seq1 = pF1KE0947.tfa, 1155 bp
seq2 = pF1KE0947/gi568815590r_85948465.tfa (gi568815590r:85948465_86169622), 221158 bp

>pF1KE0947 1155
>gi568815590r:85948465_86169622 (Chr8)

(complement)

1-185  (100001-100185)   100% ->
186-852  (104992-105658)   100% ->
853-1155  (120856-121158)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTGCGGCGCCAGCAGGAAGGTGGTCCCGGGGCCACCAGCGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTGCGGCGCCAGCAGGAAGGTGGTCCCGGGGCCACCAGCGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGGGCCAAGCACGAAGGTCAAAACCAAGCCGGCGTCGGAGGCGCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTGGGCCAAGCACGAAGGTCAAAACCAAGCCGGCGTCGGAGGCGCGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGGGCCCGAGGCGGCGGCCCAGGCGGCGCAGAGGATACAGGTGGCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGGGCCCGAGGCGGCGGCCCAGGCGGCGCAGAGGATACAGGTGGCTCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCGAGCCAAGTTCGACCCCCGGGTCCTTGCCAG         ATATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100151 TTCCGAGCCAAGTTCGACCCCCGGGTCCTTGCCAGGTA...CAGATATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCAAAGCTCTTATTGGGACAGGCAGTTTCAGCAGGGTTGTCAGGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104998 CATCAAAGCTCTTATTGGGACAGGCAGTTTCAGCAGGGTTGTCAGGGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCAGAAGACCACCAAGAAACCTTTTGCAATAAAAGTGATGGAAACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105048 AGCAGAAGACCACCAAGAAACCTTTTGCAATAAAAGTGATGGAAACCAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGAGGGAAGGTAGAGAAGCGTGCGTGTCTGAGCTGAGCGTCCTGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105098 GAGAGGGAAGGTAGAGAAGCGTGCGTGTCTGAGCTGAGCGTCCTGCGGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGTTAGCCATCGTTACATTGTCCAGCTCATGGAGATCTTTGAGACTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105148 GGTTAGCCATCGTTACATTGTCCAGCTCATGGAGATCTTTGAGACTGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATCAAGTTTACATGGTAATGGAGCTGGCTACCGGAGGGGAGCTCTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105198 ATCAAGTTTACATGGTAATGGAGCTGGCTACCGGAGGGGAGCTCTTTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGACTCATTGCTCAGGGATCCTTTACAGAGCGGGATGCCGTCAGGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105248 CGACTCATTGCTCAGGGATCCTTTACAGAGCGGGATGCCGTCAGGATCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCAGATGGTTGCTGATGGGATTAGGTATTTGCATGCGCTGCAGATAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105298 CCAGATGGTTGCTGATGGGATTAGGTATTTGCATGCGCTGCAGATAACTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATAGGAATCTAAAGCCTGAAAACCTCTTATACTATCATCCAGGTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105348 ATAGGAATCTAAAGCCTGAAAACCTCTTATACTATCATCCAGGTGAAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCGAAAATTTTAATTACAGATTTTGGTTTGGCATACTCCGGGAAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105398 TCGAAAATTTTAATTACAGATTTTGGTTTGGCATACTCCGGGAAAAAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGGTGACTGGACAATGAAGACACTCTGTGGGACCCCAGAGTACATAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105448 TGGTGACTGGACAATGAAGACACTCTGTGGGACCCCAGAGTACATAGCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTGAGGTTTTGCTAAGGAAGCCTTATACCAGTGCAGTGGACATGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105498 CTGAGGTTTTGCTAAGGAAGCCTTATACCAGTGCAGTGGACATGTGGGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTTGGTGTGATCACATATGCTTTACTTAGCGGATTCCTGCCTTTTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105548 CTTGGTGTGATCACATATGCTTTACTTAGCGGATTCCTGCCTTTTGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGAAAGCCAGACAAGGCTTTACAGGAAGATTCTGAAAGGCAAATATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105598 TGAAAGCCAGACAAGGCTTTACAGGAAGATTCTGAAAGGCAAATATAATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ATACAGGAGAG         CCTTGGCCAAGCATTTCCCACTTGGCGAAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105648 ATACAGGAGAGGTA...CAGCCTTGGCCAAGCATTTCCCACTTGGCGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GACTTTATAGACAAACTACTGATTTTGGAGGCTGGTCATCGCATGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120886 GACTTTATAGACAAACTACTGATTTTGGAGGCTGGTCATCGCATGTCAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGGCCAGGCCCTGGACCATCCCTGGGTGATCACCATGGCTGCAGGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120936 TGGCCAGGCCCTGGACCATCCCTGGGTGATCACCATGGCTGCAGGGTCTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CCATGAAGAATCTCCAGAGGGCCATATCCCGAAACCTCATGCAGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120986 CCATGAAGAATCTCCAGAGGGCCATATCCCGAAACCTCATGCAGAGGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TCTCCCCACTCTCAGAGTCCTGGATCTGCACAGTCTTCTAAGTCACATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121036 TCTCCCCACTCTCAGAGTCCTGGATCTGCACAGTCTTCTAAGTCACATTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TTCTCACAAATCCAGGCATATGTGGAGCAAGAGAAACTTAAGGATAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121086 TTCTCACAAATCCAGGCATATGTGGAGCAAGAGAAACTTAAGGATAGTAG

   1150     .    :    .    :
   1133 AATCGCCACTGTCTGCGCTTTTG
        |||||||||||||||||||||||
 121136 AATCGCCACTGTCTGCGCTTTTG