seq1 = pF1KE0874.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KE0874/gi568815589r_104504674.tfa (gi568815589r:104504674_104705627), 200954 bp

>pF1KE0874 954
>gi568815589r:104504674_104705627 (Chr9)

(complement)

1-954  (100001-100954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATGGGAAAACCACACCATTCTGGTGGAATTTTTTCTGAAGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATGGGAAAACCACACCATTCTGGTGGAATTTTTTCTGAAGGGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCTGGTCACCCAAGACTTGAGTTACTCTTTTTTGTGCTCATCTTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCTGGTCACCCAAGACTTGAGTTACTCTTTTTTGTGCTCATCTTCATAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTATGTGGTCATCCTTCTGGGGAATGGTACTCTCATTTTAATCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTATGTGGTCATCCTTCTGGGGAATGGTACTCTCATTTTAATCAGCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGACCCTCACCTTCACACCCCTATGTACTTCTTTCTGGGGAACCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGACCCTCACCTTCACACCCCTATGTACTTCTTTCTGGGGAACCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCTTGGACATCTGCTACACCACCACCTCTATTCCCTCCACGCTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCTTGGACATCTGCTACACCACCACCTCTATTCCCTCCACGCTAGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCCTTTCAGAAAGAAAGACCATTTCCCTTTCTGGCTGTGCAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTCCTTTCAGAAAGAAAGACCATTTCCCTTTCTGGCTGTGCAGTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTTCCTCGGCTTGGCCATGGGGACAACAGAGTGTGTGCTTCTGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTTCCTCGGCTTGGCCATGGGGACAACAGAGTGTGTGCTTCTGGGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTTTGACCGCTATGTGGCTATCTGCAACCCTCTGAGATATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTTTGACCGCTATGTGGCTATCTGCAACCCTCTGAGATATCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCATGAGTAAGGATGCCTATGTACCCATGGCAGCTGGGTCCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCATGAGTAAGGATGCCTATGTACCCATGGCAGCTGGGTCCTGGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATAGGAGCTGTCAATTCTGCAGTACAATCAGTGTTTGTGGTACAATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATAGGAGCTGTCAATTCTGCAGTACAATCAGTGTTTGTGGTACAATTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGCAGGAATAACATCATCAATCATTTCACCTGTGAAATTCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGCAGGAATAACATCATCAATCATTTCACCTGTGAAATTCTGGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATGAAACTGGCCTGTGCTGACATCTCAGACAATGAGTTCATCATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATGAAACTGGCCTGTGCTGACATCTCAGACAATGAGTTCATCATGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGGCCACAACATTGTTCATATTGACACCTTTGTTATTAATCATTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGGCCACAACATTGTTCATATTGACACCTTTGTTATTAATCATTGTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTACACGTTAATCATTGTGAGCATCTTCAAAATTAGCTCTTCCGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTACACGTTAATCATTGTGAGCATCTTCAAAATTAGCTCTTCCGAGGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAAGCAAAGCTTCCTCTACCTGTTCAGCCCATCTGACTGTGGTCATAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAAGCAAAGCTTCCTCTACCTGTTCAGCCCATCTGACTGTGGTCATAATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGGACCATCCTCTTCATGTACATGAAGCCCAAGTCTAAAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGGACCATCCTCTTCATGTACATGAAGCCCAAGTCTAAAGAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACTTAATTCGGATGACTTGGATGCTACCGACAAAATTATATCCATGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACTTAATTCGGATGACTTGGATGCTACCGACAAAATTATATCCATGTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGGGGTGATGACTCCCATGATGAATCCTTTAATCTACAGTCTTAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGGGGTGATGACTCCCATGATGAATCCTTTAATCTACAGTCTTAGAAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAGGATGTGAAAGAGGCAGTAAAACACCTACTGAACAGAAGGTTCTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGGATGTGAAAGAGGCAGTAAAACACCTACTGAACAGAAGGTTCTTTAG

    950 
    951 CAAG
        ||||
 100951 CAAG