seq1 = pF1KE0933.tfa, 1245 bp
seq2 = pF1KE0933/gi568815580r_12694281.tfa (gi568815580r:12694281_12984141), 289861 bp

>pF1KE0933 1245
>gi568815580r:12694281_12984141 (Chr18)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-160  (124888-124978)   100% ->
161-261  (147251-147351)   100% ->
262-360  (153101-153199)   100% ->
361-495  (158198-158332)   100% ->
496-705  (166777-166986)   100% ->
706-858  (169787-169939)   100% ->
859-1040  (181991-182172)   100% ->
1041-1245  (189657-189861)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCACCACCATCGAGCGGGAGTTCGAAGAGTTGGATACTCAGCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCACCACCATCGAGCGGGAGTTCGAAGAGTTGGATACTCAGCGTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGCAGCCGCTGTACTTG         GAAATTCGAAATGAGTCCCATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGCAGCCGCTGTACTTGGTG...AAGGAAATTCGAAATGAGTCCCATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTATCCTCATAGAGTGGCCAAGTTTCCAGAAAACAGAAATCGAAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124910 ACTATCCTCATAGAGTGGCCAAGTTTCCAGAAAACAGAAATCGAAACAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACAGAGATGTAAGCCCAT         ATGATCACAGTCGTGTTAAACT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 124960 TACAGAGATGTAAGCCCATGTA...CAGATGATCACAGTCGTGTTAAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCAAAATGCTGAGAATGATTATATTAATGCCAGTTTAGTTGACATAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147273 GCAAAATGCTGAGAATGATTATATTAATGCCAGTTTAGTTGACATAGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGCACAAAGGAGTTACATCTTAACACAG         GGTCCACTTCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 147323 AGGCACAAAGGAGTTACATCTTAACACAGGCA...CAGGGTCCACTTCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AACACATGCTGCCATTTCTGGCTTATGGTTTGGCAGCAGAAGACCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153113 AACACATGCTGCCATTTCTGGCTTATGGTTTGGCAGCAGAAGACCAAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTTGTCATGCTGAACCGCATTGTGGAGAAAGAATCG         GTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 153163 AGTTGTCATGCTGAACCGCATTGTGGAGAAAGAATCGGTG...TAGGTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AATGTGCACAGTACTGGCCAACAGATGACCAAGAGATGCTGTTTAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158202 AATGTGCACAGTACTGGCCAACAGATGACCAAGAGATGCTGTTTAAAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACAGGATTCAGTGTGAAGCTCTTGTCAGAAGATGTGAAGTCGTATTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158252 ACAGGATTCAGTGTGAAGCTCTTGTCAGAAGATGTGAAGTCGTATTATAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGTACATCTACTACAATTAGAAAATATCAAT         AGTGGTGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 158302 AGTACATCTACTACAATTAGAAAATATCAATGTA...TAGAGTGGTGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCAGAACAATATCTCACTTTCATTATACTACCTGGCCAGATTTTGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166787 CCAGAACAATATCTCACTTTCATTATACTACCTGGCCAGATTTTGGAGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCTGAATCACCAGCTTCATTTCTCAATTTCTTGTTTAAAGTGAGAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166837 CCTGAATCACCAGCTTCATTTCTCAATTTCTTGTTTAAAGTGAGAGAATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGGCTCCTTGAACCCTGACCATGGGCCTGCGGTGATCCACTGTAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166887 TGGCTCCTTGAACCCTGACCATGGGCCTGCGGTGATCCACTGTAGTGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCATTGGGCGCTCTGGCACCTTCTCTCTGGTAGACACTTGTCTTGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166937 GCATTGGGCGCTCTGGCACCTTCTCTCTGGTAGACACTTGTCTTGTTTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706          ATGGAAAAAGGAGATGATATTAACATAAAACAAGTGTTACT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166987 GTA...CAGATGGAAAAAGGAGATGATATTAACATAAAACAAGTGTTACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GAACATGAGAAAATACCGAATGGGTCTTATTCAGACCCCAGATCAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169828 GAACATGAGAAAATACCGAATGGGTCTTATTCAGACCCCAGATCAACTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GATTCTCATACATGGCTATAATAGAAGGAGCAAAATGTATAAAGGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169878 GATTCTCATACATGGCTATAATAGAAGGAGCAAAATGTATAAAGGGAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCTAGTATACAG         AAACGATGGAAAGAACTTTCTAAGGAAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 169928 TCTAGTATACAGGTA...TAGAAACGATGGAAAGAACTTTCTAAGGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTTATCTCCTGCCTTTGATCATTCACCAAACAAAATAATGACTGAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182020 CTTATCTCCTGCCTTTGATCATTCACCAAACAAAATAATGACTGAAAAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACAATGGGAACAGAATAGGTCTAGAAGAAGAAAAACTGACAGGTGACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182070 ACAATGGGAACAGAATAGGTCTAGAAGAAGAAAAACTGACAGGTGACCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TGTACAGGACTTTCCTCTAAAATGCAAGATACAATGGAGGAGAACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182120 TGTACAGGACTTTCCTCTAAAATGCAAGATACAATGGAGGAGAACAGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAG         TGCTCTACGGAAACGTATTCGAGAGGACAGAAAGGCCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182170 GAGGTA...TAGTGCTCTACGGAAACGTATTCGAGAGGACAGAAAGGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CCACAGCTCAGAAGGTGCAGCAGATGAAACAGAGGCTAAATGAGAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189695 CCACAGCTCAGAAGGTGCAGCAGATGAAACAGAGGCTAAATGAGAATGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CGAAAAAGAAAAAGGTGGTTATATTGGCAACCTATTCTCACTAAGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189745 CGAAAAAGAAAAAGGTGGTTATATTGGCAACCTATTCTCACTAAGATGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GTTTATGTCAGTCATTTTGGTTGGCGCTTTTGTTGGCTGGACACTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189795 GTTTATGTCAGTCATTTTGGTTGGCGCTTTTGTTGGCTGGACACTGTTTT

   1300     .    :    .
   1229 TTCAGCAAAATGCCCTA
        |||||||||||||||||
 189845 TTCAGCAAAATGCCCTA