seq1 = pF1KE0881.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE0881/gi568815581f_3097519.tfa (gi568815581f:3097519_3298445), 200927 bp

>pF1KE0881 927
>gi568815581f:3097519_3298445 (Chr17)

1-927  (100001-100927)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAAAGAAAATCAATCCTTTAACCTGGATTTTATTCTCCTGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAAAGAAAATCAATCCTTTAACCTGGATTTTATTCTCCTGGGAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACTAGTCAGCAAGAACAGAATAATGTCTTCTTTGTGATTTTTTTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACTAGTCAGCAAGAACAGAATAATGTCTTCTTTGTGATTTTTTTGTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTACCCCATCACACTGACTGGAAATCTGCTCATCATCTTGGCCATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTACCCCATCACACTGACTGGAAATCTGCTCATCATCTTGGCCATCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGACATTCGCCTTCACAACCCCATGTATTTTCTCCTTGCCAACCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTGACATTCGCCTTCACAACCCCATGTATTTTCTCCTTGCCAACCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTGGTTGACATCATCTTCTCATCCGTAACCATCCCTAAGGTGCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTGGTTGACATCATCTTCTCATCCGTAACCATCCCTAAGGTGCTGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCATCTCTTGGGCAGCAAGTTCATCTCCTTTGGGGGATGCCTAATGCAG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCATCTCTTGGGGAGCAAGTTCATCTCCTTTGGGGGATGCCTAATGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTATTTCATGATAGCCTTGGCCAAGGCAGACAGCTATACCTTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTATTTCATGATAGCCTTGGCCAAGGCAGACAGCTATACCTTGGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCATACGATCGAGCTGTGGCCATCAGCTGCCCACTTCATTACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCATACGATCGAGCTGTGGCCATCAGCTGCCCACTTCATTACACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAATTATGAGTCCACGGTCTTGTATCCTGCTTATTGCTGGGTCTTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAATTATGAGTCCACGGTCTTGTATCCTGCTTATTGCTGGGTCTTGGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTGGAAACACCAGTGCTCTCCCCCACACTCTGCTCACAGCTAGTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTGGAAACACCAGTGCTCTCCCCCACACTCTGCTCACAGCTAGTTTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGGCAACCAGGAAGTAGCCAATTTCTACTGTGACATTATGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGGCAACCAGGAAGTAGCCAATTTCTACTGTGACATTATGCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTGAAGTTGTCCTGTTCTGACGTCCACTTTAATGTGAAGATGATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTGAAGTTGTCCTGTTCTGACGTCCACTTTAATGTGAAGATGATGTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTAGGGGTCGGCGTTTTCTCTTTGCCATTACTATGCATCATTGTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTAGGGGTCGGCGTTTTCTCTTTGCCATTACTATGCATCATTGTCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTTCAGGTCTTTTCCACAGTCTTCCAAGTTCCATCTACCAAGAGTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTTCAGGTCTTTTCCACAGTCTTCCAAGTTCCATCTACCAAGAGTCTAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAAAGCCTTCTGCACCTGTGGCTCCCACCTCACAGTTGTTTTTTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAAAGCCTTCTGCACCTGTGGCTCCCACCTCACAGTTGTTTTTTTATAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGGTACAACGATGTGCATGTATTTCCGCCCTCTGACCAGTTACAGCCC
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGGTACAACGATGGGCATGTATTTCCGCCCTCTGACCAGTTACAGCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAAGATGCAGTGATAACTGTGATGTATGTGGCAGTGACCCCAGCATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAAAGATGCAGTGATAACTGTGATGTATGTGGCAGTGACCCCAGCATTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATCCTTTCATCTATAGTCTGAGAAATTGTGATATGAAGGCAGCCCTACAG
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100851 ATCCTTTCATCTATAGTCTGAGAAATTGGGATATGAAGGCAGCCCTACAG

    900     .    :    .    :    .
    901 AAACTCTTCAGCAAGAGAATCTCCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAACTCTTCAGCAAGAGAATCTCCTCA