seq1 = pF1KE0974.tfa, 1581 bp
seq2 = pF1KE0974/gi568815588r_73715018.tfa (gi568815588r:73715018_73974461), 259444 bp

>pF1KE0974 1581
>gi568815588r:73715018_73974461 (Chr10)

(complement)

1-65  (100001-100065)   98% ->
66-160  (101379-101473)   97% ->
161-220  (113573-113632)   100% ->
221-275  (121216-121270)   100% ->
276-341  (122143-122208)   100% ->
342-414  (125129-125201)   100% ->
415-517  (125347-125449)   100% ->
518-601  (125853-125936)   100% ->
602-696  (126380-126474)   100% ->
697-819  (127115-127237)   100% ->
820-903  (131921-132004)   100% ->
904-946  (132251-132293)   100% ->
947-1009  (134861-134923)   100% ->
1010-1053  (136951-136994)   100% ->
1054-1086  (146341-146373)   100% ->
1087-1131  (150378-150422)   100% ->
1132-1180  (152732-152780)   100% ->
1181-1256  (156908-156983)   100% ->
1257-1351  (157345-157439)   100% ->
1352-1581  (159215-159444)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCACCGCCACCTGCACACGTTTCACCGACGACTACCAGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACCACCGCCACCTGCACCCGTTTCACCGACGACTACCAGCTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGGAGCTTGGCAA         GGGTGCTTTCTCTGTGGTCCGCAGGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGGAGCTTGGCAAGTA...CAGGGGTGCTTTCTCTGTGGTCCGCAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGTGAAGAAAACCCCCACGCAGGAGTACGCAGCAAAAATCATCAATACC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101405 GTGTGAAGAAAACCTCCACGCAGGAGTACGCAGCAAAAATCATCAATACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGAAATTGTCTGCCCGGG         ATCACCAGAAACTAGAACGTGA
        ||||| |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101455 AAGAAGTTGTCTGCCCGGGGTG...TAGATCACCAGAAACTAGAACGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGCTCGGATATGTCGACTTCTGAAACATCCAAACATCG         TGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 113595 GGCTCGGATATGTCGACTTCTGAAACATCCAAACATCGGTG...CAGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GCCTCCATGACAGTATTTCTGAAGAAGGGTTTCACTACCTCGTGTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121219 GCCTCCATGACAGTATTTCTGAAGAAGGGTTTCACTACCTCGTGTTTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CT         TGTTACCGGCGGGGAGCTGTTTGAAGACATTGTGGCCAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121269 CTGTA...CAGTGTTACCGGCGGGGAGCTGTTTGAAGACATTGTGGCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AGAGTACTACAGTGAAGCAGATGCCAG         CCACTGTATACATC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 122182 AGAGTACTACAGTGAAGCAGATGCCAGGTA...TAGCCACTGTATACATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 AGATTCTGGAGAGTGTTAACCACATCCACCAGCATGACATCGTCCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125143 AGATTCTGGAGAGTGTTAACCACATCCACCAGCATGACATCGTCCACAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GACCTGAAG         CCTGAGAACCTGCTGCTGGCGAGTAAATGCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 125193 GACCTGAAGGTA...CAGCCTGAGAACCTGCTGCTGGCGAGTAAATGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 GGGTGCCGCCGTCAAGCTGGCTGATTTTGGCCTAGCCATCGAAGTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125379 GGGTGCCGCCGTCAAGCTGGCTGATTTTGGCCTAGCCATCGAAGTACAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GAGAGCAGCAGGCTTGGTTTG         GTTTTGCTGGCACCCCAGGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 125429 GAGAGCAGCAGGCTTGGTTTGGTA...CAGGTTTTGCTGGCACCCCAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 TACTTGTCCCCTGAGGTCTTGAGGAAAGATCCCTATGGAAAACCTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125873 TACTTGTCCCCTGAGGTCTTGAGGAAAGATCCCTATGGAAAACCTGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TATCTGGGCCTGCG         GGGTCATCCTGTATATCCTCCTGGTGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 125923 TATCTGGGCCTGCGGTA...TAGGGGTCATCCTGTATATCCTCCTGGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 GCTATCCTCCCTTCTGGGATGAGGATCAGCACAAGCTGTATCAGCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126407 GCTATCCTCCCTTCTGGGATGAGGATCAGCACAAGCTGTATCAGCAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 AAGGCTGGAGCCTATGAT         TTCCCATCACCAGAATGGGACAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 126457 AAGGCTGGAGCCTATGATGTA...TAGTTCCCATCACCAGAATGGGACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 GGTAACTCCTGAAGCCAAGAACTTGATCAACCAGATGCTGACCATAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127138 GGTAACTCCTGAAGCCAAGAACTTGATCAACCAGATGCTGACCATAAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 CAGCAAAGCGCATCACGGCTGACCAGGCTCTCAAGCACCCGTGGGTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127188 CAGCAAAGCGCATCACGGCTGACCAGGCTCTCAAGCACCCGTGGGTCTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820          CAACGATCCACGGTGGCATCCATGATGCATCGTCAGGAGAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127238 GTA...TAGCAACGATCCACGGTGGCATCCATGATGCATCGTCAGGAGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 TGTGGAGTGTTTGCGCAAGTTCAATGCCCGGAGAAAACTGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 131962 TGTGGAGTGTTTGCGCAAGTTCAATGCCCGGAGAAAACTGAAGGTG...C

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    904   GGTGCCATCCTCACGACCATGCTTGTCTCCAGGAACTTCTCAG     
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 132249 AGGGTGCCATCCTCACGACCATGCTTGTCTCCAGGAACTTCTCAGGTA..

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947     TTGGCAGGCAGAGCTCCGCCCCCGCCTCGCCTGCCGCGAGCGCCGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132299 .CAGTTGGCAGGCAGAGCTCCGCCCCCGCCTCGCCTGCCGCGAGCGCCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    993 CGGCCTGGCCGGGCAAG         CTGCCAAAAGCCTATTGAACAAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 134907 CGGCCTGGCCGGGCAAGGTA...CAGCTGCCAAAAGCCTATTGAACAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1034 AGTCGGATGGCGGTGTCAAG         AAAAGGAAGTCGAGTTCCAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 136975 AGTCGGATGGCGGTGTCAAGGTA...CAGAAAAGGAAGTCGAGTTCCAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1075 GTGCACCTAATG         GAGCCACAAACCACTGTGGTACACAACGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 146362 GTGCACCTAATGGTG...CAGGAGCCACAAACCACTGTGGTACACAACGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1116 TACAGATGGGATCAAG         GGCTCCACAGAGAGCTGCAACACCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 150407 TACAGATGGGATCAAGGTG...CAGGGCTCCACAGAGAGCTGCAACACCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1157 CCACAGAAGATGAGGACCTCAAAG         TGCGAAAACAGGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 152757 CCACAGAAGATGAGGACCTCAAAGGTA...CAGTGCGAAAACAGGAGATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1198 ATTAAGATTACAGAACAGCTGATTGAAGCCATCAACAATGGGGACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156925 ATTAAGATTACAGAACAGCTGATTGAAGCCATCAACAATGGGGACTTTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1248 GGCCTACAC         GAAGATTTGTGATCCAGGCCTCACTTCCTTTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 156975 GGCCTACACGTA...TAGGAAGATTTGTGATCCAGGCCTCACTTCCTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1289 AGCCTGAGGCCCTTGGTAACCTCGTGGAGGGGATGGATTTCCATAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157377 AGCCTGAGGCCCTTGGTAACCTCGTGGAGGGGATGGATTTCCATAAGTTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1339 TACTTTGAGAATC         TCCTGTCAAAGAACAGCAAGCCTATCCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||| ||||||||||||||||||||
 157427 TACTTTGAGAATCGTG...CAGTCCTGTCCAAGAACAGCAAGCCTATCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1380 TACCACCATCCTAAACCCACACGTCCACGTGATTGGGGAGGACGCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159243 TACCACCATCCTAAACCCACACGTCCACGTGATTGGGGAGGACGCAGCGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1430 GCATCGCCTACATCCGCCTCACCCAGTACATCGACGGGCAGGGTCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159293 GCATCGCCTACATCCGCCTCACCCAGTACATCGACGGGCAGGGTCGGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1480 CGCACCAGCCAGTCAGAAGAGACCCGGGTCTGGCACCGTCGGGATGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159343 CGCACCAGCCAGTCAGAAGAGACCCGGGTCTGGCACCGTCGGGATGGCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1530 GTGGCTCAATGTCCACTATCACTGCTCAGGGGCCCCTGCCGCACCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159393 GTGGCTCAATGTCCACTATCACTGCTCAGGGGCCCCTGCCGCACCGCTGC

   1750 
   1580 AG
        ||
 159443 AG