seq1 = pF1KE0876.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KE0876/gi568815589f_104594422.tfa (gi568815589f:104594422_104795459), 201038 bp

>pF1KE0876 1038
>gi568815589f:104594422_104795459 (Chr9)

1-1038  (100001-101038)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACAGATTTACAGATTTTGATGTATCAAACATTTCAATTTACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACAGATTTACAGATTTTGATGTATCAAACATTTCAATTTACCTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCATGTCCTTTTCTATACTACCCAGCAGGCAGGTGACCTAGAACACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCATGTCCTTTTCTATACTACCCAGCAGGCAGGTGACCTAGAACACATGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACAAGAAATTACTCTGCCATGACTGAATTCTTTCTGGTGGGGCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACAAGAAATTACTCTGCCATGACTGAATTCTTTCTGGTGGGGCTTTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAATATCCAGAGCTCCAGCTTTTTCTGTTCCTGCTCTGCCTCATCATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAATATCCAGAGCTCCAGCTTTTTCTGTTCCTGCTCTGCCTCATCATGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGATAATCCTCCTGGGAAATAGCCTCCTCATTATCATCACCATCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGATAATCCTCCTGGGAAATAGCCTCCTCATTATCATCACCATCTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTCTCGCCTCCATACTCCCATGTATTTCTTTCTTGGAAACCTCTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTCTCGCCTCCATACTCCCATGTATTTCTTTCTTGGAAACCTCTCATTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGGACATCTGTTACACATCCTCATCCATTCCTCCAATGCTTATTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGGACATCTGTTACACATCCTCATCCATTCCTCCAATGCTTATTATATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATGTCTGAGAGAAAATCCATCTCCTTCATTGGCTGTGCTCTGCAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TATGTCTGAGAGAAAATCCATCTCCTTCATTGGCTGTGCTCTGCAGATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGTGTCCCTTGGCTTGGGCTCCACTGAGTGTGTCCTCCTGGCTGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGTGTCCCTTGGCTTGGGCTCCACTGAGTGTGTCCTCCTGGCTGTGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCTATGACCACTATGTGGCCATCTGCAACCCACTGAGGTACTCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCTATGACCACTATGTGGCCATCTGCAACCCACTGAGGTACTCCATCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATGAACGGAGTGCTGTATGTGCAAATGGCTGCATGGTCCTGGATCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATGAACGGAGTGCTGTATGTGCAAATGGCTGCATGGTCCTGGATCATAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTGTCTGACCTCCCTATTGCAAACAGTTCTGACAATGATGTTGCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTGTCTGACCTCCCTATTGCAAACAGTTCTGACAATGATGTTGCCTTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGTGGGAATAATGTCATTGATCATATTACCTGTGAAATTTTGGCCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGTGGGAATAATGTCATTGATCATATTACCTGTGAAATTTTGGCCCTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAAACTTGTTTGTTCAGATATCACCATCAATGTGCTTATCATGACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAAACTTGTTTGTTCAGATATCACCATCAATGTGCTTATCATGACAGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAAATATTGTTTCACTGGTGATTCTTCTACTGTTAATTTTCATCTCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAAATATTGTTTCACTGGTGATTCTTCTACTGTTAATTTTCATCTCCTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGTTTATTCTCTCTTCCATCCTGAGAATTAATTGTGCTGAGGGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGTTTATTCTCTCTTCCATCCTGAGAATTAATTGTGCTGAGGGAAGAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAAAGCCTTCTCTACCTGTTCAGCGCACTCGATTGTGGTCATCTTATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAAAGCCTTCTCTACCTGTTCAGCGCACTCGATTGTGGTCATCTTATTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACGGTTCAGCCCTTTTTATGTACATGAAACCCAAGTCAAAGAACACTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACGGTTCAGCCCTTTTTATGTACATGAAACCCAAGTCAAAGAACACTAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACATCTGATGAGATTATTGGGCTGTCTTATGGAGTGGTAAGCCCAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACATCTGATGAGATTATTGGGCTGTCTTATGGAGTGGTAAGCCCAATGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AAATCCCATCATCTATAGCCTCAGGAATAAAGAGGTCAAAGAGGCTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AAATCCCATCATCTATAGCCTCAGGAATAAAGAGGTCAAAGAGGCTGTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 AGAAAGTCCTGAGCAGACATCTGCATTTATTGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGAAAGTCCTGAGCAGACATCTGCATTTATTGAAAATG