seq1 = pF1KE0905.tfa, 531 bp
seq2 = pF1KE0905/gi568815586r_27863347.tfa (gi568815586r:27863347_28069494), 206148 bp

>pF1KE0905 531
>gi568815586r:27863347_28069494 (Chr12)

(complement)

1-101  (100001-100101)   100% ->
102-531  (105725-106153)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCGGAGACTGGTTCAGCAGTGGAGCGTCGCGGTGTTCCTGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCGGAGACTGGTTCAGCAGTGGAGCGTCGCGGTGTTCCTGCTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACGCGGTGCCCTCCTGCGGGCGCTCGGTGGAGGGTCTCAGCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACGCGGTGCCCTCCTGCGGGCGCTCGGTGGAGGGTCTCAGCCGCCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 T         CAAAAGAGCTGTGTCTGAACATCAGCTCCTCCATGACAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTA...AAGCAAAAGAGCTGTGTCTGAACATCAGCTCCTCCATGACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAAGTCCATCCAAGATTTACGGCGACGATTCTTCCTTCACCATCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105765 GGGAAGTCCATCCAAGATTTACGGCGACGATTCTTCCTTCACCATCTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCAGAAATCCACACAGCTGAAATCAGAGCTACCTCGGAGGTGTCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105815 CGCAGAAATCCACACAGCTGAAATCAGAGCTACCTCGGAGGTGTCCCCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTCCAAGCCCTCTCCCAACACAAAGAACCACCCCGTCCGATTTGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105865 ACTCCAAGCCCTCTCCCAACACAAAGAACCACCCCGTCCGATTTGGGTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATGATGAGGGCAGATACCTAACTCAGGAAACTAACAAGGTGGAGACGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105915 GATGATGAGGGCAGATACCTAACTCAGGAAACTAACAAGGTGGAGACGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAAGAGCAGCCGCTCAAGACACCTGGGAAGAAAAAGAAAGGCAAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105965 CAAAGAGCAGCCGCTCAAGACACCTGGGAAGAAAAAGAAAGGCAAGCCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGAAACGCAAGGAGCAGGAAAAGAAAAAACGGCGAACTCGCTCTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106015 GGAAACGCAAGGAGCAGGAAAAGAAAAAACGGCGAACTCGCTCTGCCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTAGACTCTGGAGTGACTGGGAGTGGGCTAGAAGGGGACCACCTGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106065 TTAGACTCTGGAGTGACTGGGAGTGGGCTAGAAGGGGACCACCTGTCTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CACCTCCACAACGTCGCTGGAGCTCGATTCACGG AGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||-| -||-
 106115 CACCTCCACAACGTCGCTGGAGCTCGATTCACGGTAA CA