seq1 = pF1KE0956.tfa, 1458 bp
seq2 = pF1KE0956/gi568815588r_132108013.tfa (gi568815588r:132108013_132407695), 299683 bp

>pF1KE0956 1458
>gi568815588r:132108013_132407695 (Chr10)

(complement)

1-262  (99863-100124)   100% ->
263-318  (161741-161796)   100% ->
319-470  (179568-179719)   100% ->
471-644  (180728-180901)   100% ->
645-682  (181912-181949)   100% ->
683-772  (182080-182169)   100% ->
773-876  (182360-182463)   99% ->
877-993  (183173-183289)   100% ->
994-1119  (184710-184835)   100% ->
1120-1251  (184924-185055)   99% ->
1252-1319  (198595-198662)   100% ->
1320-1458  (199545-199683)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGAGTGGCGCCGAGCGCAGGGGCAGCAGCGCCGCGGCGTCCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99863 ATGAGGAGTGGCGCCGAGCGCAGGGGCAGCAGCGCCGCGGCGTCCCCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGCCGCCCCCCGGCCGCGCGCGCCCCGCCGGCTCCGACGCGCCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99913 CTCGCCGCCCCCCGGCCGCGCGCGCCCCGCCGGCTCCGACGCGCCCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGCCGCCGCCCGCTGCTGGCCAGCCCCGGGCCCGGGACTCGGGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99963 CCCTGCCGCCGCCCGCTGCTGGCCAGCCCCGGGCCCGGGACTCGGGCGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCGCTCGCAGCCGCGCCCCCTGTTTCAGTGGAGCAAGTGGAAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 GTCCGCTCGCAGCCGCGCCCCCTGTTTCAGTGGAGCAAGTGGAAGAAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATGGGCTCGTCCATGTCGGCGGCCACCGCGCGGAGGCCGGTGTTTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100063 GATGGGCTCGTCCATGTCGGCGGCCACCGCGCGGAGGCCGGTGTTTGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAAGGAGGACG         TGAACTTCGACCACTTCCAGATCCTTCGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100113 ACAAGGAGGACGGTG...CAGTGAACTTCGACCACTTCCAGATCCTTCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCATTGGGAAGGGCAGCTTTGGCAAG         GTGTGCATTGTGCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 161770 GCCATTGGGAAGGGCAGCTTTGGCAAGGTA...CAGGTGTGCATTGTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGCGGGACACGGAGAAGATGTACGCCATGAAGTACATGAACAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179582 GAAGCGGGACACGGAGAAGATGTACGCCATGAAGTACATGAACAAGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGTGCATCGAGCGCGACGAGGTCCGCAACGTCTTCCGGGAGCTGGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179632 AGTGCATCGAGCGCGACGAGGTCCGCAACGTCTTCCGGGAGCTGGAGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGCAGGAGATCGAGCACGTCTTCCTGGTGAACCTCTG         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 179682 CTGCAGGAGATCGAGCACGTCTTCCTGGTGAACCTCTGGTG...CAGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCCTTCCAGGACGAGGAGGACATGTTCATGGTCGTGGACCTGCTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180731 CTCCTTCCAGGACGAGGAGGACATGTTCATGGTCGTGGACCTGCTACTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCGGGGACCTGCGCTACCACCTGCAGCAGAACGTGCAGTTCTCCGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180781 GCGGGGACCTGCGCTACCACCTGCAGCAGAACGTGCAGTTCTCCGAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACGGTGAGGCTGTACATCTGCGAGATGGCACTGGCTCTGGACTACCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180831 ACGGTGAGGCTGTACATCTGCGAGATGGCACTGGCTCTGGACTACCTGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGGCCAGCACATCATCCACAG         AGATGTCAAGCCTGACAACA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 180881 CGGCCAGCACATCATCCACAGGTG...TAGAGATGTCAAGCCTGACAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTCTCCTGGATGAGAGAG         GACATGCACACCTGACCGACTTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 181932 TTCTCCTGGATGAGAGAGGTG...CAGGACATGCACACCTGACCGACTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AACATTGCCACCATCATCAAGGACGGGGAGCGGGCGACGGCATTAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182103 AACATTGCCACCATCATCAAGGACGGGGAGCGGGCGACGGCATTAGCAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACCAAGCCGTACATGG         CTCCGGAGATCTTCCACTCTTTTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 182153 CACCAAGCCGTACATGGGTG...AAGCTCCGGAGATCTTCCACTCTTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCAACGGCGGGACTGGCTACTCCTTCGAGGTGGACTGGTGGTCGGTGGGG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182384 TCAACGGCGGGACCGGCTACTCCTTCGAGGTGGACTGGTGGTCGGTGGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTGATGGCCTATGAGCTGCTGCGAGGATGG         AGGCCCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 182434 GTGATGGCCTATGAGCTGCTGCGAGGATGGGTA...CAGAGGCCCTATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CATCCACTCCAGCAACGCCGTGGAGTCCCTGGTGCAGCTGTTCAGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183184 CATCCACTCCAGCAACGCCGTGGAGTCCCTGGTGCAGCTGTTCAGCACCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGAGCGTCCAGTATGTCCCCACGTGGTCCAAGGAGATGGTGGCCTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183234 TGAGCGTCCAGTATGTCCCCACGTGGTCCAAGGAGATGGTGGCCTTGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CGGAAG         CTCCTCACTGTGAACCCCGAGCACCGGCTCTCCAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183284 CGGAAGGTG...CAGCTCCTCACTGTGAACCCCGAGCACCGGCTCTCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCTCCAGGACGTGCAGGCAGCCCCGGCGCTGGCCGGCGTGCTGTGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184745 CCTCCAGGACGTGCAGGCAGCCCCGGCGCTGGCCGGCGTGCTGTGGGACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACCTGAGCGAGAAGAGGGTGGAGCCGGGCTTCGTGCCCAAC         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 184795 ACCTGAGCGAGAAGAGGGTGGAGCCGGGCTTCGTGCCCAACGTA...TAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AAAGGCCGTCTGCACTGCGACCCCACCTTTGAGCTGGAGGAGATGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184924 AAAGGCCGTCTGCACTGCGACCCCACCTTTGAGCTGGAGGAGATGATCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGAGTCCAGGCCCCTGCACAAGAAGAAGAAGCGCCTGGCCAAGAACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 184974 GGAGTCCAGGCCCCTGCACAAGAAGAAGAAGCGTCTGGCCAAGAACAAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCCGGGACAACAGCAGGGACAGCTCCCAGTCC         GAGAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 185024 CCCGGGACAACAGCAGGGACAGCTCCCAGTCCGTG...CAGGAGAATGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TATCTTCAAGACTGCCTCGATGCCATCCAGCAAGACTTCGTGATTTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198604 TATCTTCAAGACTGCCTCGATGCCATCCAGCAAGACTTCGTGATTTTTAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAGAGAAAA         GCTGAAGAGGAGCCAGGACCTCCCGAGGGAGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 198654 CAGAGAAAAGTG...CAGGCTGAAGAGGAGCCAGGACCTCCCGAGGGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CTCTCCCCGCCCCTGAGTCCAGGGATGCTGCGGAGCCTGTGGAGGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199577 CTCTCCCCGCCCCTGAGTCCAGGGATGCTGCGGAGCCTGTGGAGGACGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GCGGAACGCTCCGCCCTGCCCATGTGCGGCCCCATTTGCCCCTCGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199627 GCGGAACGCTCCGCCCTGCCCATGTGCGGCCCCATTTGCCCCTCGGCCGG

   1550     .
   1452 GAGCGGC
        |||||||
 199677 GAGCGGC