seq1 = pF1KE0970.tfa, 1569 bp
seq2 = pF1KE0970/gi568815584f_77718979.tfa (gi568815584f:77718979_78033388), 314410 bp

>pF1KE0970 1569
>gi568815584f:77718979_78033388 (Chr14)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-219  (103457-103540)   100% ->
220-423  (140098-140301)   100% ->
424-582  (168113-168271)   100% ->
583-741  (180122-180280)   100% ->
742-858  (188825-188941)   100% ->
859-1008  (205479-205628)   100% ->
1009-1206  (206786-206983)   100% ->
1207-1400  (212540-212733)   100% ->
1401-1569  (214242-214410)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCTCTGGCATCTACTTCTACAGTAACAAGTACTTGGACCCTAATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCTCTGGCATCTACTTCTACAGTAACAAGTACTTGGACCCTAATGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACG         ACGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 TTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACGGTA...CAGACGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCATCAGTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103463 GTCATCAGTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAG         GTGCACCTTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103513 AGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAGGTA...CAGGTGCACCTTCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140111 CTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGGTGGGCCAGCACCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140161 AAGGTGGGCCAGCACCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCACAGAGCAGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140211 CACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCACAGAGCAGCATGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAAGGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 140261 AAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAAGGAGGTA...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCCATGATTTGTTCCAGAGCTTCGATGACACCCCTCTGGGGACGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168113 ATCCATGATTTGTTCCAGAGCTTCGATGACACCCCTCTGGGGACGGCCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGGCCCAGGTCCACAAGGCAGTGCTGCATGATGGGCGGACGGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168163 CCTGGCCCAGGTCCACAAGGCAGTGCTGCATGATGGGCGGACGGTGGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGAAGGTCCAGCACCCAAAGGTGCGGGCTCAGAGCTCGAAGGACATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168213 TGAAGGTCCAGCACCCAAAGGTGCGGGCTCAGAGCTCGAAGGACATTCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGATGGAG         GTGCTCGTTCTGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 168263 CTGATGGAGGTG...CAGGTGCTCGTTCTGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180154 AGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180204 TGGAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAAG         GTCCCCCGAATCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 180254 ATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAAGGTA...CAGGTCCCCCGAATCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188839 CTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGCAGGTCAATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188889 GGCAGGTCAATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAG         ATCTCACGCCACCTGGGCAAGATGTATAGTGAGATGAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188939 GAGGTG...CAGATCTCACGCCACCTGGGCAAGATGTATAGTGAGATGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAATGTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205517 CTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAATGTACTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGCGGAAGCACCCCGGCACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205567 TGCGGAAGCACCCCGGCACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GGGCTTTACCAG         ATGCTCACGGAAGAATTCCGCCTGAATTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 205617 GGGCTTTACCAGGTA...TAGATGCTCACGGAAGAATTCCGCCTGAATTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206815 CTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGTACAGCCAGCGACTGGGAGCCGGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206865 AGTACAGCCAGCGACTGGGAGCCGGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATGCTGACGGCGCGATCGTGGGACTCGGTCAACAGAGGCATCAGCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206915 ATGCTGACGGCGCGATCGTGGGACTCGGTCAACAGAGGCATCAGCCAAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TCCCGTCACTGCCACTGAG         GACTTAGAGATTCGCAACAACG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 206965 TCCCGTCACTGCCACTGAGGTA...CAGGACTTAGAGATTCGCAACAACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CGGCCAACTACCTCCCCCAGATCAGCCATCTCCTCAACCACGTGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212562 CGGCCAACTACCTCCCCCAGATCAGCCATCTCCTCAACCACGTGCCGCGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACCTGCTGCGTGGCATTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212612 CAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACCTGCTGCGTGGCATTGAGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CGCCCTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212662 CGCCCTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GCTGCATCAGAGCGCTAGCTGA         GCACAAGAAGAAGAATACC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 212712 GCTGCATCAGAGCGCTAGCTGAGTG...CAGGCACAAGAAGAAGAATACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGAGGCCTTCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214261 TGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGAGGCCTTCAACTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 ATGGCAGATCAACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214311 ATGGCAGATCAACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TGGCTGACCGGGTCTTGGCCCTAATATGCTGGCTGTTCCCTGCTCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214361 TGGCTGACCGGGTCTTGGCCCTAATATGCTGGCTGTTCCCTGCTCCACTC