seq1 = pF1KE0882.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KE0882/gi568815589r_122528582.tfa (gi568815589r:122528582_122729535), 200954 bp

>pF1KE0882 954
>gi568815589r:122528582_122729535 (Chr9)

(complement)

1-954  (100001-100954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGAGCTTTGCCCCTAATGCTTCACACTCTCCGGTTTTTTTGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGAGCTTTGCCCCTAATGCTTCACACTCTCCGGTTTTTTTGCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGTTCTCGAGAGCTAACATCTCCTACACTCTCCTCTTCTTCCTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGTTCTCGAGAGCTAACATCTCCTACACTCTCCTCTTCTTCCTGTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCTATTTACCTGACCACCATACTGGGGAATGTGACACTGGTGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCTATTTACCTGACCACCATACTGGGGAATGTGACACTGGTGCTGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTCCTGGGACTCCAGACTGCACTCACCCATGTATTATCTGCTTCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCTCCTGGGACTCCAGACTGCACTCACCCATGTATTATCTGCTTCGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCTCTGTGATAGACATGGGGCTATCCACAGTTACACTGCCCCAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCTCTGTGATAGACATGGGGCTATCCACAGTTACACTGCCCCAGTTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCCATTTGGTCTCTCATTACCCAACCATTCCTGCTGCCCGCTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCCATTTGGTCTCTCATTACCCAACCATTCCTGCTGCCCGCTGCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCTCAGTTCTTTTTCTTCTATGCATTTGGGGTTACAGATACACTTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCTCAGTTCTTTTTCTTCTATGCATTTGGGGTTACAGATACACTTGTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCTGTCATGGCTCTGGATCGCTATGTGGCCATCTGTGACCCCCTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCTGTCATGGCTCTGGATCGCTATGTGGCCATCTGTGACCCCCTGCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGCTTTGGTAATGAATCACCAACGGTGTGCCTGCTTACTAGCCTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGCTTTGGTAATGAATCACCAACGGTGTGCCTGCTTACTAGCCTTGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGGGTGGTGTCCATACTGCACACCATGTTGCGTGTGGGACTCGTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGGGTGGTGTCCATACTGCACACCATGTTGCGTGTGGGACTCGTCCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTTTGCTGGACTGGGGATGCTGGGGGCAACGTTAACCTTCCTCACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTTTGCTGGACTGGGGATGCTGGGGGCAACGTTAACCTTCCTCACTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTTGTGACCACCGGCCACTTCTGCGAGCCTCTTGTTCTGACATACATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTTGTGACCACCGGCCACTTCTGCGAGCCTCTTGTTCTGACATACATTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATGAGCTGGCCATATTCTTTGAGGGTGGCTTCCTTATGCTGGGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATGAGCTGGCCATATTCTTTGAGGGTGGCTTCCTTATGCTGGGCCCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCCCTCATTGTACTCTCTTATGTCCGAATTGGGGCCGCTATTCTACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCCCTCATTGTACTCTCTTATGTCCGAATTGGGGCCGCTATTCTACGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCCTTCAGCTGCTGGTCGCCGCCGAGCAGTCTCCACCTGTGGATCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCCTTCAGCTGCTGGTCGCCGCCGAGCAGTCTCCACCTGTGGATCCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCACCATGGTTGGTTTCCTCTACGGCACCATCATTTGTGTCTACTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCACCATGGTTGGTTTCCTCTACGGCACCATCATTTGTGTCTACTTCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCCTCCCTTCCAGAACTCTCAGTATCAGGACATGGTGGCTTCAGTAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCCTCCCTTCCAGAACTCTCAGTATCAGGACATGGTGGCTTCAGTAATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATACTGCCATTACACCTTTGGCCAACCCATTTGTGTATAGCCTCCACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATACTGCCATTACACCTTTGGCCAACCCATTTGTGTATAGCCTCCACAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAGGATGTCAAGGGTGCACTCTGCAGGCTGCTTGAATGGGTGAAGGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGGATGTCAAGGGTGCACTCTGCAGGCTGCTTGAATGGGTGAAGGTAGA

    950 
    951 CCCC
        ||||
 100951 CCCC