seq1 = pF1KE0945.tfa, 1050 bp
seq2 = pF1KE0945/gi568815590f_43003549.tfa (gi568815590f:43003549_43222874), 219326 bp

>pF1KE0945 1050
>gi568815590f:43003549_43222874 (Chr8)

1-282  (100001-100282)   100% ->
283-1050  (118559-119326)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAAGCAGCCCCAGAACAGCAGGAGAGGCCTCGCCCCCCGAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAAGCAGCCCCAGAACAGCAGGAGAGGCCTCGCCCCCCGAGAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCCAGCTGTTGGGCTGCTGCTGATCATGGCCCTGATGAATACTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGCCAGCTGTTGGGCTGCTGCTGATCATGGCCCTGATGAATACTCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACCTCTGCCTCGACCACTTCTTCATCGCTCCTCGACAATCCACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACCTCTGCCTCGACCACTTCTTCATCGCTCCTCGACAATCCACTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCCCACACACTGTCCCTATGGTCACTTCAGGATAGGACAGATGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACCCCACACACTGTCCCTATGGTCACTTCAGGATAGGACAGATGAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGCTCACCTTGGCTGTCCTGCGAGGAGCTGAGAACAGAAGTGAGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGCTCACCTTGGCTGTCCTGCGAGGAGCTGAGAACAGAAGTGAGACAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAAGCGTGTTGGGGAAGGAGCTGTAAAGAGA         GTCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100251 TGAAGCGTGTTGGGGAAGGAGCTGTAAAGAGAGTG...CAGGTCTTTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCTGAGTGGAAGGAGCACAAAGTTGCACTCTCACAGCTCACCAGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118568 TCTGAGTGGAAGGAGCACAAAGTTGCACTCTCACAGCTCACCAGCCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GATGAAAGATGATTTCCTCCATGGACTGCAGATGCTGAAATCTCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118618 GATGAAAGATGATTTCCTCCATGGACTGCAGATGCTGAAATCTCTCCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCACACATGTTGTCACGCTGCTTGGCTATTGTGAGGATGACAACACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118668 GCACACATGTTGTCACGCTGCTTGGCTATTGTGAGGATGACAACACTATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTTACTGAATATCACCCTCTAGGTTCCTTGAGTAACCTGGAAGAAACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118718 CTTACTGAATATCACCCTCTAGGTTCCTTGAGTAACCTGGAAGAAACACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AAACCTTTCAAAGTACCAAAATGTGAACACGTGGCAGCACAGGCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118768 AAACCTTTCAAAGTACCAAAATGTGAACACGTGGCAGCACAGGCTGGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGGCCATGGACTATGTCAGCATCATTAATTACCTGCACCACAGCCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118818 TGGCCATGGACTATGTCAGCATCATTAATTACCTGCACCACAGCCCTGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGCACACGGGTCATGTGCGACTCCAACGACCTGCCGAAGACACTGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118868 GGCACACGGGTCATGTGCGACTCCAACGACCTGCCGAAGACACTGTCCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GTATCTGCTAACAAGCAACTTCAGCATTTTGGCAAATGACTTGGACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118918 GTATCTGCTAACAAGCAACTTCAGCATTTTGGCAAATGACTTGGACGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TACCCCTGGTGAACCACAGCTCCGGGATGCTGGTGAAGTGCGGCCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118968 TACCCCTGGTGAACCACAGCTCCGGGATGCTGGTGAAGTGCGGCCACAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAGCTGCATGGGGATTTCGTGGCTCCAGAGCAACTGTGGCCCTATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119018 GAGCTGCATGGGGATTTCGTGGCTCCAGAGCAACTGTGGCCCTATGGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGACGTGCCTTTCCACGATGATCTCATGCCCTCATATGATGAGAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119068 GGACGTGCCTTTCCACGATGATCTCATGCCCTCATATGATGAGAAGATTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACATTTGGAAGATCCCAGACATCTCCAGTTTCCTTCTGGGGCACATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119118 ACATTTGGAAGATCCCAGACATCTCCAGTTTCCTTCTGGGGCACATTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGGAGTGATATGGTCCGATTCCATTTGTTTGATATTCACAAAGCATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119168 GGGAGTGATATGGTCCGATTCCATTTGTTTGATATTCACAAAGCATGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GAGCCAGACTCCCTCAGAAAGACCCACTGCCCAGGACGTTCTGGAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119218 GAGCCAGACTCCCTCAGAAAGACCCACTGCCCAGGACGTTCTGGAGACCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ACCAGAAGGTCTTGGATACACTTAGAGATGCCATGATGTCTCAGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119268 ACCAGAAGGTCTTGGATACACTTAGAGATGCCATGATGTCTCAGGCAAGA

   1050     .
   1042 GAGATGCTG
        |||||||||
 119318 GAGATGCTG