seq1 = pF1KE0911.tfa, 717 bp
seq2 = pF1KE0911/gi568815584r_33826959.tfa (gi568815584r:33826959_34050752), 223794 bp

>pF1KE0911 717
>gi568815584r:33826959_34050752 (Chr14)

(complement)

1-357  (100001-100357)   100% ->
358-477  (119538-119657)   100% ->
478-614  (121541-121677)   100% ->
615-688  (123720-123793)   100% ->
689-717  (124831-124859)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCTGGGACACATCATGAGGCTGGACCTGGAGAAAATTGCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCTGGGACACATCATGAGGCTGGACCTGGAGAAAATTGCCCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTACATCGTGCCCTGTCTGCACGAGGTGGGCTTCTGCTACCTGGACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTACATCGTGCCCTGTCTGCACGAGGTGGGCTTCTGCTACCTGGACAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTGGGCGAGGTGGTGGGCGACTGCGTCCTGGAGCGCGTCAAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTGGGCGAGGTGGTGGGCGACTGCGTCCTGGAGCGCGTCAAGCAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACTGCACCGGGGCCCTGCGGGACGGCCAGCTGGCGGGGCCGCGCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACTGCACCGGGGCCCTGCGGGACGGCCAGCTGGCGGGGCCGCGCGCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTCTCCAAGCGACACCTGCGGGGCGACCAGATCACGTGGATCGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTCTCCAAGCGACACCTGCGGGGCGACCAGATCACGTGGATCGGGGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACGAGGAGGGCTGCGAGGCCATCAGCTTCCTCCTGTCCCTCATCGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACGAGGAGGGCTGCGAGGCCATCAGCTTCCTCCTGTCCCTCATCGACAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTCCTCTACTGCGGGAGCCGGCTGGGCAAATACTACGTCAAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGTCCTCTACTGCGGGAGCCGGCTGGGCAAATACTACGTCAAGGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCTAAG         GCAATGGTGGCTTGCTATCCGGGAAATGGAACAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCTAAGGTA...TAGGCAATGGTGGCTTGCTATCCGGGAAATGGAACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTTATGTTCGCCACGTGGACAACCCCAACGGTGATGGTCGCTGCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119572 GTTATGTTCGCCACGTGGACAACCCCAACGGTGATGGTCGCTGCATCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGCATCTACTATCTGAACAAGAATTGGGATGCCAAG         CTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 119622 TGCATCTACTATCTGAACAAGAATTGGGATGCCAAGGTA...CAGCTACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGGTGGGATCCTGCGGATATTTCCAGAGGGGAAATCATTCATAGCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121546 TGGTGGGATCCTGCGGATATTTCCAGAGGGGAAATCATTCATAGCAGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGAGCCCATTTTTGACAGACTCCTGTTCTTCTGGTCAGATCGTAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121596 TGGAGCCCATTTTTGACAGACTCCTGTTCTTCTGGTCAGATCGTAGGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCACACGAAGTGCAGCCCTCTTACGCAACCAG         ATATGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 121646 CCACACGAAGTGCAGCCCTCTTACGCAACCAGGTA...CAGATATGCTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GACTGTCTGGTACTTTGATGCTGAAGAAAGGGCAGAAGCCAAAAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123729 GACTGTCTGGTACTTTGATGCTGAAGAAAGGGCAGAAGCCAAAAAGAAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCAGGAATTTAACTA         GGAAAACTGAATCTGCCCTCACTGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123779 TCAGGAATTTAACTAGTA...CAGGGAAAACTGAATCTGCCCTCACTGAA

    750 
    715 GAC
        |||
 124857 GAC