seq1 = pF1KE0957.tfa, 1479 bp
seq2 = pF1KE0957/gi568815596r_157433921.tfa (gi568815596r:157433921_157728644), 294724 bp

>pF1KE0957 1479
>gi568815596r:157433921_157728644 (Chr2)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-304  (141228-141458)   99% ->
305-544  (172313-172552)   100% ->
545-775  (178253-178483)   99% ->
776-943  (184033-184200)   99% ->
944-1100  (185783-185939)   99% ->
1101-1225  (187431-187555)   100% ->
1226-1356  (189942-190072)   100% ->
1357-1479  (194602-194724)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCGGGCGCTCTGCTCAGCGCTCCGCCAGGCTCTCCTGCTGCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCGGGCGCTCTGCTCAGCGCTCCGCCAGGCTCTCCTGCTGCTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCGGCCGCCGAGCTCTCGCCAG         GACTGAAGTGTGTATGTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 AGCGGCCGCCGAGCTCTCGCCAGGTA...CAGGACTGAAGTGTGTATGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGG
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 141246 TTTTGTGTGATTCTTCAAACTTCACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCATCAGTCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141296 GCATCAGTCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTCTGTCATAGTTCCAACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141346 CTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTCTGTCATAGTTCCAACAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141396 TTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACCTTCCAACAG         CATCACCAAATGCCCCAAAACTTGGACC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 141446 CACCTTCCAACAGGTA...TAGCATCACCAAATGCCCCAAAACTTGGACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATGGAGCTGGCCATCATTATTACTGTGCCTGTTTGCCTCCTGTCCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172341 CATGGAGCTGGCCATCATTATTACTGTGCCTGTTTGCCTCCTGTCCATAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGCGATGCTGACAGTATGGGCATGCCAGGGTCGACAGTGCTCCTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172391 CTGCGATGCTGACAGTATGGGCATGCCAGGGTCGACAGTGCTCCTACAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGAAAAAGAGACCAAATGTGGAGGAACCACTCTCTGAGTGCAATCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172441 AAGAAAAAGAGACCAAATGTGGAGGAACCACTCTCTGAGTGCAATCTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAATGCTGGAAAAACTCTGAAAGATCTGATTTATGATGTGACCGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172491 AAATGCTGGAAAAACTCTGAAAGATCTGATTTATGATGTGACCGCCTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GATCTGGCTCTG         GTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 172541 GATCTGGCTCTGGTA...TAGGTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCAAGGACGATTGTGCTTCAGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178282 GCAAGGACGATTGTGCTTCAGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAAATATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178332 GGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAAATATTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCTCCAGAGATGAAAGATATTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 178382 CCTCCAGAGATGAAAGATCTTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTCATGCTGCGACATGAAAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178432 GTCATGCTGCGACATGAAAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AG         ATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178482 AGGTA...TAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184072 ATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATGGCTGGAATGATCAAGCTGGCGCTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184122 GTGGCTGGAATGATCAAGCTGGCGCTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAG         GTAAACCTGCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 184172 CCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTA...TAGGTAAACCTGCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTGCTCATCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTAAAAAAGTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 185795 TTGCTCATCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTGAAAAAGTGTGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTGTGAAGCATGATTCAATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185845 ACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTGTGAAGCATGATTCAATACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 185895 GAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTA..

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101     GTATATGGCTCCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185945 .AAGGTATATGGCTCCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGGTCTGGTTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187477 TTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGGTCTGGTTTACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAG         GAATTGTTGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 187527 GGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGTA...CAGGAATTGTTGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGTACCAATTGCCTTATTATGACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189954 AGTACCAATTGCCTTATTATGACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190004 GAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATCCCAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CCAGTGGCAAAGTTGTGAA         GCACTCCGAGTCATGGGGAGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 190054 CCAGTGGCAAAGTTGTGAAGTA...AAGGCACTCCGAGTCATGGGGAGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGGAGCGGCCCGCCTAACTGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194624 TAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGGAGCGGCCCGCCTAACTGCTCTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194674 CGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGC

   1550 
   1479 C
        |
 194724 C