seq1 = pF1KE0999.tfa, 1569 bp
seq2 = pF1KE0999/gi568815586r_33276833.tfa (gi568815586r:33276833_33539522), 262690 bp

>pF1KE0999 1569
>gi568815586r:33276833_33539522 (Chr12)

(complement)

1-151  (100001-100151)   100% ->
152-509  (113028-113385)   100% ->
510-1077  (132167-132734)   100% ->
1078-1198  (154232-154352)   100% ->
1199-1370  (157003-157174)   100% ->
1371-1500  (159562-159691)   100% ->
1501-1569  (162622-162690)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTTCCACAAGGAGGACGGAGTGAACAGTCTGTGCCAGAAGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTTCCACAAGGAGGACGGAGTGAACAGTCTGTGCCAGAAGGCTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACATCGTCACCGAGCTGTGCTTCGCCGGCCAGGTGGAGTGGGAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCACATCGTCACCGAGCTGTGCTTCGCCGGCCAGGTGGAGTGGGAGAAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCGGGCATCTTCCCTCGGGACAGGGGCAGCCAGGGCGGAAGCAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCGGGCATCTTCCCTCGGGACAGGGGCAGCCAGGGCGGAAGCAGCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 G         ATATTTCAGTCAGCCTGTTAGCTGTCGTTGTCAGCTTTTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTA...CAGATATTTCAGTCAGCCTGTTAGCTGTCGTTGTCAGCTTTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGACTGGCCTTGTTGGTTGTCTCACTTTTTGTCTTCTGGAAGCTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113068 TGGACTGGCCTTGTTGGTTGTCTCACTTTTTGTCTTCTGGAAGCTGTGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCCATGCTGGAAAAGCAAACCTGTGACTTCCAACATCACTACGCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113118 GGCCATGCTGGAAAAGCAAACCTGTGACTTCCAACATCACTACGCTTCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGAGCATTTCAAGTGCTCCTACTGAAGTTTTTGAGACTGAAGAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113168 CAGAGCATTTCAAGTGCTCCTACTGAAGTTTTTGAGACTGAAGAGAAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGAAATTAAGGAAAATGAAAAGCCAGCCGTAAAAGCTATTGAGCCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113218 AGAAATTAAGGAAAATGAAAAGCCAGCCGTAAAAGCTATTGAGCCTGCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TAAAAATCAGCCACACTTCCCCTGACATCCCAGCAGAAGTCCAAACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113268 TAAAAATCAGCCACACTTCCCCTGACATCCCAGCAGAAGTCCAAACTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTAAAAGAACATTTAATTAAACATGCACGTGTGCAAAGACAAATTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113318 TTAAAAGAACATTTAATTAAACATGCACGTGTGCAAAGACAAATTACTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCTACGTCATCAACCCG         CCACAGTTCCTTCCGAAGACACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 113368 GCCTACGTCATCAACCCGGTA...CAGCCACAGTTCCTTCCGAAGACACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCCGAGGCAAATGCAGGTTTCCAGTGTTGATTTTAGCATGGGCACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132190 TGCCGAGGCAAATGCAGGTTTCCAGTGTTGATTTTAGCATGGGCACAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCTGTTTTACAACGAGGAGAAACAACAACCAGCATTGGGAGGATAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132240 CCTGTTTTACAACGAGGAGAAACAACAACCAGCATTGGGAGGATAAAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGAACTCTACAAACAGAAATCAGTTGACTCTGAGGGCAACCAAAACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132290 AGAACTCTACAAACAGAAATCAGTTGACTCTGAGGGCAACCAAAACGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ATGTCAAAATCTGTGGGAAACTTAACTTTACCCTCCAGTATGATTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132340 ATGTCAAAATCTGTGGGAAACTTAACTTTACCCTCCAGTATGATTATGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AATGAACTTCTAGTTGTTAAAATTATCAAAGCTTTAGATCTCCCTGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132390 AATGAACTTCTAGTTGTTAAAATTATCAAAGCTTTAGATCTCCCTGCTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGACTTCACAGGAACTTCTGACCCTTATGTGAAGATGTATCTTCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132440 AGACTTCACAGGAACTTCTGACCCTTATGTGAAGATGTATCTTCTTCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ATAGGAAAAAGAAATTTCAGACCCGCGTGCACAGAAAGACTTTAAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132490 ATAGGAAAAAGAAATTTCAGACCCGCGTGCACAGAAAGACTTTAAATCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CTATTTGATGAAACTTTTCAATTTCCTGTAGCATATGATCAACTAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132540 CTATTTGATGAAACTTTTCAATTTCCTGTAGCATATGATCAACTAAGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CCGAAAACTACATTTCAGTGTGTATGATTTTGACAGATTTTCTAGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132590 CCGAAAACTACATTTCAGTGTGTATGATTTTGACAGATTTTCTAGACATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ACATGATTGGGGAAGTGATTCTTGATAATTTGTTTGAAGTCTCTGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132640 ACATGATTGGGGAAGTGATTCTTGATAATTTGTTTGAAGTCTCTGATCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TCCAGGGAAGCCACAGTATGGAAAGATATTCACTGTGCTACCACA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 132690 TCCAGGGAAGCCACAGTATGGAAAGATATTCACTGTGCTACCACAGTA..

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1078     GAAAGTATAGACCTGGGTGAAATCATGTTTTCCCTTTGTTACCTAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132740 .TAGGAAAGTATAGACCTGGGTGAAATCATGTTTTCCCTTTGTTACCTAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CGACGGCTGGGCGTATGACATTGACAGTCATTAAGTGCAGAAATCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154278 CGACGGCTGGGCGTATGACATTGACAGTCATTAAGTGCAGAAATCTGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GCGATGGATATTACTGGCTCATCAG         ATCCTTATGTCAAAGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 154328 GCGATGGATATTACTGGCTCATCAGGTA...TAGATCCTTATGTCAAAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GTCCCTGATGTGTGAAGGTCGAAGATTAAAAAAGAGGAAAACAACTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157019 GTCCCTGATGTGTGAAGGTCGAAGATTAAAAAAGAGGAAAACAACTACAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AGAAAAACACTCTAAACCCTGTGTACAATGAGGCCATTATTTTTGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157069 AGAAAAACACTCTAAACCCTGTGTACAATGAGGCCATTATTTTTGACATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CCTCCAGAGAACGTGGACCAGGTCAGCCTCTCCATTGCGGTCATGGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157119 CCTCCAGAGAACGTGGACCAGGTCAGCCTCTCCATTGCGGTCATGGATTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CGATAG         GGTAGGACACAATGAGGTCATAGGAGTGTGCAGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157169 CGATAGGTA...TAGGGTAGGACACAATGAGGTCATAGGAGTGTGCAGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CAGGACTGGATGCTGAGGGTCTTGGGCGAGACCACTGGAATGAAATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159597 CAGGACTGGATGCTGAGGGTCTTGGGCGAGACCACTGGAATGAAATGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GCCTATCATCGAAAACCAATAACGCACTGGCACCCATTGCTGGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 159647 GCCTATCATCGAAAACCAATAACGCACTGGCACCCATTGCTGGAGGTA..

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501     TTACCTGGCCGGGCGACCAGTTTTGATAGTCAAGGATCCTGCCCTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159697 .CAGTTACCTGGCCGGGCGACCAGTTTTGATAGTCAAGGATCCTGCCCTT

   1600     .    :    .    :
   1547 CTCCTAAACCACCTTCCACACCA
        |||||||||||||||||||||||
 162668 CTCCTAAACCACCTTCCACACCA