seq1 = pF1KE0924.tfa, 1029 bp
seq2 = pF1KE0924/gi568815591r_127511067.tfa (gi568815591r:127511067_127715520), 204454 bp

>pF1KE0924 1029
>gi568815591r:127511067_127715520 (Chr7)

(complement)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-336  (100426-100641)   99% ->
337-412  (100964-101039)   100% ->
413-538  (101640-101765)   99% ->
539-621  (101989-102071)   100% ->
622-691  (102430-102499)   100% ->
692-747  (103521-103576)   100% ->
748-889  (103845-103986)   100% ->
890-1029  (104315-104454)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCAGCTTGGGGGGCTCTTTGTGAATGGCCGGCCCCTGCCTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCAGCTTGGGGGGCTCTTTGTGAATGGCCGGCCCCTGCCTCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACCCGGCAGCAGATTGTGCGGCTAGCAGTCAGTGGAATGCGGCCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACCCGGCAGCAGATTGTGCGGCTAGCAGTCAGTGGAATGCGGCCCTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATCTCACGGATCCTTAAG         GTATCTAATGGCTGTGTGAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 ACATCTCACGGATCCTTAAGGTA...CAGGTATCTAATGGCTGTGTGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGATCCTAGGGCGTTACTACCGCACAGGTGTCTTGGAGCCAAAGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100447 AAGATCCTAGGGCGTTACTACCGCACAGGTGTCTTGGAGCCAAAGGGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGGGGAAGCAAGCCACGGCTGGCTACACCCCCTGTGGTGGCTCGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100497 TGGGGGAAGCAAGCCACGGCTGGCTACACCCCCTGTGGTGGCTCGAATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCAGCTGAAGGGTGAGTGTCCAGCCCTCTTTGCCTGGGAAATCCAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100547 CCCAGCTGAAGGGTGAGTGTCCAGCCCTCTTTGCCTGGGAAATCCAACGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAACTTTGTGCTGAAGGGCTTTGCACCCAGGACAAGACTCCCAGT     
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100597 CAGCTTTGTGCTGAAGGGCTTTGCACCCAGGACAAGACTCCCAGTGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337     GTCTCCTCCATCAACCGAGTCCTGCGGGCATTACAGGAGGACCAGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100647 .CAGGTCTCCTCCATCAACCGAGTCCTGCGGGCATTACAGGAGGACCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GACTACCGTGCACACGGCTCAGGTCACCAG         CTGTTTTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101010 GACTACCGTGCACACGGCTCAGGTCACCAGGTG...CAGCTGTTTTGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCAGCTGTCCTCACTCCCCATAGTGGTTCTGAGACTCCCCGGGGTACCCA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 101651 CCAGCTGTCCTCACTCCCCATAGTGGCTCTGAGACTCCCCGGGGTACCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCCAGGGACCGGCCACCGGAATCGGACTATCTTCTCCCCAAGCCAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CCCAGGGACCGGCCACCGGAATCGGACTATCTTCTCCCCAAGCCAAGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGCACTGGAGAAAG         AGTTCCAGCGTGGGCAGTATCCTGAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101751 AGGCACTGGAGAAAGGTG...CAGAGTTCCAGCGTGGGCAGTATCCTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCAGTGGCCCGTGGAAAGCTGGCTACTGCCACCTCTCTGCCTGAGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102015 TCAGTGGCCCGTGGAAAGCTGGCTACTGCCACCTCTCTGCCTGAGGACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGTGAGG         GTCTGGTTTTCCAACAGAAGAGCCAAATGGCGTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102065 GGTGAGGGTG...CAGGTCTGGTTTTCCAACAGAAGAGCCAAATGGCGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GGCAAGAGAAGCTCAAGTGGGAAATGCAGCTGCCAG         GTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102464 GGCAAGAGAAGCTCAAGTGGGAAATGCAGCTGCCAGGTG...TAGGTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCCCAGGGGCTGACTGTACCAAGGGTTGCCCCAGGAATCATCTCTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103526 TCCCAGGGGCTGACTGTACCAAGGGTTGCCCCAGGAATCATCTCTGCACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 G         CAGTCCCCTGGCAGTGTGCCCACAGCAGCCCTGCCTGCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103576 GGTA...TAGCAGTCCCCTGGCAGTGTGCCCACAGCAGCCCTGCCTGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGGAACCACTGGGTCCCTCCTGCTATCAGCTGTGCTGGGCAACAGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103885 TGGAACCACTGGGTCCCTCCTGCTATCAGCTGTGCTGGGCAACAGCACCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAAAGGTGTCTGAGTGACACCCCACCTAAAGCCTGTCTCAAGCCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103935 GAAAGGTGTCTGAGTGACACCCCACCTAAAGCCTGTCTCAAGCCCTGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GG         GCCACTTGCCCCCACAGCCGAATTCCCTGGACTCAGGAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103985 GGGTA...CAGGCCACTTGCCCCCACAGCCGAATTCCCTGGACTCAGGAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGCTTTGCCTTCCTTGCCCTTCCTCCCACTGTCCCCTGGCCAGTCTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 104354 TGCTTTGCCTTCCTTGCCCTTCCTCCCACTGTCACCTGGCCAGTCTTAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GGCTCTCAGGCCCTGCTCTGGCCTGGCTGCCCACTACTGTATGGCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104404 GGCTCTCAGGCCCTGCTCTGGCCTGGCTGCCCACTACTGTATGGCTTGGA

   1100 
   1029 A
        |
 104454 A