seq1 = pF1KE0887.tfa, 1053 bp
seq2 = pF1KE0887/gi568815581r_3026613.tfa (gi568815581r:3026613_3227665), 201053 bp

>pF1KE0887 1053
>gi568815581r:3026613_3227665 (Chr17)

(complement)

1-1053  (100001-101053)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCAACCTCACACTAGAAGATCAACACTGGAATATTGCATAATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCAACCTCACACTAGAAGATCAACACTGGAATATTGCATAATTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGAGTTCACAATCCAGGGCTTACCAACGTCACCCAATTAACCCAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGAGTTCACAATCCAGGGCTTACCAACGTCACCCAATTAACCCAACTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTCCTACAGACAAATGGAGGGGAAAAATCTGACCAGCATCTCAGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTCCTACAGACAAATGGAGGGGAAAAATCTGACCAGCATCTCAGAATGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCTCCTGGGGTTCTCTGAGCAGCTGGAGGAGCAGAAGCCCCTCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCCTCCTGGGGTTCTCTGAGCAGCTGGAGGAGCAGAAGCCCCTCTTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCATTCCTGTTCATGTACTTGGTCACGGTGGCAGGCAACCTCCTCATCA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTCCTTCCTGTTCATGTACTTGGTCACGGTGGCAGGCAACCTCCTCATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCTAGTCATCATTACTGACACTCAACTCCATACCCCCATGTACTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTCTAGTCATCATTACTGACACTCAACTCCATACCCCCATGTACTTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTAGCCAACCTCTCCCTTGCAGATGCCTGCTTTGTGTCCACCACAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTAGCCAACCTCTCCCTTGCAGATGCCTGCTTTGTGTCCACCACAGTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAAGATGCTGGCAAACATACAGATCCAGAGTCAGGCCATCTCCTACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAAGATGCTGGCAAACATACAGATCCAGAGTCAGGCCATCTCCTACTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGTGTCTACTACAGTTGTATTTTTTCATGTTATTTGTGATGCTGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGTGTCTACTACAGTTGTATTTTTTCATGTTATTTGTGATGCTGGAGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCCTCTTGGCGGTCATGGCCTATGACTGCTACGTGGCCATATGCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCCTCTTGGCGGTCATGGCCTATGACTGCTACGTGGCCATATGCCACCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACTTCATTACATTCTGATCATGAGCCCTGGGCTCTGCATCTTCCTCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACTTCATTACATTCTGATCATGAGCCCTGGGCTCTGCATCTTCCTCGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGCATCCTGGATCATGAATGCCCTCCACTCCCTTCTACACACACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGCATCCTGGATCATGAATGCCCTCCACTCCCTTCTACACACACTTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGAACAGCCTGTCCTTCTGCGCAAACCATGAGATCCCACACTTCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGAACAGCCTGTCCTTCTGCGCAAACCATGAGATCCCACACTTCTTCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGACATCAATCCCCTCCTGAGTCTGTCCTGCACAGACCCCTTCACCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGACATCAATCCCCTCCTGAGTCTGTCCTGCACAGACCCCTTCACCAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCTGGTGATCTTCATCACTGGGGGTCTCACAGGACTCATTTGTGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCTGGTGATCTTCATCACTGGGGGTCTCACAGGACTCATTTGTGTGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGCCTGATTATCTCTTACACGAACGTTTTCTCGACCATCCTGAAGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGCCTGATTATCTCTTACACGAACGTTTTCTCGACCATCCTGAAGATCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATCAGCTCAGGGGAAGCGGAAAGCCTTTTCCACCTGCAGCTCTCATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATCAGCTCAGGGGAAGCGGAAAGCCTTTTCCACCTGCAGCTCTCATCTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGTGGTCTCTCTCTTCTTTGGGACTTCTTTTTGTGTTGATTTCAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCGTGGTCTCTCTCTTCTTTGGGACTTCTTTTTGTGTTGATTTCAGTTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCTCAACCCACTCGGCCCAGAAGGACACAGTTGCATCAGTGATGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCTCAACCCACTCGGCCCAGAAGGACACAGTTGCATCAGTGATGTACAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGTGGTAACTCCAATGTTGAATCCCTTTATCTACAGTTTGAGGAACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGTGGTAACTCCAATGTTGAATCCCTTTATCTACAGTTTGAGGAACCAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAATAAAGTCTTCCCTGAGAAAGTTAATCTGGGTTCGGAAAATTCATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAATAAAGTCTTCCCTGAGAAAGTTAATCTGGGTTCGGAAAATTCATTCC

   1050 
   1051 CCT
        |||
 101051 CCT