seq1 = pF1KE0863.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KE0863/gi568815586f_55536892.tfa (gi568815586f:55536892_55737830), 200939 bp

>pF1KE0863 939
>gi568815586f:55536892_55737830 (Chr12)

1-939  (100001-100939)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGGGGAAAACCATACTACACTGCCTGAATTCCTCCTTCTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGGGGAAAACCATACTACACTGCCTGAATTCCTCCTTCTGGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTGACCTCAAGGCCCTGCAGGGCCCCCTGTTCTGGGTGGTGCTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTGACCTCAAGGCCCTGCAGGGCCCCCTGTTCTGGGTGGTGCTTCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACCTGGTCACCTTGCTGGGTAACTCCCTGATCATCCTCCTCACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACCTGGTCACCTTGCTGGGTAACTCCCTGATCATCCTCCTCACACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAGCCCTGCCCTGCACTCCCCCATGTACTTCTTCCTGCGCCAACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCAGCCCTGCCCTGCACTCCCCCATGTACTTCTTCCTGCGCCAACTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTGGTGGAGCTCTTCTACACCACTGACATCGTGCCCAGGACCCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGTGGTGGAGCTCTTCTACACCACTGACATCGTGCCCAGGACCCTGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCTGGGCTCCCTGCATCCCCAGGCCATCTCTTTCCAGGGCTGTGCAGCC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCTGGGCTCCCCGCATCCCCAGGCCATCTCTTTCCAGGGCTGTGCAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGATGTACGTCTTCATTGTCCTGGGCATCTCGGAGTGCTGCCTGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGATGTACGTCTTCATTGTCCTGGGCATCTCGGAGTGCTGCCTGCTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCATGGCCTATGACCGATATGTTGCCATCTGCCAGCCCCTACGCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCATGGCCTATGACCGATATGTTGCCATCTGCCAGCCCCTACGCTATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCACCCTCTTGAGCCCACGGGCCTGCATGGCCATGGTGGGTACCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCACCCTCTTGAGCCCACGGGCCTGCATGGCCATGGTGGGTACCTCCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCACAGGCATCATCACGGCCACCACCCATGCCTCCCTCATCTTCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCACAGGCATCATCACGGCCACCACCCATGCCTCCCTCATCTTCTCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACCTTTTCGCAGCCACCCGATCATCCCGCACTTTCTCTGTGACATCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACCTTTTCGCAGCCACCCGATCATCCCGCACTTTCTCTGTGACATCCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGTACTGAGGCTGGCAAGTGCTGGGAAGCACAGGAGCGAGATCTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100551 CAGTACTGAGGCTGGCAAGTGCTGGGAAGCACAGGAGCGAGATCTCCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGACAGCCACCATAGTCTTCATTATGATCCCCTTCTCTCTGATTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGACAGCCACCATAGTCTTCATTATGATCCCCTTCTCTCTGATTGTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCTTACATCCGCATCCTGGGTGCCATCCTAGCAATGGCCTCCACCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCTTACATCCGCATCCTGGGTGCCATCCTAGCAATGGCCTCCACCCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCCGCCGCAAGGTCTTCTCCACCTGCTCCTCCCATCTGCTCGTGGTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCCGCCGCAAGGTCTTCTCCACCTGCTCCTCCCATCTGCTCGTGGTCTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCTTCTTTGGAACAGCCAGCATCACCTACATCCGGCCGCAGGCAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCTTCTTTGGAACAGCCAGCATCACCTACATCCGGCCGCAGGCAGGCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCTGTTACCACAGACCGCGTCCTCAGTCTCTTCTACACAGTCATCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTCTGTTACCACAGACCGCGTCCTCAGTCTCTTCTACACAGTCATCACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCATGCTCAACCCCATCATCTACACCCTTCGGAACAAGGACGTGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCATGCTCAACCCCATCATCTACACCCTTCGGAACAAGGACGTGAGGAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GCCCTGCGACACTTGGTGAAGAGGCAGCGCCCCTCACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCCTGCGACACTTGGTGAAGAGGCAGCGCCCCTCACCC