seq1 = pF1KE0915.tfa, 789 bp
seq2 = pF1KE0915/gi568815584r_22926092.tfa (gi568815584r:22926092_23134881), 208790 bp

>pF1KE0915 789
>gi568815584r:22926092_23134881 (Chr14)

(complement)

1-198  (100001-100198)   100% ->
199-505  (101208-101514)   100% ->
506-789  (108507-108790)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTTGCCAGCGTGTTGGAGAGACCGCTACCGGTGAACCAGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCTTGCCAGCGTGTTGGAGAGACCGCTACCGGTGAACCAGCGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTTTTCGGACTTGGGGGTCGTGCAGATCTGCTGGATCTAGGTCCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTTTTCGGACTTGGGGGTCGTGCAGATCTGCTGGATCTAGGTCCAGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCTCAGTGATGGTCTGAGCCTGGCCGCGCCAGGCTGGGGTGTCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCTCAGTGATGGTCTGAGCCTGGCCGCGCCAGGCTGGGGTGTCCCAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCCAGGAATCGAAATGCTTCATGGAACAACCACCCTGGCCTTCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100151 GAGCCAGGAATCGAAATGCTTCATGGAACAACCACCCTGGCCTTCAAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199        TTCCGCCATGGAGTCATAGTTGCAGCTGACTCCAGGGCTACAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 G...CAGTTCCGCCATGGAGTCATAGTTGCAGCTGACTCCAGGGCTACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGGGTGCTTACATTGCCTCCCAGACGGTGAAGAAGGTGATAGAGATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CGGGTGCTTACATTGCCTCCCAGACGGTGAAGAAGGTGATAGAGATCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCATACCTGCTAGGCACCATGGCTGGGGGCGCAGCGGATTGCAGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCATACCTGCTAGGCACCATGGCTGGGGGCGCAGCGGATTGCAGCTTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAACGGCTGTTGGCTCGGCAATGTCGAATCTATGAGCTTCGAAATAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGAACGGCTGTTGGCTCGGCAATGTCGAATCTATGAGCTTCGAAATAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AACGCATCTCTGTAGCAGCTGCCTCCAAACTGCTTGCCAACATGGTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AACGCATCTCTGTAGCAGCTGCCTCCAAACTGCTTGCCAACATGGTGTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGTACAAAGGCATGGGGCTGTCCATGGGCACCATGATCTGTGGCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CAGTACAAAGGCATGGGGCTGTCCATGGGCACCATGATCTGTGGCTGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TAAGAGAGGCCCTG         GCCTCTACTACGTGGACAGTGAAGGGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101501 TAAGAGAGGCCCTGGTG...CAGGCCTCTACTACGTGGACAGTGAAGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACCGGATTTCAGGGGCCACCTTCTCTGTAGGTTCTGGCTCTGTGTATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108534 ACCGGATTTCAGGGGCCACCTTCTCTGTAGGTTCTGGCTCTGTGTATGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TATGGGGTCATGGATCGGGGCTATTCCTATGACCTGGAAGTGGAGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108584 TATGGGGTCATGGATCGGGGCTATTCCTATGACCTGGAAGTGGAGCAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTATGATCTGGCCCGTCGAGCCATCTACCAAGCCACCTACAGAGATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108634 CTATGATCTGGCCCGTCGAGCCATCTACCAAGCCACCTACAGAGATGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACTCAGGAGGTGCAGTCAACCTCTACCACGTGCGGGAGGATGGCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108684 ACTCAGGAGGTGCAGTCAACCTCTACCACGTGCGGGAGGATGGCTGGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CGAGTCTCCAGTGACAATGTGGCTGATCTACATGAGAAGTATAGTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108734 CGAGTCTCCAGTGACAATGTGGCTGATCTACATGAGAAGTATAGTGGCTC

    800     .
    783 TACCCCC
        |||||||
 108784 TACCCCC