seq1 = pF1KE0922.tfa, 2019 bp
seq2 = pF1KE0922/gi568815593r_151001451.tfa (gi568815593r:151001451_151240248), 238798 bp

>pF1KE0922 2019
>gi568815593r:151001451_151240248 (Chr5)

(complement)

14-109  (100001-100096)   100% ->
110-204  (100802-100896)   100% ->
205-318  (101458-101571)   100% ->
319-409  (102928-103018)   100% ->
410-489  (103914-103993)   100% ->
490-546  (105766-105822)   100% ->
547-640  (107062-107155)   100% ->
641-736  (107678-107773)   100% ->
737-795  (108960-109018)   100% ->
796-918  (110720-110842)   100% ->
919-977  (112010-112068)   100% ->
978-1056  (113769-113847)   100% ->
1057-1138  (115882-115963)   100% ->
1139-1233  (117238-117332)   100% ->
1234-1347  (117989-118102)   100% ->
1348-1438  (120859-120949)   100% ->
1439-1518  (122412-122491)   100% ->
1519-1572  (123069-123122)   100% ->
1573-1590  (129605-129622)   100% ->
1591-1684  (130403-130496)   100% ->
1685-1780  (131699-131794)   100% ->
1781-1839  (134946-135004)   100% ->
1840-1962  (136557-136679)   100% ->
1963-2019  (138742-138798)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     14 CACAGGGTGCCAAGTACCGGGGCTCCATCCATGACTTCCCAGGCTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CACAGGGTGCCAAGTACCGGGGCTCCATCCATGACTTCCCAGGCTTTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     64 CCCAACCAGGATGCCGAGGCTCTGTACACTGCCATGAAGGGCTTTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 CCCAACCAGGATGCCGAGGCTCTGTACACTGCCATGAAGGGCTTTGGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    110      GCAGTGACAAGGAGGCCATACTGGACATAATCACCTCACGGAGCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGGCAGTGACAAGGAGGCCATACTGGACATAATCACCTCACGGAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    155 ACAGGCAGAGGCAGGAGGTCTGCCAGAGCTACAAGTCCCTCTACGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100847 ACAGGCAGAGGCAGGAGGTCTGCCAGAGCTACAAGTCCCTCTACGGCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    205          GACCTCATTGCTGATTTAAAGTATGAATTGACGGGCAAGTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100897 GTA...CAGGACCTCATTGCTGATTTAAAGTATGAATTGACGGGCAAGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    246 TGAACGGTTGATTGTGGGCCTGATGAGGCCACCTGCCTATTGTGATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101499 TGAACGGTTGATTGTGGGCCTGATGAGGCCACCTGCCTATTGTGATGCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    296 AAGAAATTAAAGATGCCATCTCG         GGCATTGGCACTGATGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 101549 AAGAAATTAAAGATGCCATCTCGGTA...CAGGGCATTGGCACTGATGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337 AAGTGCCTCATTGAGATCTTGGCTTCCCGGACCAATGAGCAGATGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102946 AAGTGCCTCATTGAGATCTTGGCTTCCCGGACCAATGAGCAGATGCACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    387 GCTGGTGGCAGCATACAAAGATG         CCTACGAGCGGGACCTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102996 GCTGGTGGCAGCATACAAAGATGGTG...CAGCCTACGAGCGGGACCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    428 AGGCTGACATCATCGGCGACACCTCTGGCCACTTCCAGAAGATGCTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103932 AGGCTGACATCATCGGCGACACCTCTGGCCACTTCCAGAAGATGCTTGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    478 GTCCTGCTCCAG         GGAACCAGGGAGGAGGATGACGTAGTGAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103982 GTCCTGCTCCAGGTT...CAGGGAACCAGGGAGGAGGATGACGTAGTGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    519 CGAGGACCTGGTACAACAGGATGTCCAG         GACCTATACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105795 CGAGGACCTGGTACAACAGGATGTCCAGGTA...CAGGACCTATACGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    560 CAGGGGAACTGAAATGGGGAACAGATGAAGCCCAGTTCATTTACATCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107075 CAGGGGAACTGAAATGGGGAACAGATGAAGCCCAGTTCATTTACATCTTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    610 GGAAATCGCAGCAAGCAGCATCTTCGGTTGG         TGTTCGATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 107125 GGAAATCGCAGCAAGCAGCATCTTCGGTTGGGTA...CAGTGTTCGATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTATCTGAAGACCACAGGGAAGCCGATTGAAGCCAGCATCCGAGGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107688 GTATCTGAAGACCACAGGGAAGCCGATTGAAGCCAGCATCCGAGGGGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGTCTGGGGACTTTGAGAAGCTAATGCTGGCCGTAG         TGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 107738 TGTCTGGGGACTTTGAGAAGCTAATGCTGGCCGTAGGTA...CAGTGAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TGTATCCGGAGCACCCCGGAATATTTTGCTGAAAGGCTCTTCAAGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108965 TGTATCCGGAGCACCCCGGAATATTTTGCTGAAAGGCTCTTCAAGGCTAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GAAG         GGCCTGGGGACTCGGGACAACACCCTGATCCGCATCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109015 GAAGGTG...CAGGGCCTGGGGACTCGGGACAACACCCTGATCCGCATCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGGTCTCCCGTAGTGAGTTGGACATGCTCGACATTCGGGAGATCTTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110757 TGGTCTCCCGTAGTGAGTTGGACATGCTCGACATTCGGGAGATCTTCCGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ACCAAGTATGAGAAGTCCCTCTACAGCATGATCAAG         AATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110807 ACCAAGTATGAGAAGTCCCTCTACAGCATGATCAAGGTC...CAGAATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CACCTCTGGCGAGTACAAGAAGACTCTGCTGAAGCTGTCTGGGGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112015 CACCTCTGGCGAGTACAAGAAGACTCTGCTGAAGCTGTCTGGGGGAGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ATGA         TGCTGCTGGCCAGTTCTTCCCGGAGGCAGCGCAGGTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112065 ATGAGTA...CAGTGCTGCTGGCCAGTTCTTCCCGGAGGCAGCGCAGGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GCCTATCAGATGTGGGAACTTAGTGCAGTGGCCCGAGTAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 113806 GCCTATCAGATGTGGGAACTTAGTGCAGTGGCCCGAGTAGAGGTC...CA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1057  CTGAAGGGAACTGTGCGCCCAGCCAATGACTTCAACCCTGACGCAGATG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115881 GCTGAAGGGAACTGTGCGCCCAGCCAATGACTTCAACCCTGACGCAGATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CCAAAGCGCTGCGGAAAGCCATGAAGGGACTCG         GGACTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 115931 CCAAAGCGCTGCGGAAAGCCATGAAGGGACTCGGTA...CAGGGACTGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAAGACACAATCATCGATATCATCACGCACCGCAGCAATGTCCAGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117246 GAAGACACAATCATCGATATCATCACGCACCGCAGCAATGTCCAGCGGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GCAGATCCGGCAGACCTTCAAGTCTCACTTTGGCCGG         GACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 117296 GCAGATCCGGCAGACCTTCAAGTCTCACTTTGGCCGGGTA...CAGGACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TAATGACTGACCTGAAGTCTGAGATCTCTGGAGACCTGGCAAGGCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117993 TAATGACTGACCTGAAGTCTGAGATCTCTGGAGACCTGGCAAGGCTGATT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CTGGGGCTCATGATGCCACCGGCCCATTACGATGCCAAGCAGTTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118043 CTGGGGCTCATGATGCCACCGGCCCATTACGATGCCAAGCAGTTGAAGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGCCATGGAG         GGAGCCGGCACAGATGAAAAGGCTCTTATTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 118093 GGCCATGGAGGTA...CAGGGAGCCGGCACAGATGAAAAGGCTCTTATTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AAATCCTGGCCACTCGGACCAATGCTGAAATCCGGGCCATCAATGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120890 AAATCCTGGCCACTCGGACCAATGCTGAAATCCGGGCCATCAATGAGGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 TATAAGGAGG         ACTATCACAAGTCCCTGGAGGATGCTCTGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 120940 TATAAGGAGGGTG...CAGACTATCACAAGTCCCTGGAGGATGCTCTGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CTCAGACACATCTGGCCACTTCAGGAGGATCCTCATTTCTCTGGCCACG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 122443 CTCAGACACATCTGGCCACTTCAGGAGGATCCTCATTTCTCTGGCCACGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1519         GGGCATCGTGAGGAGGGAGGAGAAAACCTGGACCAGGCACGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122493 TG...CAGGGGCATCGTGAGGAGGGAGGAGAAAACCTGGACCAGGCACGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GAAGATGCCCAG         GTGGCTGCTGAGATCTTG         GA
        ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||>>>...>>>||
 123111 GAAGATGCCCAGGTA...CAGGTGGCTGCTGAGATCTTGGTG...CAGGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AATAGCAGACACACCTAGTGGAGACAAAACTTCCTTGGAGACACGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130405 AATAGCAGACACACCTAGTGGAGACAAAACTTCCTTGGAGACACGTTTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TGACGATCCTGTGTACCCGGAGCTATCCGCACCTCCGGAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 130455 TGACGATCCTGTGTACCCGGAGCTATCCGCACCTCCGGAGAGGTG...CA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1685  TCTTCCAGGAGTTCATCAAGATGACCAACTATGACGTGGAGCACACCAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131698 GTCTTCCAGGAGTTCATCAAGATGACCAACTATGACGTGGAGCACACCAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CAAGAAGGAGATGTCTGGGGATGTCAGGGATGCATTTGTGGCCATTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 131748 CAAGAAGGAGATGTCTGGGGATGTCAGGGATGCATTTGTGGCCATTGGTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1781       TTCAAAGTGTCAAGAACAAGCCTCTCTTCTTTGCCGACAAACTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131798 ...CAGTTCAAAGTGTCAAGAACAAGCCTCTCTTCTTTGCCGACAAACTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TACAAATCCATGAAG         GGTGCTGGCACAGATGAGAAGACTCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 134990 TACAAATCCATGAAGGTA...CAGGGTGCTGGCACAGATGAGAAGACTCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GACCAGGATCATGGTATCCCGCAGTGAGATTGACCTGCTCAACATCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136583 GACCAGGATCATGGTATCCCGCAGTGAGATTGACCTGCTCAACATCCGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GGGAATTCATTGAGAAATATGACAAGTCTCTCCACCAAGCCATTGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 136633 GGGAATTCATTGAGAAATATGACAAGTCTCTCCACCAAGCCATTGAGGTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1963       GGTGACACCTCCGGAGACTTCCTGAAGGCCTTGCTGGCTCTCTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136683 ...CAGGGTGACACCTCCGGAGACTTCCTGAAGGCCTTGCTGGCTCTCTG

   2200     .    :
   2007 TGGTGGTGAGGAC
        |||||||||||||
 138786 TGGTGGTGAGGAC