seq1 = pF1KE0884.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE0884/gi568815581r_2992061.tfa (gi568815581r:2992061_3192996), 200936 bp

>pF1KE0884 936
>gi568815581r:2992061_3192996 (Chr17)

(complement)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGGAGGCAACCAGAGTGAAGGTTCAGAGTTCCTTCTCCTGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGGAGGCAACCAGAGTGAAGGTTCAGAGTTCCTTCTCCTGGGGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCAGAGAGTCCTGAGCAGCAGCGGATCCTGTTTTGGATGTTCCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCAGAGAGTCCTGAGCAGCAGCGGATCCTGTTTTGGATGTTCCTGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGGTCACGGTGGTGGGAAATGTGCTCATCATCCTGGCCATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGGTCACGGTGGTGGGAAATGTGCTCATCATCCTGGCCATCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGATTCCCGCCTGCACACCCCCGTGTACTTCTTCCTGGCCAACCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGATTCCCGCCTGCACACCCCCGTGTACTTCTTCCTGGCCAACCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCACTGACCTCTTCTTTGTCACCAACACAATCCCCAAGATGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCACTGACCTCTTCTTTGTCACCAACACAATCCCCAAGATGCTGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTCCAGTCCCATAACAAAGCCATCTCCTATGCAGGGTGTCTGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTCCAGTCCCATAACAAAGCCATCTCCTATGCAGGGTGTCTGACACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTACTTCCTGGTCTCCTTGGTGGCCCTGGACAACCTCATCCTGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTACTTCCTGGTCTCCTTGGTGGCCCTGGACAACCTCATCCTGGCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCATATGACCGCTATGTGGCCATCTGCTGCCCCCTCCACTACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCATATGACCGCTATGTGGCCATCTGCTGCCCCCTCCACTACACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGCCATGAGCCCTAAGCTCTGTATCTTACTCCTTTCCTTGTGTTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGCCATGAGCCCTAAGCTCTGTATCTTACTCCTTTCCTTGTGTTGGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTATCCGTCCTCTATGGCCTCATACACACCCTCCTCATGACCAGAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTATCCGTCCTCTATGGCCTCATACACACCCTCCTCATGACCAGAGTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGGGTCACGAAAAATCCACTACATCTTCTGTGAGATGTATGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGGGTCACGAAAAATCCACTACATCTTCTGTGAGATGTATGTAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTGAGGATGGCATGTTCCAACATTCAGATTAATCACACAGTGCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTGAGGATGGCATGTTCCAACATTCAGATTAATCACACAGTGCTGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCACAGGCTGCTTCATCTTCCTCATTCCCTTTGGATTCGTGATCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCACAGGCTGCTTCATCTTCCTCATTCCCTTTGGATTCGTGATCATTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATGTGCTGATTATCAGAGCCATCCTCAGAATACCCTCAGTCTCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATGTGCTGATTATCAGAGCCATCCTCAGAATACCCTCAGTCTCTAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AATACAAAGCCTTCTCCACCTGTGCCTCCCATTTGGGTGCAGTCTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AATACAAAGCCTTCTCCACCTGTGCCTCCCATTTGGGTGCAGTCTCCCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGGACACTTTGTATGGTATACCTAAAGCCCCTCCATACCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGGACACTTTGTATGGTATACCTAAAGCCCCTCCATACCTACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGTGAAGGACTCAGTAGCCACAGTGATGTATGCTGTGGTGACACCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGTGAAGGACTCAGTAGCCACAGTGATGTATGCTGTGGTGACACCCATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAATCCCTTCATCTACAGCCTGAGGAACAAGGACATGCATGGGGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAATCCCTTCATCTACAGCCTGAGGAACAAGGACATGCATGGGGCTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GGAAGACTCCTAGATAAACACTTTAAGAGGCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGAAGACTCCTAGATAAACACTTTAAGAGGCTGACA