seq1 = pF1KE0969.tfa, 1581 bp
seq2 = pF1KE0969/gi568815594r_47967640.tfa (gi568815594r:47967640_48214402), 246763 bp

>pF1KE0969 1581
>gi568815594r:47967640_48214402 (Chr4)

(complement)

1-16  (80233-80248)   100% ->
17-71  (100001-100055)   100% ->
72-174  (101094-101196)   99% ->
175-380  (101891-102096)   100% ->
381-446  (103800-103865)   100% ->
447-501  (109448-109502)   100% ->
502-581  (119181-119260)   100% ->
582-709  (120199-120326)   100% ->
710-784  (124579-124653)   100% ->
785-956  (127766-127937)   100% ->
957-1173  (134275-134491)   100% ->
1174-1238  (137937-138001)   100% ->
1239-1357  (140350-140468)   100% ->
1358-1515  (142729-142886)   100% ->
1516-1581  (146698-146763)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCTTTCCTCCT         ATAACACCATCCAGTCGGTTTTCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  80233 ATGATCCTTTCCTCCTGTG...CAGATAACACCATCCAGTCGGTTTTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TTGCTGCTGTTGCTGTTCAGTGCAGAAGCG         ACAAATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100026 TTGCTGCTGTTGCTGTTCAGTGCAGAAGCGGTA...CAGACAAATGAGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 CACAGATAAGCCTGAGCACAGATGAAGAGCTTCCAGAAAAATACACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101105 CACAGATAAGCCTGAGCACAGATGAAGAGCTTCCAGAAAAATACACCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CATCGCAGGCCGTGGCTCAGCCAATTGTCAAATAAGAAGCAA        
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101155 CGTCGCAGGCCGTGGCTCAGCCAATTGTCAAATAAGAAGCAAGTA...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    175  TCCAACACGGGCCGTGTGCAGCCGTCAAAACGAAAGCCACTGCCTCCCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101890 GTCCAACACGGGCCGTGTGCAGCCGTCAAAACGAAAGCCACTGCCTCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCCCACCCTCTGAGGTTGCTGAAGAGAAGATCCAAGTCAAGGCACTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101940 TCCCACCCTCTGAGGTTGCTGAAGAGAAGATCCAAGTCAAGGCACTTTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATTTTCTGCCCAGAGAACCCTGTAATTTAGCCTTAAGGAGAGCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101990 GATTTTCTGCCCAGAGAACCCTGTAATTTAGCCTTAAGGAGAGCAGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ATACCTGATACTGGAGAAATACAATCCTCACTGGTGGAAGGCAAGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102040 ATACCTGATACTGGAGAAATACAATCCTCACTGGTGGAAGGCAAGAGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTTTGGG         GAATGAAGGCTTAATCCCAAGCAACTATGTGACT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102090 GTTTGGGGTA...TAGGAATGAAGGCTTAATCCCAAGCAACTATGTGACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAAAACAAAATAACTAATTTAGAAATATATGA         GTGGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 103834 GAAAACAAAATAACTAATTTAGAAATATATGAGTA...CAGGTGGTACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TAGAAACATTACCAGAAATCAGGCAGAACATCTATTGAGACAAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 109457 TAGAAACATTACCAGAAATCAGGCAGAACATCTATTGAGACAAGAGGTA.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    502      TCTAAAGAAGGTGCATTTATTGTCAGAGATTCAAGACATTTAGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109507 ..CAGTCTAAAGAAGGTGCATTTATTGTCAGAGATTCAAGACATTTAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TCCTACACAATTTCCGTATTTATGGGAGCTAGAAG         AAGTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 119226 TCCTACACAATTTCCGTATTTATGGGAGCTAGAAGGTA...TAGAAGTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GGAGGCTGCCATAAAACATTATCAGATAAAAAAGAATGACTCAGGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120205 GGAGGCTGCCATAAAACATTATCAGATAAAAAAGAATGACTCAGGACAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GGTATGTGGCTGAAAGACACGCCTTTCAATCAATCCCTGAGTTAATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120255 GGTATGTGGCTGAAAGACACGCCTTTCAATCAATCCCTGAGTTAATCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TATCACCAGCACAATGCAGCCG         GTCTCATGACTCGTCTCCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 120305 TATCACCAGCACAATGCAGCCGGTA...TAGGTCTCATGACTCGTCTCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 ATATCCAGTTGGGCTGATGGGCAGTTGTTTACCAGCCACAGCTGGGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124598 ATATCCAGTTGGGCTGATGGGCAGTTGTTTACCAGCCACAGCTGGGTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GCTACG         AAAAGTGGGAGATAGATCCATCTGAGTTGGCTTTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124648 GCTACGGTA...CAGAAAAGTGGGAGATAGATCCATCTGAGTTGGCTTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 ATAAAGGAGATTGGAAGCGGTCAGTTTGGAGTGGTCCATTTAGGTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127801 ATAAAGGAGATTGGAAGCGGTCAGTTTGGAGTGGTCCATTTAGGTGAATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GCGGTCACATATCCAGGTAGCTATCAAGGCCATCAATGAAGGCTCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127851 GCGGTCACATATCCAGGTAGCTATCAAGGCCATCAATGAAGGCTCCATGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CTGAAGAGGATTTCATTGAAGAGGCCAAAGTGATGAT         GAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 127901 CTGAAGAGGATTTCATTGAAGAGGCCAAAGTGATGATGTA...CAGGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 TTATCTCATTCAAAGCTAGTGCAACTTTATGGAGTCTGTATACAGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134279 TTATCTCATTCAAAGCTAGTGCAACTTTATGGAGTCTGTATACAGCGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GCCCCTTTACATTGTGACAGAGTTCATGGAAAATGGCTGCCTGCTTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134329 GCCCCTTTACATTGTGACAGAGTTCATGGAAAATGGCTGCCTGCTTAACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ATCTCAGGGAGAATAAAGGAAAGCTTAGGAAGGAAATGCTACTGAGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134379 ATCTCAGGGAGAATAAAGGAAAGCTTAGGAAGGAAATGCTACTGAGTGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TGCCAGGATATATGTGAAGGAATGGAATATCTGGAGAGGAATGGCTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134429 TGCCAGGATATATGTGAAGGAATGGAATATCTGGAGAGGAATGGCTATAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TCATAGGGATTTG         GCGGCAAGGAATTGTTTGGTCAGTTCAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 134479 TCATAGGGATTTGGTA...TAGGCGGCAAGGAATTGTTTGGTCAGTTCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CATGCATAGTAAAAATTTCAGACTTTGGAATGACAAG         GTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 137965 CATGCATAGTAAAAATTTCAGACTTTGGAATGACAAGGTA...TAGGTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GTTTTGGATGATGAGTATGTCAGTTCTTTTGGAGCCAAGTTCCCAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140354 GTTTTGGATGATGAGTATGTCAGTTCTTTTGGAGCCAAGTTCCCAATCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GTGGTCCCCTCCTGAAGTTTTTCTTTTCAATAAGTACAGCAGTAAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140404 GTGGTCCCCTCCTGAAGTTTTTCTTTTCAATAAGTACAGCAGTAAATCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 ATGTCTGGTCATTTG         GAGTTTTAATGTGGGAAGTTTTTACA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 140454 ATGTCTGGTCATTTGGTG...CAGGAGTTTTAATGTGGGAAGTTTTTACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GAAGGAAAAATGCCTTTTGAAAATAAGTCAAATTTGCAAGTCGTGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142755 GAAGGAAAAATGCCTTTTGAAAATAAGTCAAATTTGCAAGTCGTGGAAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TATTTCTGAAGGCTTCAGGCTATATCGCCCTCACCTGGCACCAATGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142805 TATTTCTGAAGGCTTCAGGCTATATCGCCCTCACCTGGCACCAATGTCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TATATGAAGTCATGTACAGCTGCTGGCATGAG         AAACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 142855 TATATGAAGTCATGTACAGCTGCTGGCATGAGGTA...CAGAAACCTGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 GGCCGCCCTACATTTGCGGAGCTGCTGCGGGCTGTCACAGAGATTGCGGA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 146707 GGCCGCCCTACATTTGCCGAGCTGCTGCGGGCTGTCACAGAGATTGCGGA

   1700     .
   1575 AACCTGG
        |||||||
 146757 AACCTGG