seq1 = pF1KE0885.tfa, 990 bp
seq2 = pF1KE0885/gi568815581r_2962672.tfa (gi568815581r:2962672_3163661), 200990 bp

>pF1KE0885 990
>gi568815581r:2962672_3163661 (Chr17)

(complement)

1-990  (100001-100990)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGGCACTTAATAAACATTTGTTGGTGTTAATGTTACAGAAAGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGGCACTTAATAAACATTTGTTGGTGTTAATGTTACAGAAAGTTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGAATGGATGGAGATAACCAGAGTGAGAACTCACAGTTCCTTCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGAATGGATGGAGATAACCAGAGTGAGAACTCACAGTTCCTTCTCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGATCTCAGAGAGTCCTGAGCAGCAGCAGATCCTGTTTTGGATGTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100101 GGATCTCAGAGAGTCCTGAGCAGCAGCGGATCCTGTTTTGGATGTTCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCATGTACCTGGTCACGGTGCTGGGAAATGTGCTCATCATCCTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCATGTACCTGGTCACGGTGCTGGGAAATGTGCTCATCATCCTGGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCTCTGATTCCCACCTGCACACCCCCATGTACTTCTTCCTGGCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCTCTGATTCCCACCTGCACACCCCCATGTACTTCTTCCTGGCCAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCCTTCACTGACCTCTTCTTTGTCACCAACACAATCCCCAAGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTCCTTCACTGACCTCTTCTTTGTCACCAACACAATCCCCAAGATGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGAACTTCCAGTCCCAGAACAAAGCCATCTCCTATGCAGGGTGTCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGAACTTCCAGTCCCAGAACAAAGCCATCTCCTATGCAGGGTGTCTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACAGCTCTACTTCCTGGTCTCCTTGGTGACCCTGGACAACCTCATCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACAGCTCTACTTCCTGGTCTCCTTGGTGACCCTGGACAACCTCATCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGTGATGGCGTATGATCGCTATGTGGCCACCTGCTGCCCCCTCCACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGTGATGGCGTATGATCGCTATGTGGCCACCTGCTGCCCCCTCCACTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCACAGCCATGAGCCCTGGGCTCTGTGTCTTGCTCCTCTCCTTGTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCACAGCCATGAGCCCTGGGCTCTGTGTCTTGCTCCTCTCCTTGTGTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGGCTGTCTGTTCTCTATGGCCTCCTCCTCACCTTCCTCCTGACCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGGCTGTCTGTTCTCTATGGCCTCCTCCTCACCTTCCTCCTGACCAGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGACCTTCTGTGGGCCTCGAGAGATCCACTACCTCTTCTGTGACATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGACCTTCTGTGGGCCTCGAGAGATCCACTACCTCTTCTGTGACATGTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCCTGCTGTGGCTGGCATGTTCCAACACCCACATCATTCACACAGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCCTGCTGTGGCTGGCATGTTCCAACACCCACATCATTCACACAGCGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GATTGCCACTGGCTGCTTCATCTTCCTCACCCCCTTAGGGTTCATGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GATTGCCACTGGCTGCTTCATCTTCCTCACCCCCTTAGGGTTCATGACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CATCCTATGTACGTATTGTCAGAACCATCCTTCAAATGCCCTCGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CATCCTATGTACGTATTGTCAGAACCATCCTTCAAATGCCCTCGGCCTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGAAATACAAAACCTTCTCTACCTGTGCCTCCCATTTGGGTGTGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGAAATACAAAACCTTCTCTACCTGTGCCTCCCATTTGGGTGTGGTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTCTTTTATGGGACGCTTGCTATGGTGTACCTGCAGCCCCTCCATACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTCTTTTATGGGACGCTTGCTATGGTGTACCTGCAGCCCCTCCATACCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACTCCATGAAGGACTCAGTAGCCACAGTGATGTATGCTGTGCTGACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACTCCATGAAGGACTCAGTAGCCACAGTGATGTATGCTGTGCTGACACCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATGATGAACCCTTTCATCTACAGCCTGAGGAACAAAGACATGCATGGGGC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATGATGAACCCTTTCATCTACAGGCTGAGGAACAAAGACATGCATGGGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCCGGGAAGAGTCCTATGGAGACCCTTTCAGAGGCCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TCCGGGAAGAGTCCTATGGAGACCCTTTCAGAGGCCTAAA