seq1 = pF1KE0879.tfa, 924 bp
seq2 = pF1KE0879/gi568815575f_131444074.tfa (gi568815575f:131444074_131644997), 200924 bp

>pF1KE0879 924
>gi568815575f:131444074_131644997 (ChrX)

1-924  (100001-100924)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCATGGACAATGTCACAGCAGTGTTTCAGTTTCTCCTTATTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCATGGACAATGTCACAGCAGTGTTTCAGTTTCTCCTTATTGGCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCTAACTATCCTCAATGGAGAGACACGTTTTTCACATTAGTGCTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCTAACTATCCTCAATGGAGAGACACGTTTTTCACATTAGTGCTGATAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTACCTCAGCACATTGTTGGGGAATGGATTTATGATCTTTCTTATTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTACCTCAGCACATTGTTGGGGAATGGATTTATGATCTTTCTTATTCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGACCCCAACCTCCACACTCCAATCTACTTCTTCCTTAGTAACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGACCCCAACCTCCACACTCCAATCTACTTCTTCCTTAGTAACCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTCTTAGACCTTTGTTATGGAACAGCTTCCATGCCCCAGGCTTTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTCTTAGACCTTTGTTATGGAACAGCTTCCATGCCCCAGGCTTTGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTGTTTCTCTACCCATCCCTACCTCTCTTATCCCCGATGTTTGGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTGTTTCTCTACCCATCCCTACCTCTCTTATCCCCGATGTTTGGCTCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACGAGTGTCTCCTTGGCTTTGGCCACAGCAGAGTGCCTCCTACTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACGAGTGTCTCCTTGGCTTTGGCCACAGCAGAGTGCCTCCTACTGGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGCCTATGACCGTGTGGTTGCTATCAGCAATCCCCTGCGTTATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGCCTATGACCGTGTGGTTGCTATCAGCAATCCCCTGCGTTATTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGTTATGAATGGCCCAGTATGTGTCTGCTTGGTTGCTACCTCATGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGTTATGAATGGCCCAGTATGTGTCTGCTTGGTTGCTACCTCATGGGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACATCACTTGTGCTCACTGCCATGCTCATCCTATCCCTGAGGCTTCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACATCACTTGTGCTCACTGCCATGCTCATCCTATCCCTGAGGCTTCACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGTGGGGCTAATGTCATCAACCATTTTGCCTGTGAGATTCTCTCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGTGGGGCTAATGTCATCAACCATTTTGCCTGTGAGATTCTCTCCCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTAAGCTGACCTGTTCTGATACCAGCCTCAATGAATTTATGATCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTAAGCTGACCTGTTCTGATACCAGCCTCAATGAATTTATGATCCTCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCAGTATCTTCACCCTGCTGCTACCATTTGGGTTTGTTCTCCTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCAGTATCTTCACCCTGCTGCTACCATTTGGGTTTGTTCTCCTCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATACGAATTGCTATGGCTATCATAAGGATTCGCTCACTCCAGGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATACGAATTGCTATGGCTATCATAAGGATTCGCTCACTCCAGGGCAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAAGGCCTTTACCACATGTGGCTCTCACCTGACCGTGGTGACAATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAAGGCCTTTACCACATGTGGCTCTCACCTGACCGTGGTGACAATCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGGGTCAGCCATCTCCATGTATATGAAAACTCAGTCCAAGTCCTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGGGTCAGCCATCTCCATGTATATGAAAACTCAGTCCAAGTCCTACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGACCAGGACAAGTTTATCTCAGTGTTTTATGGAGCTTTGACACCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGACCAGGACAAGTTTATCTCAGTGTTTTATGGAGCTTTGACACCCATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAACCCCCTGATATATAGCCTGAGAAAAAAAGATGTTAAACGGGCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAACCCCCTGATATATAGCCTGAGAAAAAAAGATGTTAAACGGGCAATA

    900     .    :    .    :
    901 AGGAAAGTTATGTTGAAAAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||
 100901 AGGAAAGTTATGTTGAAAAGGACA