seq1 = pF1KE1013.tfa, 855 bp
seq2 = pF1KE1013/gi568815581r_29515735.tfa (gi568815581r:29515735_29717175), 201441 bp

>pF1KE1013 855
>gi568815581r:29515735_29717175 (Chr17)

(complement)

1-300  (99939-100238)   100% ->
301-446  (100329-100474)   100% ->
447-504  (100840-100897)   100% ->
505-735  (101001-101231)   100% ->
736-855  (101322-101441)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCAGGGGAGGAGGAGCTATGTGCGCAGGGGAGGAGGAGAGATGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99939 ATGTGCAGGGGAGGAGGAGCTATGTGCGCAGGGGAGGAGGAGAGATGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGGGAGGGGCCTGCAACTCTGGTCACTAGAGGTTTGGGGCATAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99989 CCAGGGGAGGGGCCTGCAACTCTGGTCACTAGAGGTTTGGGGCATAGGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGGGAAGGCCAGGAAGCGTAAAGGGGCTTCTGGGGGTCCCGAAGTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100039 TTGGGAAGGCCAGGAAGCGTAAAGGGGCTTCTGGGGGTCCCGAAGTAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGGAGGGTGGGGCAGGGCTGGTCACGCCTCCTGTGCTCGGGCAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100089 CGGGAGGGTGGGGCAGGGCTGGTCACGCCTCCTGTGCTCGGGCAGAACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCGAGGAGCCAGTGGCACTGCAGGAGATGGACACAAGCAACGGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100139 CTTCGAGGAGCCAGTGGCACTGCAGGAGATGGACACAAGCAACGGGGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TATTGCCCTTTTACGATCCCGACTCCAGCATCGTCTACCTGTGTGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100189 TATTGCCCTTTTACGATCCCGACTCCAGCATCGTCTACCTGTGTGGCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301          GGCGACAGCAGCATTCGGTACTTTGAGATTACCGACGAGCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100239 GTG...CAGGGCGACAGCAGCATTCGGTACTTTGAGATTACCGACGAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCCTTTCGTGCACTACCTGAACACGTTCAGCAGCAAAGAGCCGCAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100370 GCCTTTCGTGCACTACCTGAACACGTTCAGCAGCAAAGAGCCGCAGCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCATGGGTTTCATGCCCAAAAGGGGACTGGATGTCAGCAAGTGTGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100420 GCATGGGTTTCATGCCCAAAAGGGGACTGGATGTCAGCAAGTGTGAGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCCG         GTTCTACAAGCTACACGAAAGAAAGTGTGAACCTAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100470 GCCCGGTC...TAGGTTCTACAAGCTACACGAAAGAAAGTGTGAACCTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATCATGACTGTGCCCCGCAAG         TCAGACCTCTTCCAGGACG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100876 CATCATGACTGTGCCCCGCAAGGTG...CAGTCAGACCTCTTCCAGGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCTGTACCCGGATACGCCAGGCCCGGAGCCGGCCCTAGAAGCGGACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101020 ATCTGTACCCGGATACGCCAGGCCCGGAGCCGGCCCTAGAAGCGGACGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGGCTATCCGGCCAGGACGCCGAACCCGTGCTCATTTCGCTGAGGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101070 TGGCTATCCGGCCAGGACGCCGAACCCGTGCTCATTTCGCTGAGGGACGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTATGTGCCCCCCAAGCACCGCGAGCTCCGGGTCACGAAGCGCAACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101120 CTATGTGCCCCCCAAGCACCGCGAGCTCCGGGTCACGAAGCGCAACATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGGACGTGCGCCCGCCCTCCGGCCCCCGCCGCAGCCAGTCGGCCAGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101170 TGGACGTGCGCCCGCCCTCCGGCCCCCGCCGCAGCCAGTCGGCCAGCGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCCCCCTTGTCG         CAGCACACCCTGGAGACGCTGCTGGAAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101220 GCCCCCTTGTCGGTA...CAGCAGCACACCCTGGAGACGCTGCTGGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GATCAAGGCCCTCCGCGAGCGGGTGCAGGCCCAGGAGCAGCGCATCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GATCAAGGCCCTCCGCGAGCGGGTGCAGGCCCAGGAGCAGCGCATCACGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTCTGGAGAACATGCTGTGCGAGCTGGTGGACGGCACGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CTCTGGAGAACATGCTGTGCGAGCTGGTGGACGGCACGGAC