seq1 = pF1KE0880.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE0880/gi568815581f_3115621.tfa (gi568815581f:3115621_3316547), 200927 bp

>pF1KE0880 927
>gi568815581f:3115621_3316547 (Chr17)

1-927  (100001-100927)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGGAAAATAACCAGTCCTCTACACTGGAATTCATCCTCCTGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGGAAAATAACCAGTCCTCTACACTGGAATTCATCCTCCTGGGAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACTGGTCAGCAGGAACAGGAAGATTTCTTCTACATCCTCTTCCTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100051 TACTGGTCAGCAGGAACAGGAAGATTTCTTCTACATCCTCTTCTTGTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTACCCCATCACATTGATTGGAAACCTGCTCATCGTCCTAGCCATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTACCCCATCACATTGATTGGAAACCTGCTCATCGTCCTAGCCATTTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGATGTTCGCCTTCACAACCCCATGTATTTTCTCCTTGCCAACCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGATGTTCGCCTTCACAACCCCATGTATTTTCTCCTTGCCAACCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTGGTTGACATCTTCTTCTCATCGGTAACCATCCCTAAGATGCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTGGTTGACATCTTCTTCTCATCGGTAACCATCCCTAAGATGCTGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCATCTCTTGGGCAGCAAATCCATCTCTTTTGGGGGATGCCTAACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCATCTCTTGGGCAGCAAATCCATCTCTTTTGGGGGATGCCTAACGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTATTTCATGATAGCCTTGGGTAACACAGACAGCTATATTTTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTATTTCATGATAGCCTTGGGTAACACAGACAGCTATATTTTGGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCATATGATCGAGCTGTGGCCATCAGCCGCCCACTTCACTACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCATATGATCGAGCTGTGGCCATCAGCCGCCCACTTCACTACACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAATTATGAGTCCACGGTCTTGTATCTGGCTTATTGCTGGGTCTTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAATTATGAGTCCACGGTCTTGTATCTGGCTTATTGCTGGGTCTTGGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTGGAAATGCCAATGCCCTCCCCCACACTCTGCTCACAGCTAGTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTGGAAATGCCAATGCCCTCCCCCACACTCTGCTCACAGCTAGTCTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGGCAACCAGGAAGTGGCCAACTTCTACTGTGACATTACCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGGCAACCAGGAAGTGGCCAACTTCTACTGTGACATTACCCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTGAAGTTATCCTGTTCTGACATCCACTTTCATGTGAAGATGATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTGAAGTTATCCTGTTCTGACATCCACTTTCATGTGAAGATGATGTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTAGGGGTTGGCATTTTCTCTGTGCCATTACTATGCATCATTGTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTAGGGGTTGGCATTTTCTCTGTGCCATTACTATGCATCATTGTCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TATTCGAGTCTTCTCCACAGTCTTCCAGGTTCCTTCCACCAAGGGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TATTCGAGTCTTCTCCACAGTCTTCCAGGTTCCTTCCACCAAGGGCGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAAGGCCTTCTCCACCTGTGGTTCCCACCTCACGGTTGTCTCTTTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAAGGCCTTCTCCACCTGTGGTTCCCACCTCACGGTTGTCTCTTTGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGGTACAGTCATGGGCACGTATTTCCGCCCTTTGACCAATTATAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGGTACAGTCATGGGCACGTATTTCCGCCCTTTGACCAATTATAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAAAGACGCAGTGATCACTGTAATGTACACGGCAGTGACCCCAATGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAAAGACGCAGTGATCACTGTAATGTACACGGCAGTGACCCCAATGTTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATTCTTTCATCTACAGTCTGAGAAATCGGGACATGAAGGCTGCCCTGCGG
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCCTTTCATCTACAGTCTGAGAAATCGGGACATGAAGGCTGCCCTGCGG

    900     .    :    .    :    .
    901 AAACTCTTCAACAAGAGAATCTCCTCG
        |||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAACTCTTCAACAAGAGAATCTCCTCG