seq1 = pF1KE0848.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE0848/gi568815587r_7827721.tfa (gi568815587r:7827721_8028662), 200942 bp

>pF1KE0848 942
>gi568815587r:7827721_8028662 (Chr11)

(complement)

1-942  (100001-100942)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAGACAAAATCAAAGCTGTGTGGTTGAATTCATCCTCTTGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAGACAAAATCAAAGCTGTGTGGTTGAATTCATCCTCTTGGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCTAACTATCCTGAGCTCCAGGGGCAGCTCTTTGTGGCTTTCCTGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCTAACTATCCTGAGCTCCAGGGGCAGCTCTTTGTGGCTTTCCTGGTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTATCTGGTGACCCTGATAGGAAATGCCATTATTATAGTCATCGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTATCTGGTGACCCTGATAGGAAATGCCATTATTATAGTCATCGTCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTAGACCAGAGCCTCCACGTTCCCATGTACCTGTTTCTCCTGAACTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTAGACCAGAGCCTCCACGTTCCCATGTACCTGTTTCTCCTGAACTTATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGGTGGACCTGAGTTTCAGTGCAGTTATTATGCCTGAAATGCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTGGTGGACCTGAGTTTCAGTGCAGTTATTATGCCTGAAATGCTGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCTCTCTACTGAAAAAACTACAATTTCTTTTGGGGGCTGTTTTGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCTCTCTACTGAAAAAACTACAATTTCTTTTGGGGGCTGTTTTGCACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTATTTCATCCTTCTTTTTGGTGGGGCTGAATGTTTTCTTCTGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100301 ATGTATTTCATCCTTCTTTTTGGTGGGGCTGAATGTTTTCTTCTGGGAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCTTATGACCGATTTGCTGCAATTTGCCATCCTCTCAACTACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCTTATGACCGATTTGCTGCAATTTGCCATCCTCTCAACTACCAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATTATGAATAAAGGAGGTTTTATGAAATTAATTATATTTTCATGGGCC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGATTATGAATAAAGGAGTTTTTATGAAATTAATTATATTTTCATGGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTAGGTTTTATGTTAGGTACTGTTCAAACATCATGGGTATCTAGTTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTAGGTTTTATGTTAGGTACTGTTCAAACATCATGGGTATCTAGTTTTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTTTGTGGCCTTAATGAAATTAACCATATATCTTGTGAAACCCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTTTGTGGCCTTAATGAAATTAACCATATATCTTGTGAAACCCCAGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTTAGAACTTGCATGTGCAGACACGTTTTTGTTTGAAATCTATGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTTAGAACTTGCATGTGCAGACACGTTTTTGTTTGAAATCTATGCATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACAGGCACCTTTTTGATTATTTTGGTTCCTTTCTTGTTGATACTCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACAGGCACCTTTTTGATTATTTTGGTTCCTTTCTTGTTGATACTCTTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTACATTCGAGTTCTGTTTGCCATCCTGAAGATGCCATCAACCACTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTACATTCGAGTTCTGTTTGCCATCCTGAAGATGCCATCAACCACTGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GACAAAAGGCCTTTTCCACCTGTGCCGCTCACCTCACATCTGTGACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GACAAAAGGCCTTTTCCACCTGTGCCGCTCACCTCACATCTGTGACCCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGCACAGCCAGTATGACTTATTTACAACCCAAATCTGGCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGCACAGCCAGTATGACTTATTTACAACCCAAATCTGGCTACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACCGGAAACCAAGAAAGTGATGTCATTGTCTTACTCACTTCTGACACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACCGGAAACCAAGAAAGTGATGTCATTGTCTTACTCACTTCTGACACCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAATCCGCTTATCTACAGTTTGCGAAATAGTGAGATGAAGAGGGCT
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAATCTGCTTATCTACAGTTTGCGAAATAGTGAGATGAAGAGGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTGATGAAATTATGGCGAAGGCGAGTGGTTTTACACACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTGATGAAATTATGGCGAAGGCGAGTGGTTTTACACACAATC