seq1 = pF1KE0960.tfa, 1497 bp
seq2 = pF1KE0960/gi568815597r_155163221.tfa (gi568815597r:155163221_155370977), 207757 bp

>pF1KE0960 1497
>gi568815597r:155163221_155370977 (Chr1)

(complement)

1-170  (100001-100170)   100% ->
171-399  (101262-101490)   100% ->
400-487  (102183-102270)   100% ->
488-554  (102619-102685)   100% ->
555-671  (102852-102968)   100% ->
672-838  (104083-104249)   100% ->
839-933  (105024-105118)   100% ->
934-1063  (106204-106333)   100% ->
1064-1146  (106428-106510)   100% ->
1147-1226  (106678-106757)   100% ->
1227-1317  (106938-107028)   100% ->
1318-1497  (107578-107757)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCATCCTCGAAGGTACCACTCCTCAGAGCGAGGCAGCCGGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCATCCTCGAAGGTACCACTCCTCAGAGCGAGGCAGCCGGGGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTACCGTGAACACTATCGGAGCCGAAAGCATAAGCGACGAAGAAGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTACCGTGAACACTATCGGAGCCGAAAGCATAAGCGACGAAGAAGTCGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGGTCAAGTAGTAGTGACCGGACACGACGGCGTCGGCGAGAGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTGGTCAAGTAGTAGTGACCGGACACGACGGCGTCGGCGAGAGGACAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACCATGTCCGTTCTCGAAG         CAGTTATGATGATCGTTCGTC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100151 TACCATGTCCGTTCTCGAAGGTG...CAGCAGTTATGATGATCGTTCGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGACCGGAGGGTGTATGACCGGCGATACTGTGGCAGCTACAGACGCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101283 CGACCGGAGGGTGTATGACCGGCGATACTGTGGCAGCTACAGACGCAACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATTATAGCCGGGATCGGGGAGATGCCTACTATGACACAGACTATCGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101333 ATTATAGCCGGGATCGGGGAGATGCCTACTATGACACAGACTATCGGCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCTATGAATATCAGCGGGAGAACAGCAGTTACCGCAGCCAGCGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101383 TCCTATGAATATCAGCGGGAGAACAGCAGTTACCGCAGCCAGCGCAGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCGGAGGAAGCACAGACGGCGGAGGAGGCGCAGCCGGACATTTAGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101433 CCGGAGGAAGCACAGACGGCGGAGGAGGCGCAGCCGGACATTTAGCCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CATCTTCG         CAGCACAGCAGCCGGAGAGCCAAGAGTGTAGAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101483 CATCTTCGGTG...CAGCAGCACAGCAGCCGGAGAGCCAAGAGTGTAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACGACGCTGAGGGCCACCTCATCTACCACGTCGGGGACTGGCTACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102216 GACGACGCTGAGGGCCACCTCATCTACCACGTCGGGGACTGGCTACAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCGAT         ATGAAATCGTTAGCACCTTAGGAGAGGGGACCTTCG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102266 GCGATGTA...CAGATGAAATCGTTAGCACCTTAGGAGAGGGGACCTTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCGAGTTGTACAATGTGTTGACCATCGCAG         GGGTGGGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102655 GCCGAGTTGTACAATGTGTTGACCATCGCAGGTA...CAGGGGTGGGGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGAGTTGCCCTGAAGATCATTAAGAATGTGGAGAAGTACAAGGAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102862 CGAGTTGCCCTGAAGATCATTAAGAATGTGGAGAAGTACAAGGAAGCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCGACTTGAGATCAACGTGCTAGAGAAAATCAATGAGAAAGACCCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102912 TCGACTTGAGATCAACGTGCTAGAGAAAATCAATGAGAAAGACCCTGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACAAGAA         CCTCTGTGTCCAGATGTTTGACTGGTTTGACTAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102962 ACAAGAAGTA...CAGCCTCTGTGTCCAGATGTTTGACTGGTTTGACTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CATGGCCACATGTGTATCTCCTTTGAGCTTCTGGGCCTTAGCACCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104117 CATGGCCACATGTGTATCTCCTTTGAGCTTCTGGGCCTTAGCACCTTCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTTCCTCAAAGACAACAACTACCTGCCCTACCCCATCCACCAAGTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104167 TTTCCTCAAAGACAACAACTACCTGCCCTACCCCATCCACCAAGTGCGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACATGGCCTTCCAGCTGTGCCAGGCTGTCAAGT         TCCTCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 104217 ACATGGCCTTCCAGCTGTGCCAGGCTGTCAAGTGTG...CAGTCCTCCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GATAACAAGCTGACACATACAGACCTCAAGCCTGAAAATATTCTGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105032 GATAACAAGCTGACACATACAGACCTCAAGCCTGAAAATATTCTGTTTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GAATTCAGACTATGAGCTCACCTACAACCTAGAGAAG         AAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105082 GAATTCAGACTATGAGCTCACCTACAACCTAGAGAAGGTA...TAGAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GAGATGAGCGCAGTGTGAAGAGCACAGCTGTGCGGGTGGTAGACTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106208 GAGATGAGCGCAGTGTGAAGAGCACAGCTGTGCGGGTGGTAGACTTTGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGTGCCACCTTTGACCATGAGCACCATAGCACCATTGTCTCCACTCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106258 AGTGCCACCTTTGACCATGAGCACCATAGCACCATTGTCTCCACTCGCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TTACCGAGCACCAGAAGTCATCCTTG         AGTTGGGCTGGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106308 TTACCGAGCACCAGAAGTCATCCTTGGTA...CAGAGTTGGGCTGGTCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGCCTTGTGATGTGTGGAGTATAGGCTGCATCATCTTTGAATACTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106443 AGCCTTGTGATGTGTGGAGTATAGGCTGCATCATCTTTGAATACTATGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGATTCACCCTCTTCCAG         ACCCATGACAACAGAGAGCATCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106493 GGATTCACCCTCTTCCAGGTA...CAGACCCATGACAACAGAGAGCATCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AGCCATGATGGAAAGGATCTTGGGTCCTATCCCTTCCCGGATGATCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106701 AGCCATGATGGAAAGGATCTTGGGTCCTATCCCTTCCCGGATGATCCGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGACAAG         AAAGCAGAAATATTTTTACCGGGGTCGCCTGGAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106751 AGACAAGGTG...TAGAAAGCAGAAATATTTTTACCGGGGTCGCCTGGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TGGGATGAGAACACATCAGCTGGGCGCTATGTTCGTGAGAACTGCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106972 TGGGATGAGAACACATCAGCTGGGCGCTATGTTCGTGAGAACTGCAAACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GCTGCGG         CGGTATCTGACCTCAGAGGCAGAGGAACACCACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107022 GCTGCGGGTG...CAGCGGTATCTGACCTCAGAGGCAGAGGAACACCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGCTCTTCGATCTGATTGAAAGCATGCTAGAGTATGAACCAGCTAAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107612 AGCTCTTCGATCTGATTGAAAGCATGCTAGAGTATGAACCAGCTAAGCGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CTGACCTTGGGTGAAGCCCTTCAGCATCCTTTCTTCGCCCGCCTTCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107662 CTGACCTTGGGTGAAGCCCTTCAGCATCCTTTCTTCGCCCGCCTTCGGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1452 TGAGCCGCCCAACAAGTTGTGGGACTCCAGTCGGGATATCAGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107712 TGAGCCGCCCAACAAGTTGTGGGACTCCAGTCGGGATATCAGTCGG