seq1 = pF1KE0856.tfa, 948 bp
seq2 = pF1KE0856/gi568815579f_15641393.tfa (gi568815579f:15641393_15842340), 200948 bp

>pF1KE0856 948
>gi568815579f:15641393_15842340 (Chr19)

1-948  (100001-100948)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGGTCAGAACTACAGCACCATATCTGAATTTATCCTCTCTGGCTT
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGGTCAGAACTACAGAACCATATCTGAATTTATCCTCTCTGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGCCTTCCCCCAGCAGCTCCTGCCTGTCTTGTTCCTGCTGTACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAGCCTTCCCCCAGCAGCTCCTGCCTGTCTTGTTCCTGCTGTACCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATGTTCCTGTTCACATTGCTTGGCAACCTTCTTATCATGGCCACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGATGTTCCTGTTCACATTGCTTGGCAACCTTCTTATCATGGCCACAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGATTGAACGCAGACTCCACACACCCATGTACCTCTTCTTGTGTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGATTGAACGCAGACTCCACACACCCATGTACCTCTTCTTGTGTGCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCATCTCTGAGATTCTGTTCACTGTTGCCATCACCCCTCGCATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCATCTCTGAGATTCTGTTCACTGTTGCCATCACCCCTCGCATGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGATCTGCTCTTCACCCATCGTTCCATCACCTTTGTGGCTTGTGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGATCTGCTCTTCACCCATCGTTCCATCACCTTTGTGGCTTGTGCCATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGATGTTCTTCTCCTTCATGTTTGGCTTCACTCACTCCTTCCTTCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGATGTTCTTCTCCTTCATGTTTGGCTTCACTCACTCCTTCCTTCTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTCATGGGCTATGATCACTACGTGACCATCTGCCACCCACTGCATTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTCATGGGCTATGATCACTACGTGACCATCTGCCACCCACTGCATTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACATGCTAATGAGTCCCCGTGGCTGTGCCCATCTTGTGGCCTGGACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACATGCTAATGAGTCCCCGTGGCTGTGCCCATCTTGTGGCCTGGACCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGGTGGCTCGGTCATGGGGATGATGGTGACAATGATGGTTTTTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTGGTGGCTCGGTCATGGGGATGATGGTGACAATGATGGTTTTTCACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACTTTCTGTGGGTCTAATGTGATCCACCATTTTCTCTGTCATGTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACTTTCTGTGGGTCTAATGTGATCCACCATTTTCTCTGTCATGTGCTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCTCTTGAAGTTGGCCTGTGGGAGCAAGACATCATCTGTCATCATGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCTCTTGAAGTTGGCCTGTGGGAGCAAGACATCATCTGTCATCATGGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGATGCTGGTGTGTGTCACAGCCCTGATAGGCTGTTTGTTCCTCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGATGCTGGTGTGTGTCACAGCCCTGATAGGCTGTTTGTTCCTCATCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTCTCCTTTGTCTTCATTATGGCTGCCATCTTGAGGATTCCTTCTGCTG
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTCTCCTTTGTCTTCATTGTGGCTGCCATCTTGAGGATTCCTTCTGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGGCCGGCACAAGACTTTCTCCACTTGTGTATCCCACCTCACTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGGCCGGCACAAGACTTTCTCCACTTGTGTATCCCACCTCACTGTGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTCATGCACTATAGTTTTGCCTCCCTTATCTACCTCAAACCCAAGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTCATGCACTATAGTTTTGCCTCCCTTATCTACCTCAAACCCAAGGGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCATTCTATGTACAGTGATGCCTTGATGGCCACCACCTATACTGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCATTCTATGTACAGTGATGCCTTGATGGCCACCACCTATACTGTCTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCCCTTCCTCAGCCCAATCATTTTCAGTCTAAGGAACAAGGAGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCCCTTCCTCAGCCCAATCATTTTCAGTCTAAGGAACAAGGAGCTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 AATGCCATAAATAAAAACTTTTGCAGAAGGTTCTGCCCTCTAAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AATGCCATAAATAAAAACTTTTGCAGAAGGTTCTGCCCTCTAAGCTCC