seq1 = pF1KE0975.tfa, 1632 bp
seq2 = pF1KE0975/gi568815590f_143616378.tfa (gi568815590f:143616378_143822248), 205871 bp

>pF1KE0975 1632
>gi568815590f:143616378_143822248 (Chr8)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-165  (101317-101415)   100% ->
166-195  (101670-101699)   100% ->
196-286  (101835-101925)   100% ->
287-417  (102398-102528)   100% ->
418-581  (102616-102779)   99% ->
582-721  (102966-103105)   100% ->
722-779  (103853-103910)   100% ->
780-917  (104326-104463)   100% ->
918-1023  (104623-104728)   100% ->
1024-1204  (104854-105034)   100% ->
1205-1329  (105172-105296)   100% ->
1330-1458  (105375-105503)   100% ->
1459-1632  (105698-105871)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCACCGTAGTGGACCCTCGCATTGTCCGGAGATACCTACTCAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGCACCGTAGTGGACCCTCGCATTGTCCGGAGATACCTACTCAGGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCTCGGGCAGGGG         GCCTATGGCATTGTGTGGAAGGCAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGCTCGGGCAGGGGGTG...CAGGCCTATGGCATTGTGTGGAAGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATCAAGAAAATCTTTGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101342 TGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATCAAGAAAATCTTTGATGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTAGGGATAAGACAGATGCCCAG         AGAACATTCCGGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101392 TTTAGGGATAAGACAGATGCCCAGGTG...CAGAGAACATTCCGGGAAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CACGCTCCTCCAG         GAGTTTGGGGACCATCCCAACATCATCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101687 CACGCTCCTCCAGGTG...CAGGAGTTTGGGGACCATCCCAACATCATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GCCTCCTTGACGTGATCCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101863 GCCTCCTTGACGTGATCCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTGAGTTTATGG         ACACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101913 TTTGAGTTTATGGGTG...CAGACACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGCTCCATCTTCTACCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102426 GGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGCTCCATCTTCTACCAGCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGCGGGCCACCCGGTTCCTCCACTCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102476 TGCGGGCCACCCGGTTCCTCCACTCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAG         CCGTCCAATGTGCTCCTGGATGCCAACTGCACAGTGAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102526 AAGGTG...CAGCCGTCCAATGTGCTCCTGGATGCCAACTGCACAGTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCTGTGTGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACCTCCCTGAGGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 102654 GCTGTGTGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACCTCCCCGAGGGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTGAGGACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102704 CTGAGGACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCGGAGGTGCTGCTCTCTTCGCACCG         ATACACCCTTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102754 CCGGAGGTGCTGCTCTCTTCGCACCGGTA...CAGATACACCCTTGGGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGACATGTGGAGTCTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102981 GGACATGTGGAGTCTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGGGAGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCCTGTTCCCCGGCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGAGCTGATCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103031 CCCTGTTCCCCGGCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGAGCTGATCCTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACCATCCCACCGCCATCTGAGGAGG         ACCTCCTGGCTCTCGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103081 ACCATCCCACCGCCATCTGAGGAGGGTG...CAGACCTCCTGGCTCTCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CTCAGGCTGCCGTGCCTCTGTGCTGCACCAGCTGGGGTCCCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103869 CTCAGGCTGCCGTGCCTCTGTGCTGCACCAGCTGGGGTCCCGGTG...CA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    780  GCCACGACAGACGCTGGATGCCCTCCTACCGCCAGACACCTCCCCAGAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104325 GGCCACGACAGACGCTGGATGCCCTCCTACCGCCAGACACCTCCCCAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GCCTTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGCCCCGGACAAGCGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104375 GCCTTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGCCCCGGACAAGCGGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AAGCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCCCTACGTGCAGAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 104425 AAGCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCCCTACGTGCAGAGGTG...CAGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TCCACTGCCCCAGCGACGAGTGGGCACGAGAGGCAGATGTGCGGCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104625 TCCACTGCCCCAGCGACGAGTGGGCACGAGAGGCAGATGTGCGGCCCCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GCACACGAAGGGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGCCGCGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104675 GCACACGAAGGGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGCCGCGTCTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TCAG         ATGATCCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGCACCTCGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104725 TCAGGTG...CAGATGATCCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGCACCTCGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTCCCCAAGCCAGGCACACCTGCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104891 GAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTCCCCAAGCCAGGCACACCTGCACAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CCCAGAGCCGACCCTCAGCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104941 CCCAGAGCCGACCCTCAGCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ACCCAGGCCCCAGAGCAGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGCACG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104991 ACCCAGGCCCCAGAGCAGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGCACGGTG...

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1205    AGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCCAGGCAGAACTCCGCTCCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105169 CAGAGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCCAGGCAGAACTCCGCTCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGGAATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105219 CTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGGAATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GGAAGCGCCCCCCTTGACACTCTCGCTG         GTGAAGCCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105269 GGAAGCGCCCCCCTTGACACTCTCGCTGGTA...CAGGTGAAGCCAAGCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GGAGGGGAGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGGCTCAGGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105388 GGAGGGGAGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGGCTCAGGTGGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AACCAGGCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACCGGGGCGGTGGGGTGAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105438 AACCAGGCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACCGGGGCGGTGGGGTGAGGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGCCAGCGTACAACAG         GTCCCTCCCCGGCTTCCTCCGGAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105488 GGCCAGCGTACAACAGGTA...CAGGTCCCTCCCCGGCTTCCTCCGGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CCCGGCCCGGCCGGAGGATGTTCAGCACCTCTGCCTTGCAGGGTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105723 CCCGGCCCGGCCGGAGGATGTTCAGCACCTCTGCCTTGCAGGGTGCCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GGGGGTGCCAGGGCTTTGCTTGGAGGCTACTCCCAAGCCTACGGGACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105773 GGGGGTGCCAGGGCTTTGCTTGGAGGCTACTCCCAAGCCTACGGGACTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1584 CTGCCACTCGGCACTGGGCCACCTGCCCCTGCTGGAGGGGCACCATGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105823 CTGCCACTCGGCACTGGGCCACCTGCCCCTGCTGGAGGGGCACCATGTG