seq1 = pF1KE0843.tfa, 1059 bp
seq2 = pF1KE0843/gi568815579r_57355428.tfa (gi568815579r:57355428_57556486), 201059 bp

>pF1KE0843 1059
>gi568815579r:57355428_57556486 (Chr19)

(complement)

1-1059  (100001-101059)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTGGAGACACATTAAAACTTCTGTCTCCACTGATGACAAGATACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTGGAGACACATTAAAACTTCTGTCTCCACTGATGACAAGATACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTCTGCTTTTTTATTCTACTGATTCTTCAGACCTCAATGAAAATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTCTGCTTTTTTATTCTACTGATTCTTCAGACCTCAATGAAAATCAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCCCCTAGATTTTGATGAAATGGCTTTTGGAAAAGTAAAATCAGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCCCCTAGATTTTGATGAAATGGCTTTTGGAAAAGTAAAATCAGGGATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTTCCTCATTCAGACTGGAGTTGGGATCCTGGGAAATTCCTTTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTTCCTCATTCAGACTGGAGTTGGGATCCTGGGAAATTCCTTTCTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTGTTTTTATAACTTAATTTTGTTCACTGGACACAAGCTGAGACCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTGTTTTTATAACTTAATTTTGTTCACTGGACACAAGCTGAGACCCACGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTGATTCTCAGCCAACTGGCCTTGGCTAACTCCATGGTCCTTTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTGATTCTCAGCCAACTGGCCTTGGCTAACTCCATGGTCCTTTTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAGGGATACCTCAGACAATGGCAGCTTTTGGATTGAAATATTTGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAGGGATACCTCAGACAATGGCAGCTTTTGGATTGAAATATTTGCTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGACACTGGATGTAAGTTTGTCTTTTATTATCACAGGGTGGGCACAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGACACTGGATGTAAGTTTGTCTTTTATTATCACAGGGTGGGCACAAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTTCCCTCAGCACCATCTGCCTTCTCAATGGATTCCAAGCCATTAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTTCCCTCAGCACCATCTGCCTTCTCAATGGATTCCAAGCCATTAAGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACCCCAGTATATGCAGGTGGATGGAGATCAAGATTAGATCCCCAAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACCCCAGTATATGCAGGTGGATGGAGATCAAGATTAGATCCCCAAGGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATTGACTTCTGTTGTCTCCTCTGCTGGGCCCCCCATGTCTTGATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TATTGACTTCTGTTGTCTCCTCTGCTGGGCCCCCCATGTCTTGATGAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CATCTGTTCTTCTATTAGTGAATGGCCCACTGAATAGCAAAAACAGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CATCTGTTCTTCTATTAGTGAATGGCCCACTGAATAGCAAAAACAGTAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCAAAAAACAATTATGGATACTGTTCTTACAAAGCATCAAAGAGATTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCAAAAAACAATTATGGATACTGTTCTTACAAAGCATCAAAGAGATTTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCATTACATGCAGTCTTATATTTTTCCCCTGATTTTATGAGTTTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCATTACATGCAGTCTTATATTTTTCCCCTGATTTTATGAGTTTGGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCATGGTCTGGGCCAGTGGCTCCATGGTCTTCTTCCTCTACAGACACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCATGGTCTGGGCCAGTGGCTCCATGGTCTTCTTCCTCTACAGACACAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGCAAGTCCAACACAATCACAGCAACAGACTCTCCTGCAGACCTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGCAAGTCCAACACAATCACAGCAACAGACTCTCCTGCAGACCTTCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAAGCCAGAGCCACACACACCATCATGGTCCTGGTGAGCTCCTTTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAAGCCAGAGCCACACACACCATCATGGTCCTGGTGAGCTCCTTTTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTTTCTATTCAGTCCATAGTTTTCTGACAATTTGGACAACTGTAGTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTTTCTATTCAGTCCATAGTTTTCTGACAATTTGGACAACTGTAGTTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACCCAGGCCAGTGGATAGTGACCAACTCTGTGTTGGTCGCCTCATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACCCAGGCCAGTGGATAGTGACCAACTCTGTGTTGGTCGCCTCATGTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCCAGCACGCAGCCCTTTTGTCCTCATCATGAGTGATACTCATATCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCCAGCACGCAGCCCTTTTGTCCTCATCATGAGTGATACTCATATCTCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGTTCTGTTTTGCCTGCAGGACAAGGAAAACACTCTTTCCTAATCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGTTCTGTTTTGCCTGCAGGACAAGGAAAACACTCTTTCCTAATCTGGTT

   1050     .
   1051 GTCATGCCA
        |||||||||
 101051 GTCATGCCA