seq1 = pF1KE0889.tfa, 966 bp
seq2 = pF1KE0889/gi568815589r_122377008.tfa (gi568815589r:122377008_122577926), 200919 bp

>pF1KE0889 966
>gi568815589r:122377008_122577926 (Chr9)

(complement)

1-966  (100001-100966)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCCTGAGAACCAGAGCAGCGTGTCCGAGTTCCTCCTCCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCCTGAGAACCAGAGCAGCGTGTCCGAGTTCCTCCTCCTGGGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCATCCGGCCAGAGCAGCAGGCCGTGTTCTTCGCCCTGTTCCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCATCCGGCCAGAGCAGCAGGCCGTGTTCTTCGCCCTGTTCCTGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGACCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATGCTGCTCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGACCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATGCTGCTCATCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTAGACTCTCACCTTCACACCCCCATGTACTTCTTCCTTAGCCACTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTAGACTCTCACCTTCACACCCCCATGTACTTCTTCCTTAGCCACTTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCACTGACATCTCCTTTTCATCTGTCACTGTCCCTAAGATGCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCACTGACATCTCCTTTTCATCTGTCACTGTCCCTAAGATGCTGATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACATGCAGACTCAGCACCTAGCCGTCTTTTACAAGGGATGCATTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACATGCAGACTCAGCACCTAGCCGTCTTTTACAAGGGATGCATTTCACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACATATTTTTTCATATTTTTTGCTGACTTAGACAGTTTCCTTATCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACATATTTTTTCATATTTTTTGCTGACTTAGACAGTTTCCTTATCACTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCATATGACAGGTATGTGGCCATCTGTCATCCTCTACATTATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCATATGACAGGTATGTGGCCATCTGTCATCCTCTACATTATGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATCATGACTCAGAGCCAGTGTGTCATGCTGGTGGCTGGGTCCTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATCATGACTCAGAGCCAGTGTGTCATGCTGGTGGCTGGGTCCTGGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCGCTTGTGCGTGTGCTCTTTTGCATACCCTCCTCCTGGCCCAGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCGCTTGTGCGTGTGCTCTTTTGCATACCCTCCTCCTGGCCCAGCTTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGCTGACCACATCATCCCTCACTACTTCTGTGACCTTGGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGCTGACCACATCATCCCTCACTACTTCTGTGACCTTGGTGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTCAAGTTGTCCTGCTCAGACACCTCCCTCAATCAGTTAGCAATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTCAAGTTGTCCTGCTCAGACACCTCCCTCAATCAGTTAGCAATCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACAGCAGCATTGACAGCCATTATGCTTCCATTCCTGTGCATCCTGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACAGCAGCATTGACAGCCATTATGCTTCCATTCCTGTGCATCCTGGTTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTATGGTCACATTGGGGTCACCATCCTCCAGATTCCCTCTACCAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTATGGTCACATTGGGGTCACCATCCTCCAGATTCCCTCTACCAAGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TATGCAAAGCCTTGTCCACTTGTGGATCCCACCTCTCAGTGGTGACTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TATGCAAAGCCTTGTCCACTTGTGGATCCCACCTCTCAGTGGTGACTATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATTATCGGACAATTATTGGTCTCTATTTTCTTCCCCCATCCAGCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATTATCGGACAATTATTGGTCTCTATTTTCTTCCCCCATCCAGCAACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAATGACAAGAACATAATTGCTTCAGTGATATACACAGCAGTCACTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAATGACAAGAACATAATTGCTTCAGTGATATACACAGCAGTCACTCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTGAACCCATTCATTTACAGTCTGAGAAATAAAGACATTAAGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTTGAACCCATTCATTTACAGTCTGAGAAATAAAGACATTAAGGGAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTAAGAAAACTCTTGAGTAGGTCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTAAGAAAACTCTTGAGTAGGTCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCT

    950     .    :    .
    951 CAACACTTTGGGAGGC
        ||||||||||||||||
 100951 CAACACTTTGGGAGGC