seq1 = pF1KE0929.tfa, 1155 bp
seq2 = pF1KE0929/gi568815587r_67531608.tfa (gi568815587r:67531608_67735266), 203659 bp

>pF1KE0929 1155
>gi568815587r:67531608_67735266 (Chr11)

(complement)

1-275  (100000-100271)   98% ->
276-377  (100350-100451)   100% ->
378-549  (100907-101078)   100% ->
550-705  (102164-102319)   100% ->
706-773  (102597-102664)   100% ->
774-868  (102855-102949)   100% ->
869-1155  (103373-103659)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCTTCCTATCTGCTGGCCTCGGCATACTTGCACCCTCAGAGAC
        |---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A   CAGCCTTCCTATCTGCTGGCCTCGGCATACTTGCACCCTCAGAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCCCCTACCTACAACCAGCTCTGGCTGGGAGCCCCGGCTGGGGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100047 CTACCCCCTACCTACAACCAGCTCTGGCTGGGAGCCCCGGCTGGGGTCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATTCCCATCAGGCCCTTGCACCAGCTCTACTGGGGCCCAAGCTGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100097 CATTCCCATCAGGCCCTTGCACCAGCTCTACTGGGGCCCAAGCTGTGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCCCACTGGGCAGGGCCCCAAGAACCCACGTGTGTCCAGAGTGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100147 GAGCCCACTGGGCAGGGCCCCAAGAACCCACGTGTGTCCAGAGTGACAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAGCTGGAGATGAAGCCTCTGTGGGAGGAATTCAACCAGCTGGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100197 TCAGCTGGAGATGAAGCCTCTGTGGGAGGAATTCAACCAGCTGGGCACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGATGATCGTCACCAAGGCAGGCAG         GAGGATGTTCCCCCCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100247 AGATGATCGTCACCAAGGCAGGCAGGTG...CAGGAGGATGTTCCCCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCCAGGTGAAGATCCTGGGCATGGACTCCCTGGCCGACTACGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100366 TTCCAGGTGAAGATCCTGGGCATGGACTCCCTGGCCGACTACGCCCTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATGGACTTCATCCCCCTGGACGACAAGAGATACAG         GTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100416 CATGGACTTCATCCCCCTGGACGACAAGAGATACAGGTG...CAGGTATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTTCCACAGCTCGGCCTGGCTGGTGGCGGGCAAGGCAGACCCAGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100912 CCTTCCACAGCTCGGCCTGGCTGGTGGCGGGCAAGGCAGACCCAGCCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCTGGCCGCGTGCACTTCCACCCCGACTCGCCAGCCAAGGGTGCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100962 CCTGGCCGCGTGCACTTCCACCCCGACTCGCCAGCCAAGGGTGCCCAGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GATGCGCCAGATTGTGTCCTTTGACAAGCTCAAGCTGACCAACAACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101012 GATGCGCCAGATTGTGTCCTTTGACAAGCTCAAGCTGACCAACAACCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGATGACAATGGCCAC         ATCATTCTCAACTCTATGCACCGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101062 TGGATGACAATGGCCACGTG...CAGATCATTCTCAACTCTATGCACCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACCAGCCCCGTTTCCACGTGGTCTTCGTGGACCCACGCAAGGACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102188 TACCAGCCCCGTTTCCACGTGGTCTTCGTGGACCCACGCAAGGACAGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCGCTATGCCCAGGAGAACTTCAAGTCCTTCATCTTCACAGAGACCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102238 GCGCTATGCCCAGGAGAACTTCAAGTCCTTCATCTTCACAGAGACCCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCACAGCAGTGACAGCCTATCAGAACCACAGG         ATCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102288 TCACAGCAGTGACAGCCTATCAGAACCACAGGGTG...CAGATCACCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGAAAATCGCCAGCAACCCTTTTGCCAAAGGCTTTAGAGAGAGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102606 CTGAAAATCGCCAGCAACCCTTTTGCCAAAGGCTTTAGAGAGAGTGACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGACTCCTG         GCCTGTGGCCCCACGGCCCCTGCTCAGTGTCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102656 GGACTCCTGGTA...CAGGCCTGTGGCCCCACGGCCCCTGCTCAGTGTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAGCCCGGAGTCACAGCAGCCTCAGTCCCTGTGTGCTGAAGGGTGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102887 CAGCCCGGAGTCACAGCAGCCTCAGTCCCTGTGTGCTGAAGGGTGCCACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACAGGGAGAAAG         ACCCCAACAAAGCTTCAGCTTCCACCTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 102937 GACAGGGAGAAAGGTA...CAGACCCCAACAAAGCTTCAGCTTCCACCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAAGACCCCTGCTTGGCTCCATCATCAGCTGCTGCCCCCACCTGAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103401 CAAGACCCCTGCTTGGCTCCATCATCAGCTGCTGCCCCCACCTGAGGTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGCTGGCCCCGGCCACCTACAGGCCTGTCACGTATCAGAGCCTGTACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103451 TGCTGGCCCCGGCCACCTACAGGCCTGTCACGTATCAGAGCCTGTACTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GGAGCCCCGAGCCACCTAGGGATCCCAAGGACCCGACCAGCACCATACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103501 GGAGCCCCGAGCCACCTAGGGATCCCAAGGACCCGACCAGCACCATACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCTCCCCAACATCCGGGCTGATAGGGATCAAGGAGGCCTGCCTCTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103551 CCTCCCCAACATCCGGGCTGATAGGGATCAAGGAGGCCTGCCTCTCCCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CTGGGCTGGGGCTCCTGTCCCCCACTGTGGTGTGCCTGGGGCCTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103601 CTGGGCTGGGGCTCCTGTCCCCCACTGTGGTGTGCCTGGGGCCTGGCCAG

   1200     .
   1147 GACTCCCAG
        |||||||||
 103651 GACTCCCAG