCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAAACACGAATCATTTGGAAATAATATGGTAGATAATTTAGACTTATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105796 TAAACACGAATCATTTGGAAATAATATGGTAGATAATTTAGACTTATTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTAGAAGTTCTGCAGAAAATAAATATGATAATGGATGTGCAAAATTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105846 GTAGAAGTTCTGCAGAAAATAAATATGATAATGGATGTGCAAAATTGTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTCCATACTGAGTATGAGAAAACAAATCCTGGAATGAAGCCCTATGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105896 TTCCATACTGAGTATGAGAAAACAAATCCTGGAATGAAGCCCTATGGCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TAAAGAGTGTGGGAAAGGTCTTAGGCGAAAGAAAGGCCTTAGTCTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105946 TAAAGAGTGTGGGAAAGGTCTTAGGCGAAAGAAAGGCCTTAGTCTACATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGAGAATTAAAAATGGAGAGAAACCCTTTGAATGTACTGCATGTAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105996 AGAGAATTAAAAATGGAGAGAAACCCTTTGAATGTACTGCATGTAGGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCTTCAGCAAGAAGTCACACCTCATTGTACATTGGAGAACTCATACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106046 ACCTTCAGCAAGAAGTCACACCTCATTGTACATTGGAGAACTCATACGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGAGAAACCTTTTGGATGTACCGAATGTGGAAAAGCTTTTAGCCAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106096 AGAGAAACCTTTTGGATGTACCGAATGTGGAAAAGCTTTTAGCCAAAAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CTCAGCTCATTATACACTTGCGAACTCATACAGGAGAGAGACCCTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106146 CTCAGCTCATTATACACTTGCGAACTCATACAGGAGAGAGACCCTTTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TGTCCTGAATGTGGAAAAGCCTTCAGAGAAAAGTCAACTGTCATCATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106196 TGTCCTGAATGTGGAAAAGCCTTCAGAGAAAAGTCAACTGTCATCATACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TTACAGGACTCACACAGGAGAAAAACCTTATGAATGTAATGAATGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106246 TTACAGGACTCACACAGGAGAAAAACCTTATGAATGTAATGAATGTGGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AAGCCTTCACTCAGAAGTCCAACCTCATTGTCCATCAGAAAACCCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106296 AAGCCTTCACTCAGAAGTCCAACCTCATTGTCCATCAGAAAACCCACACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGAGAGAAAACCTATGAATGCACTAAATGTGGAGAATCTTTCATACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106346 GGAGAGAAAACCTATGAATGCACTAAATGTGGAGAATCTTTCATACAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GCTTGATCTAATTATACATCATAGTACCCATACAGGAAAGAAACCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106396 GCTTGATCTAATTATACATCATAGTACCCATACAGGAAAGAAACCCCATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AATGTAATGAGTGTAAGAAAACTTTCAGTGATAAGTCAACTCTCATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106446 AATGTAATGAGTGTAAGAAAACTTTCAGTGATAAGTCAACTCTCATTATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CACCAGAGAACTCATACGGGAGAGAAACCTCATAAATGTACTGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106496 CACCAGAGAACTCATACGGGAGAGAAACCTCATAAATGTACTGAATGTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GAAGTCTTTCAATGAGAAGTCAACCCTCATTGTGCATCAAAGAACTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106546 GAAGTCTTTCAATGAGAAGTCAACCCTCATTGTGCATCAAAGAACTCATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CAGGAGAGAAACCCTATGAATGTGATGTGTGTGGAAAAACCTTCACGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106596 CAGGAGAGAAACCCTATGAATGTGATGTGTGTGGAAAAACCTTCACGCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 AAGTCAAACCTTGGTGTACATCAGAGAACTCATTCAGGAGAGAAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106646 AAGTCAAACCTTGGTGTACATCAGAGAACTCATTCAGGAGAGAAACCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TGAATGTAATGAATGTGAGAAAGCCTTCTCTCAGAAGTCCTACCTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106696 TGAATGTAATGAATGTGAGAAAGCCTTCTCTCAGAAGTCCTACCTCATGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TGCATCAGAGAGGTCATACAGGAGAGAAACCTTACGAGTGCAATGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106746 TGCATCAGAGAGGTCATACAGGAGAGAAACCTTACGAGTGCAATGAATGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GAAAAAGCATTTTCACAGAAATCATATCTCATTATACATCAAAGAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106796 GAAAAAGCATTTTCACAGAAATCATATCTCATTATACATCAAAGAACTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 TACAGAAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGCAAAGCCTTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106846 TACAGAAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGCAAAGCCTTCAGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 AAAAGTCAAAGCTCATTATACATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106896 AAAAGTCAAAGCTCATTATACATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 TATGAATGTCCTGTGTGTTGGAAAGCTTTTAGCCAGAAGTCACAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106946 TATGAATGTCCTGTGTGTTGGAAAGCTTTTAGCCAGAAGTCACAGCTCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 AATACATCAGAGAACGCACACGGGAGAGAAACCCTATGCATGCACTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106996 AATACATCAGAGAACGCACACGGGAGAGAAACCCTATGCATGCACTGAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 GTGGCAAAGCCTTCCGAGAAAAGTCAACATTCACTGTACATCAAAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107046 GTGGCAAAGCCTTCCGAGAAAAGTCAACATTCACTGTACATCAAAGAACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 CATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTACAGAATGTGGGAAAGCCTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107096 CATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTACAGAATGTGGGAAAGCCTTTAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CCAAAAATCAAACCTTATTGTACATCAGCGAACCCATGCAGGAAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107146 CCAAAAATCAAACCTTATTGTACATCAGCGAACCCATGCAGGAAAGAAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 CCCATGGAAGAGGCCACACTCGGAAGTCAAAGTTCATGGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107196 CCCATGGAAGAGGCCACACTCGGAAGTCAAAGTTCATGGCACAT