seq1 = pF1KE1010.tfa, 672 bp
seq2 = pF1KE1010/gi568815575f_73463285.tfa (gi568815575f:73463285_73781002), 317718 bp

>pF1KE1010 672
>gi568815575f:73463285_73781002 (ChrX)

1-296  (100001-100296)   100% ->
297-351  (114123-114177)   100% ->
352-507  (121133-121288)   100% ->
508-564  (216042-216098)   100% ->
565-624  (216370-216429)   100% ->
625-672  (217671-217718)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCATCCTGCTGCCCAACATGGCGGAGTTCGACACCATCTCGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCATCCTGCTGCCCAACATGGCGGAGTTCGACACCATCTCGGAACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGCAACGTCGTCGTCGTCGCCGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGCAACGTCGTCGTCGTCGCCGTCGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTCGTCGTCGGTATCTGGGCCCGACGATGACGAGGAGGATGAGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTCGTCGTCGGTATCTGGGCCCGACGATGACGAGGAGGATGAGGAGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAGCGCCGCCCCCGCCTCGGGTAGTGAGCGAGGAGCATCTGCGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAAGCGCCGCCCCCGCCTCGGGTAGTGAGCGAGGAGCATCTGCGGAGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGCTCCCGACCCTGTATTAGTGCGGGGTGCCGGCCACATCACTGT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100251 ATGCTCCCGACCCTGTATTAGTGCGGGGTGCCGGCCACATCACTGTGTA.

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    297      GTTTGGCTTGAGCAACAAGTTTGATACTGAATTTCCCTCCGTTCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ..AAGGTTTGGCTTGAGCAACAAGTTTGATACTGAATTTCCCTCCGTTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AACAGGGAAG         GTGGCCCCAGAAGAATTTAAAACCAGCATTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 114168 AACAGGGAAGGTA...TAGGTGGCCCCAGAAGAATTTAAAACCAGCATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCCGTGTGAATGCATGTTTGAAAAAGGCTCTCCCGGTCAATGTGAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121164 GCCGTGTGAATGCATGTTTGAAAAAGGCTCTCCCGGTCAATGTGAAATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGCTGTGTGGTTGTCTCTGCTGCTGTTGCACACTGGGTTGCAGCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121214 CTGCTGTGTGGTTGTCTCTGCTGCTGTTGCACACTGGGTTGCAGCCTATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCCTGTTATTTGTCTCAACAAAAGA         ACCAGAAGATCAATTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 121264 GCCTGTTATTTGTCTCAACAAAAGAGTG...TAGACCAGAAGATCAATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAAGTTAATAGAATGGGAAAATAACAGATTATATCACAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 216058 AGAAGTTAATAGAATGGGAAAATAACAGATTATATCACAAGGTA...TAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTTGCTTTGCACTGGAAGTTGACTAAGAGGAAATGTGAAACTAGCAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216370 CTTGCTTTGCACTGGAAGTTGACTAAGAGGAAATGTGAAACTAGCAATAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATGGAGTAT         GTAATACTAATAGAATTCTTACCAAAATATC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 216420 GATGGAGTATGTA...CAGGTAATACTAATAGAATTCTTACCAAAATATC

    700     .    :    .
    656 CCATATTCCGACCTGAC
        |||||||||||||||||
 217702 CCATATTCCGACCTGAC