seq1 = pF1KE0907.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KE0907/gi568815581r_49324272.tfa (gi568815581r:49324272_49524922), 200651 bp

>pF1KE0907 651
>gi568815581r:49324272_49524922 (Chr17)

(complement)

1-651  (100001-100651)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACTGTCGAACCGGAAACCACCCCTACTCCTAATCCCCCGACTAC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACCGTCGAACCGGAAACCACCCCTACTCCTAATCCCCCGACTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAAGAGGAGAAAACGGAATCTAATCAGGAGGTTGCTAACCCAGAACACT
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAAAAGGAGAAAACGGAATCTAATCAGGAGGTTGCTAACCCAGAACACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATATTAAACATCCCCTACAGAACAGATGGGCACTCTGGTTTTTTAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATATTAAACATCCCCTACAGAACAGATGGGCACTCTGGTTTTTTAAAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATAAAAGCAAAACTTGGCAAGCAAACCTGCGGCTGATCTCCAAGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
 100151 GATAAAAGCAAAACTTGGCAAGCAAACTTGTGGCTGATCTCCAAGTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TACTGTTGAAGACTTTTGGGCTCTGTACAACCATATCCAGTTGTCTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TACTGTTGAAGACTTTTGGGCTCTGTACAACCATATCCAGTTGTCTAGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTTAATGCCTGGCTGTGACTACTCACTTTTTAAGGATGGTATTGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTTAATGCCTGGCTGTGACTACTCACTTTTTAAGGATGGTATTGAGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTGGGAAGATGAGAAAAACAAACGGGGAGGACGATGGCTAATTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTGGGAAGATGAGAAAAACAAACGGGGAGGACGATGGCTAATTACATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAACAAACAGCAGAGACGAAGTGACCTCGATCGCTTTTGGCTAGAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAACAAACAGCAGAGACGAAGTGACCTCGATCGCTTTTGGCTAGAGACAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTCTGTGCCTTATTGGAGAATCTTTTGATGACTACAGTGATGATGTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTCTGTGCCTTATTGGAGAATCTTTTGATGACTACAGTGATGATGTATGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCGCTGTTGTTAATGTTAGAGCTAAAGGTGATAAGATAGCAATATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCGCTGTTGTTAATGTTAGAGCTAAAGGTGATAAGATAGCAATATGGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TACTGAATGTGAAAACAGAGAAGCTGTTACACATATAGGGAGGGTATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TACTGAATGTGAAAACAGAGAAGCTGTTACACATATAGGGAGGGTATACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGAAAGGTTAGGACTTCCTCCAAAGATAGTGATTGGTTATCAGTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGAAAGGTTAGGACTTCCTCCAAAGATAGTGATTGGTTATCAGTCCCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCAGACACAGCTACTAAGAGCGGCTCCACCACTAAAAATAGGTTTGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCAGACACAGCTACTAAGAGCGGCTCCACCACTAAAAATAGGTTTGTTGT

    650 
    651 T
        |
 100651 T