seq1 = pF1KE1005.tfa, 558 bp
seq2 = pF1KE1005/gi568815579r_10210489.tfa (gi568815579r:10210489_10416005), 205517 bp

>pF1KE1005 558
>gi568815579r:10210489_10416005 (Chr19)

(complement)

1-154  (100001-100154)   99% ->
155-209  (100247-100301)   98% ->
210-316  (100514-100620)   100% ->
317-404  (105066-105153)   100% ->
405-558  (105364-105517)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATGTCATGGCCGCCTCCATGGCCCGGGGAGGCGTGAGTGCCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATGTCATGGCCGCCTCCATGGCCCGGGGAGGCGTGAGTGCCAGGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGCTGCAGGCTGCCAGGGGCACCTGGTGGAACAGACCTGGGGGCACTT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTACTGCAGGCTGCCAGGGGCACCTGGTGGAACAGACCTGGGGGCACTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGGTCGGGGGAGGGGGTGGCGCTGGGGACAACCAGAAAGTTTCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGGTCGGGGGAGGGGGTGGCGCTGGGGACAACCAGAAAGTTTCAAGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACAG         GCTCGCGCCCGGCGGGAGAGGAGGACGCGGGCGGCCC
        ||||>>>...>>>||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100151 ACAGGTA...CAGGCTCGCGCCCGGCTGGAGAGGAGGACGCGGGCGGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGCGGCCCGGGGACGT         GGTGAACGTGGTGTTCGTAGACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100284 GGAGCGGCCCGGGGACGTGTG...CAGGGTGAACGTGGTGTTCGTAGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCTCAGGCCAGCGGATCCCAGTGAGTGGCAGAGTCGGGGACAATGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100537 GCTCAGGCCAGCGGATCCCAGTGAGTGGCAGAGTCGGGGACAATGTTCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CACCTGGCCCAGCGCCACGGGGTGGACCTGGAAG         GGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100587 CACCTGGCCCAGCGCCACGGGGTGGACCTGGAAGGTA...TAGGGGCCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAAGCCTCCCTGGCCTGCTCCACCTGCCATGTGTATGTGAGTGAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105073 TGAAGCCTCCCTGGCCTGCTCCACCTGCCATGTGTATGTGAGTGAAGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACCTGGATCTCCTGCCTCCTCCCGAGGAGAG         GGAAGACGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 105123 ACCTGGATCTCCTGCCTCCTCCCGAGGAGAGGTG...TAGGGAAGACGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATGCTAGACATGGCCCCCCTCCTCCAGGAGAACTCGCGGCTGGGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105374 ATGCTAGACATGGCCCCCCTCCTCCAGGAGAACTCGCGGCTGGGCTGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GATTGTGCTGACACCGGAGCTGGAAGGAGCGGAATTCACCCTGCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105424 GATTGTGCTGACACCGGAGCTGGAAGGAGCGGAATTCACCCTGCCCAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCACCAGGAACTTCTACGTGGATGGCCATGTCCCCAAGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105474 TCACCAGGAACTTCTACGTGGATGGCCATGTCCCCAAGCCCCAC