seq1 = pF1KE0901.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KE0901/gi568815592f_118805650.tfa (gi568815592f:118805650_119007611), 201962 bp

>pF1KE0901 402
>gi568815592f:118805650_119007611 (Chr6)

5-192  (99993-100179)   98% ->
193-402  (101753-101962)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      5 TTGTATT TCAGGCTGATGCACCTAATCCAGGACTCATTCCAGATGCAGA
        ||-||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99993 TT TATTCT AGGCTGATGCACCTAATCCAGGACTCATTCCAGATGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     54 TGCAGTAGGCGTAACTGTTGTGCTAATTACTTGTACCTATCGAGGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100041 TGCAGTAGGCGTAACTGTTGTGCTAATTACTTGTACCTATCGAGGACAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    104 AATTTATTAGAGTTGGCTATTATGTAAATAATGAATATACTGAGACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100091 AATTTATTAGAGTTGGCTATTATGTAAATAATGAATATACTGAGACAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    154 TTAAGGGAAAATCCACCAGTAAAACCAGACTTTTCTAAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100141 TTAAGGGAAAATCCACCAGTAAAACCAGACTTTTCTAAGGTA...TAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195 TCAAAGGAATATTTTGGCATCTAATCCCAGGGTCACAAGATTCCACATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101755 TCAAAGGAATATTTTGGCATCTAATCCCAGGGTCACAAGATTCCACATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 ATTGGGAAGATAACACAGAAAAACTGGAAGATGCAGAGAGCAGTAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101805 ATTGGGAAGATAACACAGAAAAACTGGAAGATGCAGAGAGCAGTAATCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 AATCTACAGTCACTTCTTTCAACAGATGCATTACCTTCAGCATCAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101855 AATCTACAGTCACTTCTTTCAACAGATGCATTACCTTCAGCATCAAAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345 ATGGTCCACATCAGAAAACTCACTAAATGTCATGTTAGAATCCCACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101905 ATGGTCCACATCAGAAAACTCACTAAATGTCATGTTAGAATCCCACATGG

    400     .
    395 ACTGCATG
        ||||||||
 101955 ACTGCATG