seq1 = pF1KE0902.tfa, 453 bp
seq2 = pF1KE0902/gi568815597r_11747113.tfa (gi568815597r:11747113_11947684), 200572 bp

>pF1KE0902 453
>gi568815597r:11747113_11947684 (Chr1)

(complement)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-453  (100246-100575)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTCCTTCTCCACCACCACCGTGAGCTTCCTCCTTTTACTGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTCCTTCTCCACCACCACCGTGAGCTTCCTCCTTTTACTGGCATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGCTCCTAGGTCAGACCAGAGCTAATCCCATGTACAATGCCGTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGCTCCTAGGTCAGACCAGAGCTAATCCCATGTACAATGCCGTGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGCAGACCTGATGGATTTCAAG         AATTTGCTGGACCATTTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 ACGCAGACCTGATGGATTTCAAGGTA...AAGAATTTGCTGGACCATTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGAAAAGATGCCTTTAGAAGATGAGGTCGTGCCCCCACAAGTGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100264 GAAGAAAAGATGCCTTTAGAAGATGAGGTCGTGCCCCCACAAGTGCTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAGCCGAATGAAGAAGCGGGGGCTGCTCTCAGCCCCCTCCCTGAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100314 TGAGCCGAATGAAGAAGCGGGGGCTGCTCTCAGCCCCCTCCCTGAGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCCCTGGACCGGGGAAGTCAGCCCAGCCCAGAGAGATGGAGGTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100364 CTCCCTGGACCGGGGAAGTCAGCCCAGCCCAGAGAGATGGAGGTGCCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGCGGGGCCCCTGGGACTCCTCTGATCGATCTGCCCTCCTAAAAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100414 GGGCGGGGCCCCTGGGACTCCTCTGATCGATCTGCCCTCCTAAAAAGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCTGAGGGCGCTGCTCACTGCCCCTCGGAGCCTGCGGAGATCCAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100464 GCTGAGGGCGCTGCTCACTGCCCCTCGGAGCCTGCGGAGATCCAGCTGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCGGGGGCAGGATGGACAGGATTGGAGCCCAGAGCGGACTGGGCTGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100514 TCGGGGGCAGGATGGACAGGATTGGAGCCCAGAGCGGACTGGGCTGTAAC

    450     .    :
    442 AGCTTCCGG TAC
        |||||||||-||-
 100564 AGCTTCCGGGTA