seq1 = pF1KE0937.tfa, 1284 bp
seq2 = pF1KE0937/gi568815575r_47536832.tfa (gi568815575r:47536832_47741441), 204610 bp

>pF1KE0937 1284
>gi568815575r:47536832_47741441 (ChrX)

(complement)

1-210  (100001-100210)   100% ->
211-654  (102104-102547)   100% ->
655-1086  (103260-103691)   100% ->
1087-1188  (104328-104429)   100% ->
1189-1284  (104515-104610)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCATCTGTGACGCTGTGGCAGTTTCTGCTGCAGCTGCTGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCCATCTGTGACGCTGTGGCAGTTTCTGCTGCAGCTGCTGAGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAAGGCAATGGCCACATCATCTCCTGGACTTCACGGGATGGTGGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAAGGCAATGGCCACATCATCTCCTGGACTTCACGGGATGGTGGTGAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAAGCTGGTGGATGCAGAGGAGGTGGCCCGGCTGTGGGGGCTACGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAAGCTGGTGGATGCAGAGGAGGTGGCCCGGCTGTGGGGGCTACGCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACAAGACCAACATGAATTACGACAAGCTCAGCCGGGCCTTGCGGTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACAAGACCAACATGAATTACGACAAGCTCAGCCGGGCCTTGCGGTACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTATGACAAG         AACATCATCCGCAAGGTGAGCGGCCAGAAGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTATGACAAGGTA...TAGAACATCATCCGCAAGGTGAGCGGCCAGAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCGTCTACAAGTTTGTGTCCTACCCTGAGGTCGCAGGGTGCTCCACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102135 TCGTCTACAAGTTTGTGTCCTACCCTGAGGTCGCAGGGTGCTCCACTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACTGCCCGCCCCAGCCAGAGGTGTCTGTTACCTCCACCATGCCAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102185 GACTGCCCGCCCCAGCCAGAGGTGTCTGTTACCTCCACCATGCCAAATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGCCCCTGCTGCTATACATGCCGCCCCAGGGGACACTGTCTCTGGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102235 GGCCCCTGCTGCTATACATGCCGCCCCAGGGGACACTGTCTCTGGAAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAGGCACACCCAAGGGTGCAGGAATGGCAGGCCCAGGCGGTTTGGCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102285 CAGGCACACCCAAGGGTGCAGGAATGGCAGGCCCAGGCGGTTTGGCACGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGCAGCCGGAACGAGTACATGCGCTCGGGCCTCTATTCCACCTTCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102335 AGCAGCCGGAACGAGTACATGCGCTCGGGCCTCTATTCCACCTTCACCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCAGTCTCTGCAGCCGCAGCCACCCCCTCATCCTCGGCCTGCTGTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102385 CCAGTCTCTGCAGCCGCAGCCACCCCCTCATCCTCGGCCTGCTGTGGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCCCCAGTGCAGCTCCTGCAGGGGCAGCAGCGCCCCCCTCGGGGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102435 TCCCCAGTGCAGCTCCTGCAGGGGCAGCAGCGCCCCCCTCGGGGAGCAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGCACCAGTCCAAGCCCCTTGGAGGCCTGTCTGGAGGCTGAAGAGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102485 AGCACCAGTCCAAGCCCCTTGGAGGCCTGTCTGGAGGCTGAAGAGGCCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTTGCCTCTGCAG         GTCATCCTGACCCCGCCCGAGGCCCCAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 102535 CTTGCCTCTGCAGGTA...CAGGTCATCCTGACCCCGCCCGAGGCCCCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACCTGAAATCGGAAGAGCTTAATGTGGAGCCGGGTTTGGGCCGGGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103288 ACCTGAAATCGGAAGAGCTTAATGTGGAGCCGGGTTTGGGCCGGGCTTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CCCCCAGAAGTGAAAGTAGAAGGGCCCAAGGAAGAGTTGGAAGTTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103338 CCCCCAGAAGTGAAAGTAGAAGGGCCCAAGGAAGAGTTGGAAGTTGCGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGAGAGAGGGTTTGTGCCAGAAACCACCAAGGCCGAGCCAGAAGTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103388 GGAGAGAGGGTTTGTGCCAGAAACCACCAAGGCCGAGCCAGAAGTCCCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CACAGGAGGGCGTGCCAGCCCGGCTGCCCGCGGTTGTTATGGACACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103438 CACAGGAGGGCGTGCCAGCCCGGCTGCCCGCGGTTGTTATGGACACCGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GGGCAGGCGGGCGGCCATGCGGCTTCCAGCCCTGAGATCTCCCAGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103488 GGGCAGGCGGGCGGCCATGCGGCTTCCAGCCCTGAGATCTCCCAGCCGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GAAGGGCCGGAAGCCCCGGGACCTAGAGCTTCCACTCAGCCCGAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103538 GAAGGGCCGGAAGCCCCGGGACCTAGAGCTTCCACTCAGCCCGAGCCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TAGGTGGGCCGGGACCCGAACGGACCCCAGGATCGGGAAGTGGCTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103588 TAGGTGGGCCGGGACCCGAACGGACCCCAGGATCGGGAAGTGGCTCCGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CTCCAGGCTCCGGGGCCGGCGCTGACCCCATCCCTGCTTCCTACGCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103638 CTCCAGGCTCCGGGGCCGGCGCTGACCCCATCCCTGCTTCCTACGCATAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 ATTG         ACCCCGGTGCTGCTGACACCCAGCTCGCTGCCTCCTA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103688 ATTGGTG...CAGACCCCGGTGCTGCTGACACCCAGCTCGCTGCCTCCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GCATTCACTTCTGGAGCACCCTGAGTCCCATTGCGCCCCGTAGCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104365 GCATTCACTTCTGGAGCACCCTGAGTCCCATTGCGCCCCGTAGCCCGGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AAGCTCTCCTTCCAG         TTTCCATCCAGTGGCAGCGCCCAGGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104415 AAGCTCTCCTTCCAGGTA...CAGTTTCCATCCAGTGGCAGCGCCCAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GCACATCCCTTCTATCAGCGTGGATGGCCTCTCGACCCCCGTGGTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104541 GCACATCCCTTCTATCAGCGTGGATGGCCTCTCGACCCCCGTGGTGCTCT

   1300     .    :    .    :
   1265 CCCCAGGGCCCCAGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||
 104591 CCCCAGGGCCCCAGAAGCCA