seq1 = pF1KE0860.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE0860/gi568815597r_159435081.tfa (gi568815597r:159435081_159636007), 200927 bp

>pF1KE0860 927
>gi568815597r:159435081_159636007 (Chr1)

(complement)

1-927  (100001-100927)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAGAAAGAACTTCACAGAAGTGTCAGAATTCATTTTCTTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAGAAAGAACTTCACAGAAGTGTCAGAATTCATTTTCTTGGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCTAGCTTTGGAAAGCATCAGATAACCCTCTTTGTGGTTTTCCTAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCTAGCTTTGGAAAGCATCAGATAACCCTCTTTGTGGTTTTCCTAACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACATTTTAACTCTGGTTGCTAACATCATCATTGTGACTATCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACATTTTAACTCTGGTTGCTAACATCATCATTGTGACTATCATCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGACCATCATCTCCACACTCCCATGTATTTCTTCCTAAGCATGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTGACCATCATCTCCACACTCCCATGTATTTCTTCCTAAGCATGCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAGTTCAGAGACGGTGTACACACTGGTCATTGTGCCACGAATGCTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAGTTCAGAGACGGTGTACACACTGGTCATTGTGCCACGAATGCTTTTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTCATTTTTCATAACCAACCTATCTCCTTGGCAGGCTGTGCTACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTCATTTTTCATAACCAACCTATCTCCTTGGCAGGCTGTGCTACACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTTCTTTTTTGTTATCTTGGCCACTAATAATTGCTTCCTGCTTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTTCTTTTTTGTTATCTTGGCCACTAATAATTGCTTCCTGCTTACTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGGGTATGACCGCTATGTGGCCATCTGCAGACCCCTGAGATACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGGGTATGACCGCTATGTGGCCATCTGCAGACCCCTGAGATACACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCATGAGCAAGGGACTATGTGCCCAGCTGGTGTGTGGGTCCTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCATGAGCAAGGGACTATGTGCCCAGCTGGTGTGTGGGTCCTTTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTGGTCTGACTATGGCAGTTCTCCATGTGACAGCCATGTTCAATTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTGGTCTGACTATGGCAGTTCTCCATGTGACAGCCATGTTCAATTTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTCTGTGGCACAGTGGTAGACCACTTCTTTTGTGACATTTACCCAGTCA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTTCTGTGGCACAGTGGTAGACCACTTCTTTTGTGACATTTACCCAGTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAAACTTTCTTGCATTGATACCACTATCAATGAGATAATAAATTATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGAAACTTTCTTGCATTGATACCACTATCAATGAGATAATAAATTATGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTAAGTTCATTTGTGATTTTTGTGCCCATAGGCCTGATATTTATCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTAAGTTCATTTGTGATTTTTGTGCCCATAGGCCTGATATTTATCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTCCTTGTCATCTCTTCCATCCTTCAAATTGCCTCAGCTGAGGGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTCCTTGTCATCTCTTCCATCCTTCAAATTGCCTCAGCTGAGGGCCGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGAAGACCTTTGCCACCTGTGTCTCCCACCTCACTGTGGTTATTGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGAAGACCTTTGCCACCTGTGTCTCCCACCTCACTGTGGTTATTGTCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGTGGCTGTGCCTCCATTGCCTACCTCAAGCCGAAGTCAGAAAGTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGTGGCTGTGCCTCCATTGCCTACCTCAAGCCGAAGTCAGAAAGTTCAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGAAAAAGACCTTGTTCTCTCAGTGACGTACACCATCATCACTCCCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGAAAAAGACCTTGTTCTCTCAGTGACGTACACCATCATCACTCCCTTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAACCCTGTTGTTTACAGTCTGAGAAACAAGGAGGTAAAGGATGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAACCCTGTTGTTTACAGTCTGAGAAACAAGGAGGTAAAGGATGCCCTA

    900     .    :    .    :    .
    901 TGCAGAGTTGTGGGCAGAAATATTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGCAGAGTTGTGGGCAGAAATATTTCT