seq1 = pF1KE0997.tfa, 525 bp
seq2 = pF1KE0997/gi568815595f_186972846.tfa (gi568815595f:186972846_187175800), 202955 bp

>pF1KE0997 525
>gi568815595f:186972846_187175800 (Chr3)

10-111  (100001-100102)   100% ->
112-286  (101314-101488)   100% ->
287-525  (102717-102955)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     10 CAGTTGGTTACCACAGAGAAGCGCTTCCTCAAAGACAGTTTGTACAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CAGTTGGTTACCACAGAGAAGCGCTTCCTCAAAGACAGTTTGTACAATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     60 AGGAATCCTAATTGTATGGGACCCATCTGTATACCACTCAGATATCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGAATCCTAATTGTATGGGACCCATCTGTATACCACTCAGATATCCCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    110 AG         TGGTACCAGAATCCGGATTATAATTTCTTTAACAACTAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTA...CAGTGGTACCAGAATCCGGATTATAATTTCTTTAACAACTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGACTTATCGTAAGCTGCACCCCAATCAGCCCTTTTACATCCTCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101353 AAGACTTATCGTAAGCTGCACCCCAATCAGCCCTTTTACATCCTCAAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGATGCCTTGGGAGCTATGGGACATTCTTCAAGAAATCTCCCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101403 CCAGATGCCTTGGGAGCTATGGGACATTCTTCAAGAAATCTCCCCAGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGATTCAGCCAAACCCCCCATCCTCTGGGATGCTTG         GTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101453 AGATTCAGCCAAACCCCCCATCCTCTGGGATGCTTGGTG...CAGGTATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATCATCATGATGACGCTGTGTGACCAGGTGGATATTTATGAGTTCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102722 ATCATCATGATGACGCTGTGTGACCAGGTGGATATTTATGAGTTCCTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATCCAAGCGCAAGACTGACGTGTGCTACTACTACCAGAAGTTCTTCGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102772 ATCCAAGCGCAAGACTGACGTGTGCTACTACTACCAGAAGTTCTTCGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTGCCTGCACGATGGGTGCCTACCACCCGCTGCTCTATGAGAAGAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102822 GTGCCTGCACGATGGGTGCCTACCACCCGCTGCTCTATGAGAAGAATTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGAAGCATCTCAACCAGGGCACAGATGAGGACATCTACCTGCTTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102872 GTGAAGCATCTCAACCAGGGCACAGATGAGGACATCTACCTGCTTGGAAA

    500     .    :    .    :    .    :
    492 AGCCACACTGCCTGGCTTCCGGACCATTCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102922 AGCCACACTGCCTGGCTTCCGGACCATTCACTGC