seq1 = pF1KE0858.tfa, 945 bp
seq2 = pF1KE0858/gi568815579f_15694049.tfa (gi568815579f:15694049_15894993), 200945 bp

>pF1KE0858 945
>gi568815579f:15694049_15894993 (Chr19)

1-945  (100001-100945)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGGGCTAAACCACACCTCCGTGTCTGAATTCATCCTCGTTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGGGCTAAACCACACCTCCGTGTCTGAATTCATCCTCGTTGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTGCCTTCCCCCACCTCCAGCTGATGCTCTTCCTGCTGTTCCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTGCCTTCCCCCACCTCCAGCTGATGCTCTTCCTGCTGTTCCTGCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGTTCACGCTGCTGGGCAACCTGCTCATCATGGCCACTGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGTTCACGCTGCTGGGCAACCTGCTCATCATGGCCACTGTCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCGAGCGCAGCCTCCACATGCCCATGTACCTCTTCCTGTGTGCCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCGAGCGCAGCCTCCACATGCCCATGTACCTCTTCCTGTGTGCCCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATCACCGAGATCCTCTACACCGTGGCCATCATCCCGCGCATGCTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATCACCGAGATCCTCTACACCGTGGCCATCATCCCGCGCATGCTGGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTGCTGTCCACCCAGCGCTCCATCGCCTTCCTGGCCTGTGCCAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTGCTGTCCACCCAGCGCTCCATCGCCTTCCTGGCCTGTGCCAGTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTTCTTCTCCTTCAGCTTCGGCTTCACCCACTCCTTCCTGCTCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTTCTTCTCCTTCAGCTTCGGCTTCACCCACTCCTTCCTGCTCACTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGGCTACGACCGCTACGTGGCCATCTGCCACCCCCTGCGTTACAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGGCTACGACCGCTACGTGGCCATCTGCCACCCCCTGCGTTACAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTCATGAGCCTGCGGGGCTGCACCTGCCGGGTGGGCTGCTCCTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTCATGAGCCTGCGGGGCTGCACCTGCCGGGTGGGCTGCTCCTGGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGTGGCTTGGTCATGGGGATGGTGGTGACATCGGCCATTTTCCACCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100451 GGTGGCTTGGTCATGGGGATGGTGGTGACCTCGGCCATTTTCCACCTCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGGACACAAGGAGATCCACCATTTCTTCTGCCACGTGCCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGGACACAAGGAGATCCACCATTTCTTCTGCCACGTGCCACCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTTGAAGTTGGCCTGTGGAGATGATGTGCTGGTGGTGGCCAAAGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTTGAAGTTGGCCTGTGGAGATGATGTGCTGGTGGTGGCCAAAGGCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCTTGGTGTGTATCACGGCCCTGCTGGGCTGTTTTCTCCTCATCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCTTGGTGTGTATCACGGCCCTGCTGGGCTGTTTTCTCCTCATCCTCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCCTATGCCTTCATCGTGGCCGCCATCTTGAAGATCCCTTCTGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCCTATGCCTTCATCGTGGCCGCCATCTTGAAGATCCCTTCTGCTGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTCGGAACAAGGCCTTCTCCACCTGTGCCTCTCACCTCACTGTGGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTCGGAACAAGGCCTTCTCCACCTGTGCCTCTCACCTCACTGTGGTGGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGCACTATGGCTTTGCCTCCGTCATTTACCTGAAGCCCAAAGGTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGCACTATGGCTTTGCCTCCGTCATTTACCTGAAGCCCAAAGGTCCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTCTCCGGAAGGAGACACCTTGATGGGCATCACCTACACGGTCCTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTCTCCGGAAGGAGACACCTTGATGGGCATCACCTACACGGTCCTCACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTTCCTCAGCCCCATCATCTTCAGCCTCAGGAACAAGGAGCTGAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTTCCTCAGCCCCATCATCTTCAGCCTCAGGAACAAGGAGCTGAAGGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 GCCATGAAGAAGACTTGCTTCACCAAACTCTTTCCACAGAACTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCATGAAGAAGACTTGCTTCACCAAACTCTTTCCACAGAACTGC