seq1 = pF1KE0854.tfa, 996 bp
seq2 = pF1KE0854/gi568815587r_123894166.tfa (gi568815587r:123894166_124095161), 200996 bp

>pF1KE0854 996
>gi568815587r:123894166_124095161 (Chr11)

(complement)

1-996  (100001-100996)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTAGAGGGTGTTGAGCATCTCCTTCTGCTACTTCTTTTGACAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTAGAGGGTGTTGAGCATCTCCTTCTGCTACTTCTTTTGACAGATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACAGCAAGGAACTGCAAAGTGGAAACCAGACTTCTGTGTCTCACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACAGCAAGGAACTGCAAAGTGGAAACCAGACTTCTGTGTCTCACTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTTGGTGGGCCTGCACCACCCACCACAGCTGGGAGCGCCACTCTTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTTGGTGGGCCTGCACCACCCACCACAGCTGGGAGCGCCACTCTTCTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTTTCCTTGTCATCTATCTCCTCACTGTTTCTGGAAATGGGCTCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTTTCCTTGTCATCTATCTCCTCACTGTTTCTGGAAATGGGCTCATCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCACTGTCTTAGTGGACATCCGGCTCCATCGTCCCATGTGCTTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCACTGTCTTAGTGGACATCCGGCTCCATCGTCCCATGTGCTTGTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTGTCACCTCTCCTTCTTGGACATGACCATTTCTTGTGCTATTGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTGTCACCTCTCCTTCTTGGACATGACCATTTCTTGTGCTATTGTCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGATGCTGGCTGGCTTTCTCTTGGGTAGTAGGATTATCTCCTTTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGATGCTGGCTGGCTTTCTCTTGGGTAGTAGGATTATCTCCTTTGGGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGTGTAATCCAACTATTTTCTTTCCATTTCCTGGGCTGTACTGAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGTGTAATCCAACTATTTTCTTTCCATTTCCTGGGCTGTACTGAGTGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCTTTACACACTCATGGCTTATGACCGTTTCCTTGCCATTTGTAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCTTTACACACTCATGGCTTATGACCGTTTCCTTGCCATTTGTAAGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTACACTATGCTACCATCATGACCCACAGAGTCTGTAACTCCCTGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTACACTATGCTACCATCATGACCCACAGAGTCTGTAACTCCCTGGCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGCACCTGGCTGGGAGGGACTATCCATTCACTTTTCCAAACAAGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGCACCTGGCTGGGAGGGACTATCCATTCACTTTTCCAAACAAGTTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TATTCCGGCTGCCCTTCTGTGGCCCCAATCGGGTCGACTACATCTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TATTCCGGCTGCCCTTCTGTGGCCCCAATCGGGTCGACTACATCTTCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACATTCCTGCCATGCTGCGTCTAGCCTGCGCCGATACGGCCATCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACATTCCTGCCATGCTGCGTCTAGCCTGCGCCGATACGGCCATCAACGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTGGTCACCTTTGCAGACATTGGCTTCCTGGCCCTCACCTGCTTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTGGTCACCTTTGCAGACATTGGCTTCCTGGCCCTCACCTGCTTCATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCATCCTCACTTCCTATGGCTATATTGTAGCTGCCATCCTGCGAATTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCATCCTCACTTCCTATGGCTATATTGTAGCTGCCATCCTGCGAATTCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCAGCAGATGGGCGCCGCAATGCCTTCTCCACGTGTGCTGCCCACCTCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100751 TCAGCAGATGGGCGCCGCAATGCCTTCTCCACTTGTGCTGCCCACCTCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGTTGTCATTGTTTACTATGTGCCCTGCACCTTCATTTACCTGCGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGTTGTCATTGTTTACTATGTGCCCTGCACCTTCATTTACCTGCGGCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTTCACAGGAGCCCCTGGATGGGGTGGTAGCTGTCTTTTACACTGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTTCACAGGAGCCCCTGGATGGGGTGGTAGCTGTCTTTTACACTGTCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACTCCCTTGCTTAACTCCATTATCTACACACTGTGCAACAAAGAAATGAA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACTCCCTTGCTTAACTCCATCATCTACACACTGTGCAACAAAGAAATGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    951 GGCAGCATTACAGAGGCTAGGGGGCCACAAGGAAGTGCAGCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGCAGCATTACAGAGGCTAGGGGGCCACAAGGAAGTGCAGCCTCAC