seq1 = pF1KE0849.tfa, 948 bp
seq2 = pF1KE0849/gi568815586f_55121025.tfa (gi568815586f:55121025_55321972), 200948 bp

>pF1KE0849 948
>gi568815586f:55121025_55321972 (Chr12)

1-948  (100001-100948)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCTGTGAAAATCACACCAGAGTCACTGAATTTATTCTTCTTGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCTGTGAAAATCACACCAGAGTCACTGAATTTATTCTTCTTGGTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACAAACAACCCCGAGATGCAAGTTTCCCTCTTTATTTTTTTCCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACAAACAACCCCGAGATGCAAGTTTCCCTCTTTATTTTTTTCCTGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTATACAGTCACTTTGTTGGGCAACTTTCTTATTGTCACAGTTACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTATACAGTCACTTTGTTGGGCAACTTTCTTATTGTCACAGTTACCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGATCTCGCACTTCAAACACCCATGTACTTCTTTCTTCAAAATCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGATCTCGCACTTCAAACACCCATGTACTTCTTTCTTCAAAATCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTTCTTGAAGTATGTTTCACCTTGGTTATGGTGCCAAAAATGCTTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTTCTTGAAGTATGTTTCACCTTGGTTATGGTGCCAAAAATGCTTGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCTAGTGTCCCCAAGGAAAATTATCTCTTTTGTGGGCTGTGGTACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCTAGTGTCCCCAAGGAAAATTATCTCTTTTGTGGGCTGTGGTACCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTACTTCTTCTTCTTCTTTGGCAGTTCTGAATGTTTCCTTCTCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTACTTCTTCTTCTTCTTTGGCAGTTCTGAATGTTTCCTTCTCTCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCTTATGATCGCTTTGTGGCCATCTGTAACCCTCTCCATTATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCTTATGATCGCTTTGTGGCCATCTGTAACCCTCTCCATTATTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATAATGAACAGGTCCCTATGCTTGTGGATGGCCATAGGCTCTTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATAATGAACAGGTCCCTATGCTTGTGGATGGCCATAGGCTCTTGGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCGGTGTTCCTGTGTCTATGCTACAGACAGCTTGGATGATGGCCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCGGTGTTCCTGTGTCTATGCTACAGACAGCTTGGATGATGGCCCTTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGTGGACCAAATGCCGTGGACCACTTTTTCTGTGATGGTCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGTGGACCAAATGCCGTGGACCACTTTTTCTGTGATGGTCCCCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTTAAAACTAGTCACAGTGGATACAACCATGTATGAAATGCAAGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTTAAAACTAGTCACAGTGGATACAACCATGTATGAAATGCAAGCACTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCTCCACACTCCTGTTTATCATGTTTCCCTTTTGTCTCATTTTGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCTCCACACTCCTGTTTATCATGTTTCCCTTTTGTCTCATTTTGGTTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACACCCGCATTATCATAACAATTCTGAGGATGTCCTCTGCCACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACACCCGCATTATCATAACAATTCTGAGGATGTCCTCTGCCACTGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCCAGAAGGCATTTTCTACTTGTTCCTCACACCTCATTGTGGTGTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCCAGAAGGCATTTTCTACTTGTTCCTCACACCTCATTGTGGTGTCCCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTACGGAACAGCCAGTCTGACCTACCTGCGGCCCAAATCAAACCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTACGGAACAGCCAGTCTGACCTACCTGCGGCCCAAATCAAACCAGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCCTGAGAGCAAGAAGCTAGTGTCATTGTCCTACACTGTCATCACACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCCTGAGAGCAAGAAGCTAGTGTCATTGTCCTACACTGTCATCACACCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTAAACCCCATCATCTACGGCCTGAGGAACAATGAAGTGAAAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTAAACCCCATCATCTACGGCCTGAGGAACAATGAAGTGAAAGGGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 GTCAAGAGGACAATCACTCAAAAAGTCTTACAGAAGTTAGATGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTCAAGAGGACAATCACTCAAAAAGTCTTACAGAAGTTAGATGTGTTT