seq1 = pF1KE0984.tfa, 1776 bp
seq2 = pF1KE0984/gi568815593r_134198666.tfa (gi568815593r:134198666_134466523), 267858 bp

>pF1KE0984 1776
>gi568815593r:134198666_134466523 (Chr5)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-360  (106433-106627)   100% ->
361-539  (116097-116275)   100% ->
540-652  (144621-144733)   100% ->
653-792  (147027-147166)   100% ->
793-881  (154144-154232)   100% ->
882-1035  (157797-157950)   100% ->
1036-1364  (158058-158386)   100% ->
1365-1458  (159822-159915)   100% ->
1459-1621  (161957-162119)   100% ->
1622-1719  (163837-163934)   100% ->
1720-1776  (167814-167870)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGATGTATGAAACCCTTGGAAAAGTGGGAGAGGGAAGTTACGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGATGTATGAAACCCTTGGAAAAGTGGGAGAGGGAAGTTACGGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTCATGAAATGTAAACATAAGAATACTGGGCAGATAGTGGCCATTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTCATGAAATGTAAACATAAGAATACTGGGCAGATAGTGGCCATTAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATTTTATGAGAGACCAGAACAATCTGTCAACAAAATTGCGATGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TATTTTATGAGAGACCAGAACAATCTGTCAACAAAATTGCGATGAGAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATAAAGTTTCTAAAG         CAATTTCATCACGAAAACCTGGTCAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATAAAGTTTCTAAAGGTT...TAGCAATTTCATCACGAAAACCTGGTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTGATTGAAGTTTTTAGACAGAAAAAGAAAATTCATTTGGTATTTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106459 TCTGATTGAAGTTTTTAGACAGAAAAAGAAAATTCATTTGGTATTTGAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTATTGACCACACAGTATTAGATGAGTTACAACATTATTGTCATGGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106509 TTATTGACCACACAGTATTAGATGAGTTACAACATTATTGTCATGGACTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGAGTAAGCGACTTAGAAAATACCTCTTCCAGATCCTTCGAGCAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106559 GAGAGTAAGCGACTTAGAAAATACCTCTTCCAGATCCTTCGAGCAATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTATCTTCACAGTAATAAT         ATCATTCATCGAGATATAAAAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 106609 CTATCTTCACAGTAATAATGTA...TAGATCATTCATCGAGATATAAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGAGAATATTTTAGTATCCCAGTCAGGAATTACTAAGCTCTGTGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116119 CTGAGAATATTTTAGTATCCCAGTCAGGAATTACTAAGCTCTGTGATTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGTTTTGCACGAACACTAGCAGCTCCTGGGGACATTTATACGGACTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116169 GGTTTTGCACGAACACTAGCAGCTCCTGGGGACATTTATACGGACTATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCCACACGCTGGTATAGAGCTCCCGAATTAGTATTAAAAGATACTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116219 GGCCACACGCTGGTATAGAGCTCCCGAATTAGTATTAAAAGATACTTCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGGAAA         ACCTGTGGATATCTGGGCTTTGGGCTGTATGATC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116269 ATGGAAAGTA...CAGACCTGTGGATATCTGGGCTTTGGGCTGTATGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATTGAGATGGCCACTGGAAATCCCTATCTTCCTAGTAGTTCTGATTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144655 ATTGAGATGGCCACTGGAAATCCCTATCTTCCTAGTAGTTCTGATTTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TTTACTCCATAAAATTGTTTTGAAAGTGG         GCAATTTGTCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 144705 TTTACTCCATAAAATTGTTTTGAAAGTGGGTA...CAGGCAATTTGTCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTCACTTGCAGAATATCTTTTCCAAGAGCCCCATTTTTGCTGGGGTAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147039 CTCACTTGCAGAATATCTTTTCCAAGAGCCCCATTTTTGCTGGGGTAGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTTCCTCAAGTTCAACACCCCAAAAATGCAAGAAAAAAATATCCAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147089 CTTCCTCAAGTTCAACACCCCAAAAATGCAAGAAAAAAATATCCAAAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TAATGGATTGTTGGCAGATATAGTTCAT         GCTTGTTTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 147139 TAATGGATTGTTGGCAGATATAGTTCATGTA...TAGGCTTGTTTACAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTGATCCTGCTGACAGGATATCATCTAGTGATCTTTTGCATCATGAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154157 TTGATCCTGCTGACAGGATATCATCTAGTGATCTTTTGCATCATGAGTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTTACTAGAGATGGATTTATTGAAAA         ATTCATGCCAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 154207 TTTACTAGAGATGGATTTATTGAAAAGTA...CAGATTCATGCCAGAACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GAAAGCTAAATTACTGCAGGAAGCAAAAGTCAATTCATTAATAAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157812 GAAAGCTAAATTACTGCAGGAAGCAAAAGTCAATTCATTAATAAAGCCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AAGAGAGTTCTAAAGAAAATGAACTCAGGAAAGATGAAAGAAAAACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157862 AAGAGAGTTCTAAAGAAAATGAACTCAGGAAAGATGAAAGAAAAACAGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TATACCAATACACTGCTAAGTAGTTCAGTTTTGGGAAAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 157912 TATACCAATACACTGCTAAGTAGTTCAGTTTTGGGAAAGGTA...CAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AATAGAAAAAGAGAAAAAGCCCAAGGAGATCAAAGTCAGAGTTATTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158060 AATAGAAAAAGAGAAAAAGCCCAAGGAGATCAAAGTCAGAGTTATTAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCAAAGGAGGAAGAGGAGATATCTCAGAACCAAAAAAGAAAGAGTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158110 TCAAAGGAGGAAGAGGAGATATCTCAGAACCAAAAAAGAAAGAGTATGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGTGGACTTGGTCAACAGGATGCAAATGAAAATGTTCATCCTATGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158160 GGTGGACTTGGTCAACAGGATGCAAATGAAAATGTTCATCCTATGTCTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGATACAAAACTTGTAACCATTGAACCACCAAACCCTATCAATCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158210 AGATACAAAACTTGTAACCATTGAACCACCAAACCCTATCAATCCCAGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CTAACTGTAATGGCTTGAAAGAAAATCCACATTGCGGAGGTTCTGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158260 CTAACTGTAATGGCTTGAAAGAAAATCCACATTGCGGAGGTTCTGTGACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ATGCCACCCATCAATCTAACTAACAGTAATTTGATGGCTGCAAATCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158310 ATGCCACCCATCAATCTAACTAACAGTAATTTGATGGCTGCAAATCTCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TTCAAATCTCTTTCACCCCAGTGTGAG         GTTAACTGAAAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 158360 TTCAAATCTCTTTCACCCCAGTGTGAGGTG...TAGGTTAACTGAAAGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CAAAAAAGAGACGCACTTCTTCACAATCTATTGGACAAGTTATGCCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159836 CAAAAAAGAGACGCACTTCTTCACAATCTATTGGACAAGTTATGCCTAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AGCAGGCAAGAGGATCCAGGTCCTATTCAA         AGCCAAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 159886 AGCAGGCAAGAGGATCCAGGTCCTATTCAAGTA...TAGAGCCAAATGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GAAGGGTATATTTAATGAGCGAACAGGTCACAGTGACCAAATGGCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161968 GAAGGGTATATTTAATGAGCGAACAGGTCACAGTGACCAAATGGCAAATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AGAACAAAAGGAAGCTGAATTTTTCCAGATCTGACAGGAAAGAATTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162018 AGAACAAAAGGAAGCTGAATTTTTCCAGATCTGACAGGAAAGAATTCCAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TTTCCAGAATTGCCTGTCACAATACAGTCAAAAGATACAAAAGGAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162068 TTTCCAGAATTGCCTGTCACAATACAGTCAAAAGATACAAAAGGAATGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AG         TTAAACAGATAAAAATGCTGAAGAGGGAGTCAAAGAAAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162118 AGGTA...AAGTTAAACAGATAAAAATGCTGAAGAGGGAGTCAAAGAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CAGAGTCATCTAAGATACCAACTTTACTTAACGTGGATCAAAATCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163876 CAGAGTCATCTAAGATACCAACTTTACTTAACGTGGATCAAAATCAAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 AAACAAGAG         GGTGGAGATGGCCATTGCGAGGGGAAGAATTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 163926 AAACAAGAGGTA...TAGGGTGGAGATGGCCATTGCGAGGGGAAGAATTT

   1850     .    :    .    :    .
   1752 GAAGAGAAACAGGTTTTTTTTCTGG
        |||||||||||||||||||||||||
 167846 GAAGAGAAACAGGTTTTTTTTCTGG