seq1 = pF1KE0912.tfa, 738 bp
seq2 = pF1KE0912/gi568815584f_60409399.tfa (gi568815584f:60409399_60611249), 201851 bp

>pF1KE0912 738
>gi568815584f:60409399_60611249 (Chr14)

1-572  (100001-100572)   99% ->
573-738  (101686-101851)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCCAGCTGCCCATCTTGAATTTCAGCCCCCAGCAAGTGGCCGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCCAGCTGCCCATCTTGAATTTCAGCCCCCAGCAAGTGGCCGGGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGTGAGACCCTGGAAGAGAGCGGCGATGTGGAGCGCCTGGGTCGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGTGAGACCCTGGAAGAGAGCGGCGATGTGGAGCGCCTGGGTCGCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTGGTCGCTGCCCGTGGCCCCTGCGGCCTGCGAGGCCCTCAACAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTGGTCGCTGCCCGTGGCCCCTGCGGCCTGCGAGGCCCTCAACAAGAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGTCGGTGCTACGCGCACGAGCCATCGTGGCCTTTCACGGTGGCAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGTCGGTGCTACGCGCACGAGCCATCGTGGCCTTTCACGGTGGCAACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCGAGCTCTATCATATCCTGGAAAACCACAAGTTCACCAAGGAGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCGAGCTCTATCATATCCTGGAAAACCACAAGTTCACCAAGGAGTCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACGCCAAGCTGCAGGCGCTGTGGCTTGAAGCACACTACCAGGAGGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACGCCAAGCTGCAGGCGCTGTGGCTTGAAGCACACTACCAGGAGGCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGCTGCGTGGAAGACCCCTGGGACCTGTGGACAAGTACCGAGTAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGCTGCGTGGAAGACCCCTGGGACCTGTGGACAAGTACCGAGTAAGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAGTTCCCGCTGCCGCGCACCATTTGGGACGGCGAACAGAAGACACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAAGTTCCCGCTGCCGCGCACCATTTGGGACGGCGAACAGAAGACACACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTTCAAGGAGCGCACGCGGAACCTGCTACGCGAGTGGTACCTGCAGGAT
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTTCAAGGAGCGCACGCGGCACCTGCTACGCGAGTGGTACCTGCAGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCATACCCTAACCCCAGCAAAAAACGTGAGCTCGCCCAGGCAACCGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCATACCCTAACCCCAGCAAAAAACGTGAGCTCGCCCAGGCAACCGGACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GACCCCTACGCAGGTGGGCAACTGGTTCAAAAACCGCCGACAAAGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GACCCCTACGCAGGTGGGCAACTGGTTCAAAAACCGCCGACAAAGGGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GAGCGGCTGCAGCCAAGAACAG         ACTCCAGCAGCAGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100551 GAGCGGCTGCAGCCAAGAACAGGTC...TAGACTCCAGCAGCAGGTCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCACAGGGTTCCGGGCGGGCACTACGGGCGGAGGGCGACGGCACGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101705 TCACAGGGTTCCGGGCGGGCACTACGGGCGGAGGGCGACGGCACGCCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGTGCTGGGCGTCGCCACCAGCCCGGCCGCCAGTCTATCCAGCAAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101755 GGTGCTGGGCGTCGCCACCAGCCCGGCCGCCAGTCTATCCAGCAAGGCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    692 CCACTTCAGCCATCTCCATCACGTCCAGCGACAGCGAGTGCGACATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101805 CCACTTCAGCCATCTCCATCACGTCCAGCGACAGCGAGTGCGACATC