seq1 = pF1KE0965.tfa, 1527 bp
seq2 = pF1KE0965/gi568815596r_157637534.tfa (gi568815596r:157637534_157899493), 261960 bp

>pF1KE0965 1527
>gi568815596r:157637534_157899493 (Chr2)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-331  (118894-119157)   100% ->
332-543  (121152-121363)   100% ->
544-643  (125307-125406)   100% ->
644-790  (128980-129126)   99% ->
791-1066  (133298-133573)   100% ->
1067-1264  (138417-138614)   100% ->
1265-1395  (160924-161054)   100% ->
1396-1527  (161829-161960)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTAGATGGAGTGATGATTCTTCCTGTGCTTATCATGATTGCTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTAGATGGAGTGATGATTCTTCCTGTGCTTATCATGATTGCTCTCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCCCTAGTATGGAAG         ATGAGAAGCCCAAGGTCAACCCCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCCCTAGTATGGAAGGTA...CAGATGAGAAGCCCAAGGTCAACCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACTCTACATGTGTGTGTGTGAAGGTCTCTCCTGCGGTAATGAGGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118918 AACTCTACATGTGTGTGTGTGAAGGTCTCTCCTGCGGTAATGAGGACCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTGAAGGCCAGCAGTGCTTTTCCTCACTGAGCATCAACGATGGCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118968 TGTGAAGGCCAGCAGTGCTTTTCCTCACTGAGCATCAACGATGGCTTCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTCTACCAGAAAGGCTGCTTCCAGGTTTATGAGCAGGGAAAGATGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119018 CGTCTACCAGAAAGGCTGCTTCCAGGTTTATGAGCAGGGAAAGATGACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTAAGACCCCGCCGTCCCCTGGCCAAGCCGTGGAGTGCTGCCAAGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119068 GTAAGACCCCGCCGTCCCCTGGCCAAGCCGTGGAGTGCTGCCAAGGGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGGTGTAACAGGAACATCACGGCCCAGCTGCCCACTAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 119118 TGGTGTAACAGGAACATCACGGCCCAGCTGCCCACTAAAGGTT...CAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAAATCCTTCCCTGGAACACAGAATTTCCACTTGGAGGTTGGCCTCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121153 AAAATCCTTCCCTGGAACACAGAATTTCCACTTGGAGGTTGGCCTCATTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCTCTCTGTAGTGTTCGCAGTATGTCTTTTAGCCTGCCTGCTGGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121203 TTCTCTCTGTAGTGTTCGCAGTATGTCTTTTAGCCTGCCTGCTGGGAGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCTCTCCGAAAATTTAAAAGGCGCAACCAAGAACGCCTCAATCCCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121253 GCTCTCCGAAAATTTAAAAGGCGCAACCAAGAACGCCTCAATCCCCGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGTGGAGTATGGCACTATCGAAGGGCTCATCACCACCAATGTTGGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121303 CGTGGAGTATGGCACTATCGAAGGGCTCATCACCACCAATGTTGGAGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCACTTTAGCA         GATTTATTGGATCATTCGTGTACATCAGGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 121353 GCACTTTAGCAGTA...CAGGATTTATTGGATCATTCGTGTACATCAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGTGGCTCTGGTCTTCCTTTTCTGGTACAAAGAACAGTGGCTCGCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125337 AGTGGCTCTGGTCTTCCTTTTCTGGTACAAAGAACAGTGGCTCGCCAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TACACTGTTGGAGTGTGTCG         GGAAAGGCAGGTATGGTGAGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 125387 TACACTGTTGGAGTGTGTCGGTA...TAGGGAAAGGCAGGTATGGTGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGTGGAGGGGCAGCTGGCAAGGGGAAAATGTTGCCGTGAAGATCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 129001 TGTGGAGGGGCAGCTGGCAAGGGGAGAATGTTGCCGTGAAGATCTTCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCCCGTGATGAGAAGTCATGGTTCAGGGAAACGGAATTGTACAACACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129051 TCCCGTGATGAGAAGTCATGGTTCAGGGAAACGGAATTGTACAACACTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GATGCTGAGGCATGAAAATATCTTAG         GTTTCATTGCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 129101 GATGCTGAGGCATGAAAATATCTTAGGTA...CAGGTTTCATTGCTTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACATGACATCAAGACACTCCAGTACCCAGCTGTGGTTAATTACACATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133313 ACATGACATCAAGACACTCCAGTACCCAGCTGTGGTTAATTACACATTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CATGAAATGGGATCGTTGTACGACTATCTTCAGCTTACTACTCTGGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133363 CATGAAATGGGATCGTTGTACGACTATCTTCAGCTTACTACTCTGGATAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGTTAGCTGCCTTCGAATAGTGCTGTCCATAGCTAGTGGTCTTGCACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133413 AGTTAGCTGCCTTCGAATAGTGCTGTCCATAGCTAGTGGTCTTGCACATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGCACATAGAGATATTTGGGACCCAAGGGAAACCAGCCATTGCCCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133463 TGCACATAGAGATATTTGGGACCCAAGGGAAACCAGCCATTGCCCATCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GATTTAAAGAGCAAAAATATTCTGGTTAAGAAGAATGGACAGTGTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133513 GATTTAAAGAGCAAAAATATTCTGGTTAAGAAGAATGGACAGTGTTGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AGCAGATTTGG         GCCTGGCAGTCATGCATTCCCAGAGCACCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 133563 AGCAGATTTGGGTA...CAGGCCTGGCAGTCATGCATTCCCAGAGCACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ATCAGCTTGATGTGGGGAACAATCCCCGTGTGGGCACCAAGCGCTACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138447 ATCAGCTTGATGTGGGGAACAATCCCCGTGTGGGCACCAAGCGCTACATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GCCCCCGAAGTTCTAGATGAAACCATCCAGGTGGATTGTTTCGATTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138497 GCCCCCGAAGTTCTAGATGAAACCATCCAGGTGGATTGTTTCGATTCTTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TAAAAGGGTCGATATTTGGGCCTTTGGACTTGTTTTGTGGGAAGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138547 TAAAAGGGTCGATATTTGGGCCTTTGGACTTGTTTTGTGGGAAGTGGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GGCGGATGGTGAGCAATG         GTATAGTGGAGGATTACAAGCCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 138597 GGCGGATGGTGAGCAATGGTA...CAGGTATAGTGGAGGATTACAAGCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCGTTCTACGATGTGGTTCCCAATGACCCAAGTTTTGAAGATATGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160947 CCGTTCTACGATGTGGTTCCCAATGACCCAAGTTTTGAAGATATGAGGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGTAGTCTGTGTGGATCAACAAAGGCCAAACATACCCAACAGATGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160997 GGTAGTCTGTGTGGATCAACAAAGGCCAAACATACCCAACAGATGGTTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CAGACCCG         ACATTAACCTCTCTGGCCAAGCTAATGAAAGAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 161047 CAGACCCGGTA...CAGACATTAACCTCTCTGGCCAAGCTAATGAAAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 TGCTGGTATCAAAATCCATCCGCAAGACTCACAGCACTGCGTATCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161862 TGCTGGTATCAAAATCCATCCGCAAGACTCACAGCACTGCGTATCAAAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1479 GACTTTGACCAAAATTGATAATTCCCTCGACAAATTGAAAACTGACTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161912 GACTTTGACCAAAATTGATAATTCCCTCGACAAATTGAAAACTGACTGT